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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022980-RA_Salv SmilChr01G002885 ERF XP_057767601.1 MP00151 ATGGACGGTGGAGG

可能结合的靶基因

9976 个结合位点 6907 个候选靶基因 第 8 / 139 下载 TSV

上一页 8 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G003053 Chr06 NC_080392.1:43423138-43423151promoter 内 3850-3863 bp - 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 43415031-43423000(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGCCGA
SmilChr03G003868 Chr03 NC_080389.1:57794581-57794594promoter 内 3095-3108 bp - 893 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 57795487-57797092(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCGCCGCCGTCCAG
SmilChr01G006130 Chr01 NC_080387.1:76821194-76821207promoter 内 3081-3094 bp - 907 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 76822114-76825762(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCGCCACCGTCCAG
SmilChr05G001630 Chr05 NC_080391.1:15221284-15221297promoter 内 1628-1641 bp - 2360 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 15213235-15218924(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGTCGG
SmilChr06G003054 Chr06 NC_080392.1:43423138-43423151promoter 内 799-812 bp - 3189 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 43426340-43428376(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCGGCGCCGTCCAC
SmilChr06G002320 Chr06 NC_080392.1:33467380-33467393promoter 内 3135-3148 bp + 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 33465748-33466527(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGGCCGCCGTCCAT
SmilChr02G000960 Chr02 NC_080388.1:16741298-16741311promoter 内 2951-2964 bp + 1037 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 16742348-16754621(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGTGGCAA
SmilChr02G000580 Chr02 NC_080388.1:8374347-8374360promoter 内 1412-1425 bp - 2576 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 8368791-8371771(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGTGGCAA
SmilChr03G000089 Chr03 NC_080389.1:1010594-1010607promoter 内 814-827 bp - 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 1013781-1017093(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGCCACCGTCCAC
SmilChr01G004779 Chr01 NC_080387.1:65959715-65959728promoter 内 3930-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 65959786-65963505(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCCCCGCCGTCCAA
SmilChr03G000997 Chr03 NC_080389.1:11318339-11318352promoter 内 3263-3276 bp - 725 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 11316122-11317614(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCGGCCG
SmilChr03G000994 Chr03 NC_080389.1:11308451-11308464promoter 内 3261-3274 bp - 727 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 11306232-11307724(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCGGCCG
SmilChr01G006102 Chr01 NC_080387.1:76524591-76524604promoter 内 3252-3265 bp - 736 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 76521564-76523855(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCGGCCG
SmilChr01G006103 Chr01 NC_080387.1:76534377-76534390promoter 内 3244-3257 bp - 744 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 76529367-76533633(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCGGCCG
SmilChr05G003716 Chr05 NC_080391.1:50283237-50283250promoter 内 3134-3147 bp + 854 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 50284104-50285354(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCGGCCG
SmilChr06G003255 Chr06 NC_080392.1:45212166-45212179promoter 内 2930-2943 bp + 1058 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 45213237-45218064(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AAGGACGGTGGTGG
SmilChr05G003210 Chr05 NC_080391.1:41153026-41153039promoter 内 2744-2757 bp + 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 41154283-41155149(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCGGCCG
SmilChr06G003254 Chr06 NC_080392.1:45212166-45212179promoter 内 2451-2464 bp + 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 45201247-45210629(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCTT
SmilChr06G003124 Chr06 NC_080392.1:44107109-44107122promoter 内 2391-2404 bp - 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 44093385-44105512(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGGCAA
SmilChr06G000450 Chr06 NC_080392.1:3645028-3645041promoter 内 2385-2398 bp + 1603 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 3646644-3649686(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AAGGACGGTGGTGG
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SmilChr07G000036 Chr07 NC_080393.1:163067-163080promoter 内 2325-2338 bp + 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 160705-161404(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGCCACCGTCAAT
SmilChr05G002855 Chr05 NC_080391.1:34047612-34047625promoter 内 2311-2324 bp - 1677 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 34049302-34051225(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGACCAT
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SmilChr03G000993 Chr03 NC_080389.1:11308451-11308464promoter 内 1265-1278 bp - 2723 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 11302850-11305728(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCGGCCG
SmilChr06G001501 Chr06 NC_080392.1:16082788-16082801promoter 内 853-866 bp - 3135 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 16066318-16079653(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGGCAA
SmilChr04G001937 Chr04 NC_080390.1:31491414-31491427promoter 内 554-567 bp - 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 31494861-31497715(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGACCAT
SmilChr01G000615 Chr01 NC_080387.1:13568048-13568061promoter 内 405-418 bp + 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 13571644-13579885(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCGGCCG
SmilChr05G002856 Chr05 NC_080391.1:34047612-34047625promoter 内 215-228 bp - 3773 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 34051398-34051890(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGACCAT
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SmilChr03G003149 Chr03 NC_080389.1:48817984-48817997promoter 内 3277-3290 bp - 711 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 48818708-48824247(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TAGCCGCCGTCCAC
SmilChr03G003137 Chr03 NC_080389.1:48600678-48600691promoter 内 3273-3286 bp - 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 48601406-48607011(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TAGCCGCCGTCCAC
SmilChr02G002240 Chr02 NC_080388.1:39753170-39753183promoter 内 1761-1774 bp + 2227 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 39749766-39750943(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCACCACCGTCCAA
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SmilChr03G001970 Chr03 NC_080389.1:28378706-28378719promoter 内 3897-3910 bp - 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 28376639-28378615(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGGACGGTGGTGG
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SmilChr04G000942 Chr04 NC_080390.1:12478604-12478617promoter 内 3303-3316 bp + 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 12479302-12480618(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGGACGGTGGTGG
SmilChr04G000943 Chr04 NC_080390.1:12487948-12487961promoter 内 3303-3316 bp + 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 12488646-12489962(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGGACGGTGGTGG
SmilChr06G002474 Chr06 NC_080392.1:35576684-35576697promoter 内 2899-2912 bp - 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 35577786-35578736(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CAGCCGCCGTCCAA
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SmilChr01G006101 Chr01 NC_080387.1:76515842-76515855promoter 内 433-446 bp + 3555 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 76519410-76520333(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGCGGCTG
SmilChr01G001404 Chr01 NC_080387.1:27664189-27664202promoter 内 36-49 bp - 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 27652810-27660237(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGGACGGTGGTGG