转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002937; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004943-RA_Salv SmilChr07G002937 MIKC_MADS XP_057777490.1 MP00096 CCAAAAATGGAA

可能结合的靶基因

9914 个结合位点 8019 个候选靶基因 第 79 / 161 下载 TSV

上一页 79 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001525 Chr04 NC_080390.1:25173275-25173286promoter 内 3017-3028 bp - 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 25171119-25172302(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCAAAAATGGAA
SmilChr03G001772 Chr03 NC_080389.1:24175355-24175366promoter 内 3001-3012 bp + 989 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 24176355-24177375(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCAAAAATGGAA
SmilChr03G000458 Chr03 NC_080389.1:4884408-4884419promoter 内 2958-2969 bp - 1032 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4885451-4887397(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTAAG
SmilChr02G001282 Chr02 NC_080388.1:23646875-23646886promoter 内 2920-2931 bp - 1070 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 23644815-23645805(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CTTAAAATGGAA
SmilChr06G000157 Chr06 NC_080392.1:1096200-1096211promoter 内 2908-2919 bp + 1082 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 1097293-1098918(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CTTAAAATGGAA
SmilChr05G002396 Chr05 NC_080391.1:26445988-26445999promoter 内 2883-2894 bp - 1107 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 26443203-26444881(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CTTAAAATGGAA
SmilChr03G003145 Chr03 NC_080389.1:48756883-48756894promoter 内 2880-2891 bp - 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 48758004-48759178(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr03G003146 Chr03 NC_080389.1:48764747-48764758promoter 内 2880-2891 bp - 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 48765868-48767042(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr08G001060 Chr08 NC_080394.1:8169370-8169381promoter 内 2861-2872 bp + 1129 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 8170510-8171385(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCAAAAATGGAA
SmilChr07G002867 Chr07 NC_080393.1:28879992-28880003promoter 内 2838-2849 bp - 1152 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 28881155-28883033(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTTGA
SmilChr05G000040 Chr05 NC_080391.1:196952-196963promoter 内 2828-2839 bp - 1162 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 188773-195790(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CTTAAAATGGAA
SmilChr05G001923 Chr05 NC_080391.1:19490330-19490341promoter 内 2825-2836 bp - 1165 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 19491506-19491946(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr04G004125 Chr04 NC_080390.1:56097707-56097718promoter 内 2747-2758 bp + 1243 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56098961-56100930(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAATGGTG
SmilChr04G001404 Chr04 NC_080390.1:22866671-22866682promoter 内 2739-2750 bp + 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 22863697-22865420(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTTGA
SmilChr04G002593 Chr04 NC_080390.1:41350215-41350226promoter 内 2739-2750 bp - 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 41351477-41353220(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTTGA
SmilChr07G002208 Chr07 NC_080393.1:20324898-20324909promoter 内 2724-2735 bp + 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 20321681-20323632(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTAAG
SmilChr07G002118 Chr07 NC_080393.1:19296096-19296107promoter 内 2720-2731 bp + 1270 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 19288000-19294826(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTAAG
SmilChr02G002905 Chr02 NC_080388.1:49356988-49356999promoter 内 2718-2729 bp + 1272 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 49358271-49373202(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAATGGTG
SmilChr01G004205 Chr01 NC_080387.1:60502560-60502571promoter 内 2712-2723 bp - 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 60497417-60501282(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CTTAAAATGGAA
SmilChr01G000028 Chr01 NC_080387.1:543654-543665promoter 内 2700-2711 bp + 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 541403-542364(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTAAG
SmilChr04G004124 Chr04 NC_080390.1:56097707-56097718promoter 内 2698-2709 bp + 1292 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56091060-56096415(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr04G003516 Chr04 NC_080390.1:51542578-51542589promoter 内 2673-2684 bp - 1317 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 51539609-51541261(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAATGGTG
SmilChr01G003552 Chr01 NC_080387.1:54170333-54170344promoter 内 2651-2662 bp + 1339 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 54164657-54168994(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr01G002534 Chr01 NC_080387.1:43361915-43361926promoter 内 2628-2639 bp + 1362 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 43343102-43360553(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr03G003655 Chr03 NC_080389.1:55391461-55391472promoter 内 2607-2618 bp - 1383 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55388151-55390078(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CTTAAAATGGAA
SmilChr02G004689 Chr02 NC_080388.1:69209055-69209066promoter 内 2605-2616 bp + 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 69207208-69207670(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr01G004920 Chr01 NC_080387.1:67283228-67283239promoter 内 2602-2613 bp + 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 67284627-67289060(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCAAAAATGGAA
SmilChr03G002039 Chr03 NC_080389.1:30778020-30778031promoter 内 2592-2603 bp - 1398 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 30779429-30780497(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr02G004459 Chr02 NC_080388.1:67017299-67017310promoter 内 2570-2581 bp - 1420 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 66989070-67015879(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAATGGTG
SmilChr01G000425 Chr01 NC_080387.1:8523738-8523749promoter 内 2562-2573 bp + 1428 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 8514196-8522310(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr05G003590 Chr05 NC_080391.1:47992870-47992881promoter 内 2559-2570 bp + 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 47994312-47995328(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CTTAAAATGGAA
SmilChr04G003036 Chr04 NC_080390.1:46844219-46844230promoter 内 2550-2561 bp + 1440 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 46845670-46846062(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CTTAAAATGGAA
SmilChr01G002963 Chr01 NC_080387.1:48523590-48523601promoter 内 2526-2537 bp + 1464 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 48521423-48522126(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr04G001152 Chr04 NC_080390.1:16981157-16981168promoter 内 2525-2536 bp + 1465 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 16982633-16985804(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCAAAAATGGAA
SmilChr03G002809 Chr03 NC_080389.1:44551949-44551960promoter 内 2524-2535 bp - 1466 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 44543472-44550483(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCAAAAATGGAA
SmilChr07G004694 Chr07 NC_080393.1:59864187-59864198promoter 内 2521-2532 bp + 1469 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 59859952-59862718(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr05G001177 Chr05 NC_080391.1:9874508-9874519promoter 内 2499-2510 bp + 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 9870211-9873017(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTAAG
SmilChr05G003179 Chr05 NC_080391.1:40702983-40702994promoter 内 2497-2508 bp - 1493 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 40699119-40701490(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CTTAAAATGGAA
SmilChr03G002117 Chr03 NC_080389.1:32919372-32919383promoter 内 2494-2505 bp + 1496 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 32916940-32917876(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr04G001887 Chr04 NC_080390.1:30814582-30814593promoter 内 2486-2497 bp - 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 30816097-30817013(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr07G004386 Chr07 NC_080393.1:56415359-56415370promoter 内 2486-2497 bp + 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56412140-56413855(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr01G004661 Chr01 NC_080387.1:64717419-64717430promoter 内 2479-2490 bp - 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 64718941-64721423(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTTGA
SmilChr04G001425 Chr04 NC_080390.1:23217811-23217822promoter 内 2475-2486 bp + 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 23197457-23216296(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTAAG
SmilChr05G000966 Chr05 NC_080391.1:7801629-7801640promoter 内 2468-2479 bp + 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 7803162-7805218(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCAAAAATGGAA
SmilChr07G004283 Chr07 NC_080393.1:55378784-55378795promoter 内 2465-2476 bp - 1525 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55371845-55377259(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCAAAAATGGAA
SmilChr04G002066 Chr04 NC_080390.1:33422219-33422230promoter 内 2446-2457 bp - 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 33419599-33420675(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAATGGTG
SmilChr05G000902 Chr05 NC_080391.1:7146797-7146808promoter 内 2435-2446 bp + 1555 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 7148363-7150360(+) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TCAAAAATGGAA
SmilChr07G002613 Chr07 NC_080393.1:25186324-25186335promoter 内 2415-2426 bp + 1575 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 25180758-25184749(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CACCATTTTTGG
SmilChr03G004556 Chr03 NC_080389.1:63539947-63539958promoter 内 2403-2414 bp + 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 63527341-63538360(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 TTCCATTTTTGA
SmilChr06G002830 Chr06 NC_080392.1:41078530-41078541promoter 内 2400-2411 bp - 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 41070167-41076940(-) SMil_00004943-RA_Salv MP00096 CCAAAAATGGTG