转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 72 / 143 下载 TSV

上一页 72 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005532 Chr01 NC_080387.1:72167192-72167203promoter 内 2348-2359 bp - 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 72168845-72171381(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAG
SmilChr06G003276 Chr06 NC_080392.1:45347965-45347976promoter 内 2233-2244 bp - 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 45341977-45346208(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAC
SmilChr07G000928 Chr07 NC_080393.1:6620513-6620524promoter 内 2164-2175 bp + 1826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 6622350-6624231(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAT
SmilChr02G002257 Chr02 NC_080388.1:40004217-40004228promoter 内 2159-2170 bp - 1831 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 40006059-40006637(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTG
SmilChr05G000905 Chr05 NC_080391.1:7165633-7165644promoter 内 2108-2119 bp + 1882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7167526-7169075(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATCCAGCTGTG
SmilChr01G005989 Chr01 NC_080387.1:75501737-75501748promoter 内 2050-2061 bp + 1940 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 75503688-75506182(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGAC
SmilChr05G000968 Chr05 NC_080391.1:7810217-7810228promoter 内 1920-1931 bp + 2070 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7812298-7813413(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATCCAGCTGTG
SmilChr01G005560 Chr01 NC_080387.1:72416040-72416051promoter 内 1892-1903 bp - 2098 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 72410811-72413942(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCAT
SmilChr02G000610 Chr02 NC_080388.1:8916347-8916358promoter 内 1869-1880 bp + 2121 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8918479-8918931(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAT
SmilChr06G003184 Chr06 NC_080392.1:44745886-44745897promoter 内 1778-1789 bp + 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 44748109-44750281(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATCCAGCTGTG
SmilChr02G000694 Chr02 NC_080388.1:11030482-11030493promoter 内 1542-1553 bp - 2448 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 11032941-11043944(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCCC
SmilChr08G002906 Chr08 NC_080394.1:29018674-29018685promoter 内 1540-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 29021135-29026195(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTG
SmilChr03G002071 Chr03 NC_080389.1:31603619-31603630promoter 内 1530-1541 bp - 2460 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 31606090-31607582(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCTT
SmilChr07G000927 Chr07 NC_080393.1:6620513-6620524promoter 内 1513-1524 bp + 2477 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 6613962-6618036(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAT
SmilChr08G002610 Chr08 NC_080394.1:25471425-25471436promoter 内 1404-1415 bp - 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 25465970-25468839(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCAA
SmilChr05G002077 Chr05 NC_080391.1:21704872-21704883promoter 内 1211-1222 bp + 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 21707662-21709732(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTG
SmilChr04G001067 Chr04 NC_080390.1:15275207-15275218promoter 内 1138-1149 bp + 2852 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 15278070-15289778(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGC
SmilChr04G000043 Chr04 NC_080390.1:409943-409954promoter 内 1108-1119 bp - 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 412836-414785(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAT
SmilChr01G005443 Chr01 NC_080387.1:71525148-71525159promoter 内 1039-1050 bp - 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 71528110-71529022(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCCC
SmilChr05G002335 Chr05 NC_080391.1:25246686-25246697promoter 内 956-967 bp - 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 25249731-25289071(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAT
SmilChr02G004355 Chr02 NC_080388.1:65824471-65824482promoter 内 939-950 bp - 3051 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 65827533-65838754(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCGC
SmilChr04G003446 Chr04 NC_080390.1:50979453-50979464promoter 内 832-843 bp + 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 50971642-50976295(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCCA
SmilChr03G000513 Chr03 NC_080389.1:5515091-5515102promoter 内 752-763 bp - 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 5518340-5526519(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCTA
SmilChr04G001489 Chr04 NC_080390.1:24341355-24341366promoter 内 752-763 bp - 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 24336566-24338117(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCAA
SmilChr07G001650 Chr07 NC_080393.1:13954979-13954990promoter 内 752-763 bp + 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 13958228-13959771(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCAA
SmilChr08G000174 Chr08 NC_080394.1:1185296-1185307promoter 内 705-716 bp + 3285 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1188592-1197568(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGAC
SmilChr07G001004 Chr07 NC_080393.1:7311949-7311960promoter 内 686-697 bp - 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7315264-7319318(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAAG
SmilChr01G001669 Chr01 NC_080387.1:30782457-30782468promoter 内 635-646 bp - 3355 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 30785823-30786764(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCCG
SmilChr05G002317 Chr05 NC_080391.1:24996657-24996668promoter 内 607-618 bp + 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 24991817-24993274(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCCC
SmilChr05G000536 Chr05 NC_080391.1:4115826-4115837promoter 内 437-448 bp + 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 4109259-4112273(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTG
SmilChr08G001107 Chr08 NC_080394.1:8586773-8586784promoter 内 391-402 bp - 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8590383-8594571(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTA
SmilChr04G001815 Chr04 NC_080390.1:29642140-29642151promoter 内 316-327 bp - 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 29645825-29649899(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCGC
SmilChr01G005440 Chr01 NC_080387.1:71525148-71525159promoter 内 287-298 bp - 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 71519011-71521445(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGC
SmilChr08G000043 Chr08 NC_080394.1:291272-291283promoter 内 118-129 bp - 3872 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 285804-287400(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGC
SmilChr02G004013 Chr02 NC_080388.1:62443644-62443655promoter 内 21-32 bp + 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 62438878-62439675(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTG
SmilChr08G002611 Chr08 NC_080394.1:25471425-25471436promoter 内 10-21 bp - 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 25475416-25477608(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCGT
SmilChr07G002357 Chr07 NC_080393.1:21901642-21901653promoter 内 482-493 bp + 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 5 21905161-21911188(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr06G001625 Chr06 NC_080392.1:18105786-18105797promoter 内 3521-3532 bp - 469 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 18106266-18109855(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCCA
SmilChr07G003657 Chr07 NC_080393.1:43594163-43594174promoter 内 3374-3385 bp - 616 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 43592526-43593547(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTA
SmilChr04G000418 Chr04 NC_080390.1:4416445-4416456promoter 内 2632-2643 bp + 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 4417814-4419641(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTA
SmilChr07G001566 Chr07 NC_080393.1:12888232-12888243promoter 内 997-1008 bp + 2993 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 12874773-12885239(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGG
SmilChr07G002356 Chr07 NC_080393.1:21901642-21901653promoter 内 974-985 bp + 3016 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 21895116-21898626(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr05G002919 Chr05 NC_080391.1:35144797-35144808promoter 内 189-200 bp - 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 35148609-35152114(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATC
SmilChr03G001835 Chr03 NC_080389.1:25181085-25181096promoter 内 3844-3855 bp - 146 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 25179806-25180939(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr07G001270 Chr07 NC_080393.1:9757680-9757691promoter 内 3693-3704 bp + 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 9757988-9759086(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTA
SmilChr01G003840 Chr01 NC_080387.1:56744011-56744022promoter 内 3603-3614 bp + 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 56744409-56745452(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTA
SmilChr07G002360 Chr07 NC_080393.1:21923486-21923497promoter 内 3603-3614 bp - 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 21922056-21923099(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTA
SmilChr03G004512 Chr03 NC_080389.1:63192578-63192589promoter 内 3595-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 63189498-63192183(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTA
SmilChr06G000010 Chr06 NC_080392.1:197152-197163promoter 内 3534-3545 bp - 456 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 197619-197691(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTT
SmilChr04G002908 Chr04 NC_080390.1:45337204-45337215promoter 内 3258-3269 bp - 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 45331954-45336472(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTT