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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 77 / 130 下载 TSV

上一页 77 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002202 Chr02 NC_080388.1:39233845-39233857promoter 内 2069-2081 bp + 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 39235777-39236404(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAAGAATATATC
SmilChr01G000178 Chr01 NC_080387.1:2915728-2915740promoter 内 2062-2074 bp - 1927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 2911640-2913801(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAAGAATATCTC
SmilChr01G001263 Chr01 NC_080387.1:25321708-25321720promoter 内 2021-2033 bp + 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 25323688-25327501(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGAGAATATACA
SmilChr02G004940 Chr02 NC_080388.1:71367925-71367937promoter 内 1971-1983 bp - 2018 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 71362767-71365907(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAAGAATATATC
SmilChr01G001214 Chr01 NC_080387.1:24374959-24374971promoter 内 1962-1974 bp + 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 24368871-24372932(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCGATT
SmilChr01G000176 Chr01 NC_080387.1:2894605-2894617promoter 内 1933-1945 bp + 2056 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 2896673-2900364(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTACGAATATTTC
SmilChr01G001122 Chr01 NC_080387.1:22830826-22830838promoter 内 1901-1913 bp + 2088 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 22832926-22840584(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGAGAATATTGC
SmilChr01G003422 Chr01 NC_080387.1:52866275-52866287promoter 内 1895-1907 bp - 2094 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 52862402-52864181(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCAGAATATTTT
SmilChr02G004387 Chr02 NC_080388.1:66237677-66237689promoter 内 1882-1894 bp + 2107 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 66239796-66241119(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGAGAATATACA
SmilChr01G003350 Chr01 NC_080387.1:52255403-52255415promoter 内 1878-1890 bp + 2111 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 52257526-52261602(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GACAGAATATTTT
SmilChr01G003530 Chr01 NC_080387.1:53926510-53926522promoter 内 1858-1870 bp - 2131 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 53928653-53930473(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTTGC
SmilChr01G002752 Chr01 NC_080387.1:45838852-45838864promoter 内 1831-1843 bp - 2158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 45841022-45846134(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTGCT
SmilChr02G003129 Chr02 NC_080388.1:52322207-52322219promoter 内 1798-1810 bp + 2191 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 52318231-52320016(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGGATATTCTTAT
SmilChr01G004963 Chr01 NC_080387.1:67711023-67711035promoter 内 1772-1784 bp - 2217 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 67706278-67708806(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAACGAATATTTT
SmilChr02G002147 Chr02 NC_080388.1:38615684-38615696promoter 内 1771-1783 bp - 2218 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 38611861-38613466(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCAGAATATTTT
SmilChr01G005802 Chr01 NC_080387.1:74098408-74098420promoter 内 1767-1779 bp - 2222 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 74093685-74096186(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TACAGAATATGCT
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SmilChr01G005804 Chr01 NC_080387.1:74098408-74098420promoter 内 1680-1692 bp - 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 74100729-74103443(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCATATTCTGTA
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SmilChr01G005649 Chr01 NC_080387.1:72880232-72880244promoter 内 1627-1639 bp - 2362 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 72882606-72884279(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTGCT
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SmilChr01G000135 Chr01 NC_080387.1:2283232-2283244promoter 内 1582-1594 bp - 2407 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 2285651-2289043(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTGCT
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SmilChr03G001755 Chr03 NC_080389.1:23849483-23849495promoter 内 1547-1559 bp + 2442 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 23851937-23852533(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAGGAATATTGG
SmilChr01G002201 Chr01 NC_080387.1:38289428-38289440promoter 内 1537-1549 bp - 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 38291892-38292689(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTGCT
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SmilChr01G000223 Chr01 NC_080387.1:3958232-3958244promoter 内 1511-1523 bp - 2478 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 3953812-3955754(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAAGAATATATC
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SmilChr01G000053 Chr01 NC_080387.1:846117-846129promoter 内 1493-1505 bp + 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 848625-850513(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAAGAATATATC
SmilChr01G001892 Chr01 NC_080387.1:34038051-34038063promoter 内 1489-1501 bp - 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 34040563-34041389(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTGCT
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SmilChr01G005028 Chr01 NC_080387.1:68238362-68238374promoter 内 1461-1473 bp + 2528 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 68235079-68235834(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTGCT
SmilChr01G004735 Chr01 NC_080387.1:65538746-65538758promoter 内 1444-1456 bp - 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 65541303-65542172(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTGCT
SmilChr01G000879 Chr01 NC_080387.1:18684583-18684595promoter 内 1362-1374 bp - 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 18680179-18681956(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCAGAATATTTT
SmilChr02G003876 Chr02 NC_080388.1:60817029-60817041promoter 内 1349-1361 bp - 2640 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 60812787-60814389(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAGGAATATTGG
SmilChr02G004894 Chr02 NC_080388.1:70963087-70963099promoter 内 1338-1350 bp + 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 70965750-70969187(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGAGAATATACA
SmilChr02G002729 Chr02 NC_080388.1:47208930-47208942promoter 内 1324-1336 bp + 2665 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 47205786-47206265(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCGTTG
SmilChr02G000115 Chr02 NC_080388.1:1457518-1457530promoter 内 1310-1322 bp - 2679 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 1460209-1463014(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTGCT
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SmilChr01G004822 Chr01 NC_080387.1:66402845-66402857promoter 内 1273-1285 bp - 2716 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 66396804-66400129(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCAGAATATTTT