Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G006187; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027306-RA_Salv SmilChr01G006187 GRAS XP_057798078.1 MP00611 AAGAAAAAGACAAAAAAAAA

可能结合的靶基因

9807 个结合位点 6232 个候选靶基因 第 75 / 125 下载 TSV

上一页 75 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004533 Chr02 NC_080388.1:67905701-67905720promoter 内 1436-1455 bp + 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 67898323-67903155(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTGTTTCTTCGTT
SmilChr01G005373 Chr01 NC_080387.1:70954148-70954167promoter 内 1360-1379 bp + 2622 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 70956789-70962209(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGCAAAATGAGAAAAAAAAA
SmilChr03G000251 Chr03 NC_080389.1:2977690-2977709promoter 内 1257-1276 bp - 2725 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 2963739-2974965(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGGGTGGCGACAAAAATAAA
SmilChr02G004653 Chr02 NC_080388.1:68964351-68964370promoter 内 1237-1256 bp - 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 68959571-68961606(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAAAAAAAAGAAGA
SmilChr02G004470 Chr02 NC_080388.1:67100131-67100150promoter 内 1236-1255 bp - 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 67102896-67102977(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr01G000051 Chr01 NC_080387.1:827542-827561promoter 内 1232-1251 bp - 2750 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 823676-824792(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAGGAAAAAAGAAAT
SmilChr03G001114 Chr03 NC_080389.1:12848682-12848701promoter 内 1203-1222 bp + 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 12851480-12855465(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAAGGGATGACAAAAAGAGG
SmilChr01G005158 Chr01 NC_080387.1:69354985-69355004promoter 内 1159-1178 bp - 2823 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 69347310-69352162(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAAACACT
SmilChr01G004996 Chr01 NC_080387.1:68014746-68014765promoter 内 1152-1171 bp - 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 68011492-68011916(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAAAAGA
SmilChr02G004471 Chr02 NC_080388.1:67100131-67100150promoter 内 1090-1109 bp - 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 67103042-67104077(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr01G001019 Chr01 NC_080387.1:21357065-21357084promoter 内 1084-1103 bp + 2898 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 21359982-21363226(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAAAGAAAAAAAGA
SmilChr03G000305 Chr03 NC_080389.1:3483633-3483652promoter 内 1080-1099 bp - 2902 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 3475239-3480731(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAAAAAAAGAAAAAAAAAAA
SmilChr01G000542 Chr01 NC_080387.1:11128018-11128037promoter 内 1013-1032 bp - 2969 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 11124162-11125049(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAAAAGA
SmilChr01G003799 Chr01 NC_080387.1:56376333-56376352promoter 内 911-930 bp + 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 56370038-56373262(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTTTTTTTTTG
SmilChr03G000606 Chr03 NC_080389.1:6696849-6696868promoter 内 794-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 6692792-6693661(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr02G003975 Chr02 NC_080388.1:62023619-62023638promoter 内 792-811 bp + 3190 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 62018383-62020429(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr03G000436 Chr03 NC_080389.1:4722617-4722636promoter 内 759-778 bp + 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 4717686-4719394(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTTTTCGTCTG
SmilChr02G003959 Chr02 NC_080388.1:61765856-61765875promoter 内 726-745 bp - 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 61769131-61770352(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTTTTTTTTTG
SmilChr02G003281 Chr02 NC_080388.1:54116359-54116378promoter 内 711-730 bp - 3271 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 54119649-54123277(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTATCTTTGTCTTTTTTGT
SmilChr03G000599 Chr03 NC_080389.1:6654420-6654439promoter 内 646-665 bp + 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 6647610-6651084(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr01G000429 Chr01 NC_080387.1:8585723-8585742promoter 内 624-643 bp - 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 8589100-8590420(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr02G004486 Chr02 NC_080388.1:67374769-67374788promoter 内 512-531 bp - 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 67367725-67371299(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAAAGAAAAAAAGA
SmilChr01G003990 Chr01 NC_080387.1:58327058-58327077promoter 内 458-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 58320695-58323534(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ATGAAGAAGACAAAAATAAT
SmilChr02G003335 Chr02 NC_080388.1:54590349-54590368promoter 内 365-384 bp - 3617 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 54593985-54596290(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTCTTTTTTGTTTCTATCTT
SmilChr01G000543 Chr01 NC_080387.1:11128018-11128037promoter 内 278-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 11131741-11134705(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr02G004535 Chr02 NC_080388.1:67905701-67905720promoter 内 83-102 bp + 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 67909619-67911240(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AACGAAGAAACAAAAAAAAA
SmilChr03G000216 Chr03 NC_080389.1:2513761-2513780promoter 内 3929-3948 bp - 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2513833-2516724(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr02G000023 Chr02 NC_080388.1:242346-242365promoter 内 3877-3896 bp - 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 196026-242241(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGCAAAAAGCAAA
SmilChr02G003624 Chr02 NC_080388.1:57557139-57557158promoter 内 3835-3854 bp + 147 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 57557305-57575394(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TAGAAAATGAGAAAAAAAAA
SmilChr02G002486 Chr02 NC_080388.1:43282453-43282472promoter 内 3806-3825 bp - 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43282648-43284698(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr02G004692 Chr02 NC_080388.1:69270766-69270785promoter 内 3768-3787 bp - 214 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 69270999-69273246(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTATTTTTGTCCTCATCTA
SmilChr01G000566 Chr01 NC_080387.1:11708402-11708421promoter 内 3711-3730 bp + 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 11706217-11708131(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTATTGTGTCTTTTTTTT
SmilChr01G004150 Chr01 NC_080387.1:60034901-60034920promoter 内 3691-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 60028237-60034610(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TGGAAAAAGAAAAAAGAAAA
SmilChr02G001659 Chr02 NC_080388.1:30778295-30778314promoter 内 3486-3505 bp - 496 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 30775413-30777799(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CGCAAGAAGACAAGGCAGCG
SmilChr02G004215 Chr02 NC_080388.1:64392169-64392188promoter 内 3440-3459 bp + 542 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 64388940-64391627(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTGTGCTTTGTCTTGTTTTT
SmilChr01G001459 Chr01 NC_080387.1:28355909-28355928promoter 内 3430-3449 bp + 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 28356480-28359703(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAGAAAAAAAGGAAAAAAAA
SmilChr01G001605 Chr01 NC_080387.1:30211428-30211447promoter 内 3399-3418 bp - 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 30212030-30213779(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ATTCTCTCTCTCTTTTTTTT
SmilChr03G002411 Chr03 NC_080389.1:38317223-38317242promoter 内 3336-3355 bp - 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 38313209-38316577(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAGAAGAAAAAAAAAAT
SmilChr02G003698 Chr02 NC_080388.1:58441797-58441816promoter 内 3233-3252 bp + 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 58442565-58448672(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAAAAGA
SmilChr03G000204 Chr03 NC_080389.1:2302476-2302495promoter 内 3231-3250 bp + 751 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2303246-2315523(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAGAAAAAAAGGAAAAAAAA
SmilChr01G005703 Chr01 NC_080387.1:73273318-73273337promoter 内 3023-3042 bp - 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 73274296-73277234(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr02G003500 Chr02 NC_080388.1:56211775-56211794promoter 内 3008-3027 bp - 974 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 56206043-56210801(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AACAAAAAGAAAAAAGAAAC
SmilChr02G000555 Chr02 NC_080388.1:7815621-7815640promoter 内 2983-3002 bp - 999 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7816639-7818312(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTACTATTGTCTTTTCCTT
SmilChr01G006132 Chr01 NC_080387.1:76845129-76845148promoter 内 2929-2948 bp - 1053 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 76837515-76844076(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCGGCAGCGACAAAAACGGC
SmilChr03G002734 Chr03 NC_080389.1:43440559-43440578promoter 内 2883-2902 bp - 1099 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43441677-43449727(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTTTTTTTTTG
SmilChr03G002224 Chr03 NC_080389.1:35061003-35061022promoter 内 2871-2890 bp - 1111 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 35062133-35067198(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ATTTTTTTTTTCTTCTTCTT
SmilChr02G004150 Chr02 NC_080388.1:63824063-63824082promoter 内 2864-2883 bp + 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 63816830-63822945(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTATCTTTTTCTA
SmilChr01G005810 Chr01 NC_080387.1:74125130-74125149promoter 内 2765-2784 bp + 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 74123288-74123913(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr03G003470 Chr03 NC_080389.1:53163537-53163556promoter 内 2577-2596 bp - 1405 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 53164961-53171918(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr01G005407 Chr01 NC_080387.1:71330753-71330772promoter 内 2548-2567 bp + 1434 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 71327720-71329319(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTCCTCTTTTTGGG