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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 73 / 134 下载 TSV

上一页 73 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000540 Chr03 NC_080389.1:5866529-5866543promoter 内 2762-2776 bp + 1225 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5867768-5915015(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGATAAAATGATTAC
SmilChr03G001437 Chr03 NC_080389.1:17055805-17055819promoter 内 2756-2770 bp - 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 17050990-17054574(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCATGCAATGATTAA
SmilChr02G001493 Chr02 NC_080388.1:27881963-27881977promoter 内 2741-2755 bp + 1246 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 27883223-27885551(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTAATAATGATAAC
SmilChr01G000493 Chr01 NC_080387.1:10048401-10048415promoter 内 2718-2732 bp + 1269 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10046263-10047132(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
SmilChr01G005086 Chr01 NC_080387.1:68730260-68730274promoter 内 2668-2682 bp - 1319 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 68727698-68728941(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAGAGTAATGATGTT
SmilChr03G000974 Chr03 NC_080389.1:11030396-11030410promoter 内 2665-2679 bp + 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 11031732-11056910(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAT
SmilChr01G005780 Chr01 NC_080387.1:73911573-73911587promoter 内 2641-2655 bp - 1346 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 73906457-73910227(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTATACAATGATTAT
SmilChr02G003753 Chr02 NC_080388.1:59172159-59172173promoter 内 2558-2572 bp + 1429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 59167246-59170730(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAATTTA
SmilChr02G001085 Chr02 NC_080388.1:19447959-19447973promoter 内 2553-2567 bp + 1434 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 19444271-19446525(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
SmilChr02G001626 Chr02 NC_080388.1:30182512-30182526promoter 内 2472-2486 bp + 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 30184041-30185653(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAAGTAATAATTAC
SmilChr02G000418 Chr02 NC_080388.1:5312611-5312625promoter 内 2417-2431 bp + 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5314195-5315689(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTGTATAATGATGAA
SmilChr01G005140 Chr01 NC_080387.1:69172640-69172654promoter 内 2414-2428 bp - 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 69174227-69175474(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTAATTGT
SmilChr01G003889 Chr01 NC_080387.1:57203351-57203365promoter 内 2403-2417 bp + 1584 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 57204949-57209344(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGCAATAATGATTGG
SmilChr02G002570 Chr02 NC_080388.1:44713715-44713729promoter 内 2277-2291 bp + 1710 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 44715439-44715512(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAT
SmilChr01G000747 Chr01 NC_080387.1:16549557-16549571promoter 内 2276-2290 bp - 1711 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16551282-16555327(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTTATCATTACCCTT
SmilChr02G003754 Chr02 NC_080388.1:59172159-59172173promoter 内 2256-2270 bp + 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 59173904-59174722(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAATTAATGATTAT
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SmilChr01G005393 Chr01 NC_080387.1:71207165-71207179promoter 内 2192-2206 bp + 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 71208974-71214212(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCCCTAATGATGAC
SmilChr03G001288 Chr03 NC_080389.1:15097044-15097058promoter 内 2187-2201 bp - 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 15089338-15095244(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAT
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SmilChr03G001155 Chr03 NC_080389.1:13341310-13341324promoter 内 2126-2140 bp + 1861 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 13337352-13339449(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACCATCATTAGCAGT
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SmilChr02G002008 Chr02 NC_080388.1:36224378-36224392promoter 内 2035-2049 bp + 1952 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 36216486-36222426(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATTCGA
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SmilChr03G000279 Chr03 NC_080389.1:3175710-3175724promoter 内 1970-1984 bp + 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 3171369-3173693(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
SmilChr03G003347 Chr03 NC_080389.1:51785684-51785698promoter 内 1967-1981 bp + 2020 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 51787718-51798385(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAT
SmilChr02G000060 Chr02 NC_080388.1:775669-775683promoter 内 1962-1976 bp + 2025 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 772169-773644(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
SmilChr02G000822 Chr02 NC_080388.1:13851342-13851356promoter 内 1955-1969 bp + 2032 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 13837220-13849310(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
SmilChr02G003389 Chr02 NC_080388.1:55017360-55017374promoter 内 1885-1899 bp - 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 55011354-55015258(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATATTAATGATTAA
SmilChr03G001427 Chr03 NC_080389.1:16903900-16903914promoter 内 1875-1889 bp + 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16906026-16907941(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAT
SmilChr01G001007 Chr01 NC_080387.1:21188771-21188785promoter 内 1812-1826 bp - 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 21190960-21191082(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
SmilChr02G003461 Chr02 NC_080388.1:55899089-55899103promoter 内 1773-1787 bp + 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 55901317-55907160(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAT
SmilChr03G001378 Chr03 NC_080389.1:16310265-16310279promoter 内 1767-1781 bp - 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16307235-16308045(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAGATTAATGATGAG
SmilChr02G001156 Chr02 NC_080388.1:21111718-21111732promoter 内 1763-1777 bp - 2224 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 21105216-21109494(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAT
SmilChr01G003949 Chr01 NC_080387.1:57872473-57872487promoter 内 1738-1752 bp - 2249 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 57874736-57878256(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
SmilChr03G001258 Chr03 NC_080389.1:14499589-14499603promoter 内 1590-1604 bp + 2397 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 14493913-14497192(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
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SmilChr01G006184 Chr01 NC_080387.1:77354007-77354021promoter 内 1309-1323 bp - 2678 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 77356699-77357470(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
SmilChr02G004652 Chr02 NC_080388.1:68958129-68958143promoter 内 1289-1303 bp + 2698 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 68954898-68955431(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
SmilChr01G006183 Chr01 NC_080387.1:77354007-77354021promoter 内 1273-1287 bp - 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 77347535-77351293(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAT
SmilChr03G003220 Chr03 NC_080389.1:49838121-49838135promoter 内 1151-1165 bp - 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 49833183-49835285(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGTAGAAATGATTGC
SmilChr01G002126 Chr01 NC_080387.1:37259474-37259488promoter 内 1128-1142 bp + 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 37252822-37256615(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTATAAAA
SmilChr03G001633 Chr03 NC_080389.1:21026160-21026174promoter 内 1087-1101 bp - 2900 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 21022167-21023260(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGTATAATGATTGG
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SmilChr03G003056 Chr03 NC_080389.1:47451978-47451992promoter 内 1012-1026 bp + 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 47454967-47455613(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAT
SmilChr02G001679 Chr02 NC_080388.1:31022531-31022545promoter 内 978-992 bp + 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 31017863-31019522(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTAGATTA
SmilChr03G001866 Chr03 NC_080389.1:25804767-25804781promoter 内 919-933 bp + 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 25807849-25821464(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTGATAATGATTGG
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SmilChr02G001183 Chr02 NC_080388.1:21737094-21737108promoter 内 873-887 bp - 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 21740222-21749211(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACACTT
SmilChr02G004372 Chr02 NC_080388.1:66075521-66075535promoter 内 831-845 bp - 3156 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 66071276-66072365(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTGTAATGATAAT