转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G002534; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003982-RA_Salv SmilChr02G002534 TCP XP_057797741.1 MP00169 GTTGGGACCACA

可能结合的靶基因

7295 个结合位点 6498 个候选靶基因 第 73 / 130 下载 TSV

上一页 73 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G000531 Chr07 NC_080393.1:3685080-3685091promoter 内 1271-1282 bp + 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 3687810-3689693(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTCTGGACCACC
SmilChr06G001717 Chr06 NC_080392.1:19786921-19786932promoter 内 1270-1281 bp - 2720 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 19781952-19784201(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTTGGACCACA
SmilChr07G000638 Chr07 NC_080393.1:4297988-4297999promoter 内 1196-1207 bp + 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 4300793-4302837(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTTGGACCACA
SmilChr06G002094 Chr06 NC_080392.1:27867138-27867149promoter 内 1184-1195 bp - 2806 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 27862462-27864332(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATTGGGACCAGC
SmilChr08G003159 Chr08 NC_080394.1:32136138-32136149promoter 内 1158-1169 bp + 2832 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 32138981-32141823(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTCTGGACCACC
SmilChr05G002369 Chr05 NC_080391.1:25883669-25883680promoter 内 1150-1161 bp + 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 25871383-25880829(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCAGAG
SmilChr05G003159 Chr05 NC_080391.1:40356442-40356453promoter 内 1117-1128 bp - 2873 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 40359326-40362872(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TCTGGTCCCCTC
SmilChr05G003866 Chr05 NC_080391.1:52261203-52261214promoter 内 1096-1107 bp - 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 52264108-52269980(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCAAAT
SmilChr03G000035 Chr03 NC_080389.1:441858-441869promoter 内 1091-1102 bp - 2899 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 438117-438959(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GCCTGGACCACA
SmilChr08G003475 Chr08 NC_080394.1:37366213-37366224promoter 内 1068-1079 bp + 2922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 37369146-37370785(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGGACCAGA
SmilChr06G001042 Chr06 NC_080392.1:10300129-10300140promoter 内 1007-1018 bp + 2983 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10303123-10303196(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GATGGGACCAAC
SmilChr04G000844 Chr04 NC_080390.1:10682151-10682162promoter 内 958-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10677677-10679119(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTCGGGACCAGC
SmilChr02G004961 Chr02 NC_080388.1:71537621-71537632promoter 内 943-954 bp - 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 71540679-71542055(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCAAAT
SmilChr01G001457 Chr01 NC_080387.1:28265696-28265707promoter 内 919-930 bp + 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 28268778-28269917(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TATGGGACCGCT
SmilChr07G000410 Chr07 NC_080393.1:2839165-2839176promoter 内 908-919 bp - 3082 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2833609-2836083(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTGCGGACCACT
SmilChr08G004737 Chr08 NC_080394.1:56784335-56784346promoter 内 896-907 bp + 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 56770043-56781241(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TCTGGTCCCACC
SmilChr04G001661 Chr04 NC_080390.1:27585283-27585294promoter 内 877-888 bp - 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 27588407-27589223(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCGAGT
SmilChr07G001903 Chr07 NC_080393.1:16435370-16435381promoter 内 877-888 bp + 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 16438494-16441039(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GAGTGGACCACA
SmilChr06G002420 Chr06 NC_080392.1:34943499-34943510promoter 内 853-864 bp - 3137 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 34934909-34940362(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ACTCGGACCACC
SmilChr05G003898 Chr05 NC_080391.1:52739042-52739053promoter 内 848-859 bp - 3142 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 52742195-52747940(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCAAAT
SmilChr04G003019 Chr04 NC_080390.1:46605494-46605505promoter 内 792-803 bp + 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 46601435-46602296(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACTC
SmilChr05G000329 Chr05 NC_080391.1:2461488-2461499promoter 内 754-765 bp + 3236 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2447409-2458252(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 AGTGGTCCGCAG
SmilChr05G000064 Chr05 NC_080391.1:309051-309062promoter 内 665-676 bp + 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 312387-314742(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTGCGGACCACT
SmilChr01G005232 Chr01 NC_080387.1:69900336-69900347promoter 内 627-638 bp - 3363 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 69903710-69910234(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCAGAG
SmilChr02G000591 Chr02 NC_080388.1:8462480-8462491promoter 内 626-637 bp + 3364 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 8465855-8466898(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GCTGGGACCAAA
SmilChr01G006159 Chr01 NC_080387.1:77007562-77007573promoter 内 593-604 bp - 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 77003151-77004165(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTCTGGACCACC
SmilChr06G001409 Chr06 NC_080392.1:14765738-14765749promoter 内 581-592 bp + 3409 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 14769158-14777035(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATTTGGACCACC
SmilChr02G000408 Chr02 NC_080388.1:5046477-5046488promoter 内 493-504 bp - 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 5049985-5053905(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCAAAT
SmilChr07G002153 Chr07 NC_080393.1:19721724-19721735promoter 内 478-489 bp - 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 19718141-19718212(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GCGGGGACCATA
SmilChr06G002152 Chr06 NC_080392.1:29262114-29262125promoter 内 450-461 bp + 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 29265665-29268740(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ACTGGGACCGCG
SmilChr03G004328 Chr03 NC_080389.1:61642062-61642073promoter 内 371-382 bp - 3619 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 61634316-61638443(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTTGGACCACA
SmilChr05G003884 Chr05 NC_080391.1:52604157-52604168promoter 内 321-332 bp + 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 52598222-52600488(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCACTC
SmilChr03G001288 Chr03 NC_080389.1:15099027-15099038promoter 内 207-218 bp - 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 15089338-15095244(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTCGGGACCAAT
SmilChr07G001808 Chr07 NC_080393.1:15478977-15478988promoter 内 191-202 bp + 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 15473538-15475178(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTTGGTCCCATC
SmilChr07G000151 Chr07 NC_080393.1:901948-901959promoter 内 189-200 bp - 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 895682-898147(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTCTGGACCACC
SmilChr04G003075 Chr04 NC_080390.1:47347656-47347667promoter 内 179-190 bp - 3811 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 47351478-47354351(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GCTGGTCCCGAG
SmilChr02G000392 Chr02 NC_080388.1:4867874-4867885promoter 内 104-115 bp + 3886 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 4860053-4863988(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCAAAT
SmilChr03G003714 Chr03 NC_080389.1:56087792-56087803promoter 内 70-81 bp - 3920 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 56083801-56083872(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ACTCGGACCACC
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SmilChr05G000706 Chr05 NC_080391.1:5328349-5328360promoter 内 3668-3679 bp - 322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 5324874-5328027(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CGTCGGACCACC
SmilChr08G000419 Chr08 NC_080394.1:2983293-2983304promoter 内 3386-3397 bp + 604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 2983908-2985474(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTGGGGACCAAG
SmilChr08G000418 Chr08 NC_080394.1:2981010-2981021promoter 内 3041-3052 bp + 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 2978055-2980061(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTTGGTCCCCAC
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SmilChr04G000491 Chr04 NC_080390.1:5339375-5339386promoter 内 3344-3355 bp - 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 5340032-5340947(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CTTGGTCCCCAC
SmilChr08G003687 Chr08 NC_080394.1:41184390-41184401promoter 内 3293-3304 bp + 697 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 41179035-41183693(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GATGGTCCCACC
SmilChr03G004318 Chr03 NC_080389.1:61541972-61541983promoter 内 3183-3194 bp + 807 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 61531805-61541165(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCGCGG
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