转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001111; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023725-RA_Salv SmilChr06G001111 MYB XP_057768512.1 MP00388 AAAGTTAGGTATAA

可能结合的靶基因

9774 个结合位点 6870 个候选靶基因 第 8 / 138 下载 TSV

上一页 8 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002360 Chr02 NC_080388.1:41382262-41382275promoter 内 1822-1835 bp + 2166 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 41378458-41380096(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CTGTACCTAATTTT
SmilChr01G000026 Chr01 NC_080387.1:484996-485009promoter 内 1792-1805 bp - 2196 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 480225-482800(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGAGTTAGGTACTA
SmilChr01G002029 Chr01 NC_080387.1:35868379-35868392promoter 内 1116-1129 bp + 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 35864563-35865507(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCCAACCTAACTCT
SmilChr02G002002 Chr02 NC_080388.1:36167681-36167694promoter 内 1084-1097 bp + 2904 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 36170598-36172024(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AATGTTAGGTAAAC
SmilChr02G000668 Chr02 NC_080388.1:10296884-10296897promoter 内 206-219 bp + 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 10300679-10301591(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGAGTTAGGTACTA
SmilChr03G001219 Chr03 NC_080389.1:14013938-14013951promoter 内 126-139 bp - 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 14007534-14010076(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGGGTTAGGTACCA
SmilChr03G002519 Chr03 NC_080389.1:40152675-40152688promoter 内 3449-3462 bp + 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 5 40137796-40152136(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACACT
SmilChr01G005437 Chr01 NC_080387.1:71503467-71503480promoter 内 3149-3162 bp - 839 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 4 71504319-71509382(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCGAACCTAACCCT
SmilChr02G003706 Chr02 NC_080388.1:58598242-58598255promoter 内 3041-3054 bp - 947 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 4 58596819-58597295(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATAGTTAGGTCTGA
SmilChr03G001921 Chr03 NC_080389.1:26936078-26936091promoter 内 2770-2783 bp + 1218 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 26925349-26934860(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACAAT
SmilChr02G003707 Chr02 NC_080388.1:58598242-58598255promoter 内 2025-2038 bp - 1963 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 58600218-58608107(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCAGACCTAACTAT
SmilChr01G001840 Chr01 NC_080387.1:33342373-33342386promoter 内 870-883 bp - 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 33337817-33339255(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGAGTTAGGTGAGG
SmilChr02G002791 Chr02 NC_080388.1:47970491-47970504promoter 内 426-439 bp + 3562 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 47962680-47966929(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACAAT
SmilChr03G002326 Chr03 NC_080389.1:36621472-36621485promoter 内 3974-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 36621499-36622803(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAGTACCTAACTCA
SmilChr03G001972 Chr03 NC_080389.1:28415643-28415656promoter 内 3689-3702 bp - 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 28415955-28416551(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GCCTACCTAACCAA
SmilChr01G003576 Chr01 NC_080387.1:54351899-54351912promoter 内 3667-3680 bp + 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 54352233-54354691(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGTGTTAGGTCCGG
SmilChr02G005176 Chr02 NC_080388.1:73056690-73056703promoter 内 3555-3568 bp - 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 73057136-73060787(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCCCACCTAACCTA
SmilChr01G005644 Chr01 NC_080387.1:72855657-72855670promoter 内 3000-3013 bp + 988 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 72856658-72859105(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGGGTTAGGTTCGA
SmilChr01G000921 Chr01 NC_080387.1:19475337-19475350promoter 内 2521-2534 bp - 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 19476817-19479987(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACAAT
SmilChr03G001818 Chr03 NC_080389.1:24843162-24843175promoter 内 2299-2312 bp - 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 24844864-24846175(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACAAT
SmilChr02G002515 Chr02 NC_080388.1:43654353-43654366promoter 内 2217-2230 bp - 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 43650178-43652582(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATTGTTAGGTCCGG
SmilChr02G004982 Chr02 NC_080388.1:71706178-71706191promoter 内 1891-1904 bp - 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 71701068-71704081(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GAAGTTAGGTTTGA
SmilChr03G002412 Chr03 NC_080389.1:38366798-38366811promoter 内 1452-1465 bp - 2536 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 38361917-38364262(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGTGTTAGGTCCGG
SmilChr02G000429 Chr02 NC_080388.1:5493809-5493822promoter 内 1391-1404 bp + 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 5488388-5491212(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACAAT
SmilChr01G003555 Chr01 NC_080387.1:54178132-54178145promoter 内 1388-1401 bp - 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 54180745-54184910(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAGTACCTAACTCA
SmilChr03G001817 Chr03 NC_080389.1:24843162-24843175promoter 内 1071-1084 bp - 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 24837738-24840245(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATTGTTAGGTCCGG
SmilChr02G001346 Chr02 NC_080388.1:25138064-25138077promoter 内 858-871 bp + 3130 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 25141207-25144288(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACAGTTAGGTAGAC
SmilChr02G002621 Chr02 NC_080388.1:45517208-45517221promoter 内 835-848 bp + 3153 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 45520374-45524679(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GAAGTTAGGTGCGT
SmilChr01G005098 Chr01 NC_080387.1:68808291-68808304promoter 内 751-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 68802452-68805054(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATTGTTAGGTCCGG
SmilChr03G001396 Chr03 NC_080389.1:16578324-16578337promoter 内 483-496 bp + 3505 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 16581842-16589213(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATTGTTAGGTCCGG
SmilChr01G001234 Chr01 NC_080387.1:24765857-24765870promoter 内 329-342 bp + 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 24769529-24773415(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTTGTTAGGTAAGA
SmilChr01G002328 Chr01 NC_080387.1:40437066-40437079promoter 内 311-324 bp + 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 40440756-40444375(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATTGTTAGGTCCGG
SmilChr02G001426 Chr02 NC_080388.1:26940309-26940322promoter 内 225-238 bp - 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 26933246-26936546(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATAGTTAGGTCTGA
SmilChr01G003028 Chr01 NC_080387.1:49330959-49330972promoter 内 92-105 bp + 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 49334868-49341238(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATAGTTAGGTTTGG
SmilChr01G002361 Chr01 NC_080387.1:40775215-40775228promoter 内 3981-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 40773331-40775208(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GGAGTTAGGTATAT
SmilChr02G000023 Chr02 NC_080388.1:242378-242391promoter 内 3851-3864 bp + 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 196026-242241(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACGTACCTAACAAC
SmilChr01G003554 Chr01 NC_080387.1:54178132-54178145promoter 内 3833-3846 bp - 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 54178300-54179238(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAGTACCTAACTCA
SmilChr01G000697 Chr01 NC_080387.1:15671896-15671909promoter 内 3802-3815 bp - 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 15672095-15672531(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACAAT
SmilChr03G000060 Chr03 NC_080389.1:669446-669459promoter 内 3756-3769 bp - 232 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 669691-771622(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTGAACCTAACTAA
SmilChr03G002542 Chr03 NC_080389.1:40589289-40589302promoter 内 3507-3520 bp + 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 40581936-40588808(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACAAT
SmilChr02G000645 Chr02 NC_080388.1:9735210-9735223promoter 内 3288-3301 bp - 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 9735923-9737129(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GCCTACCTAACCAA
SmilChr01G005643 Chr01 NC_080387.1:72855657-72855670promoter 内 2969-2982 bp + 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 72852191-72854638(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCGAACCTAACCCT
SmilChr02G002040 Chr02 NC_080388.1:36715977-36715990promoter 内 2944-2957 bp + 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 36717034-36718891(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGTGTTAGGTCCGG
SmilChr02G001383 Chr02 NC_080388.1:26234551-26234564promoter 内 2752-2765 bp + 1236 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 26190173-26233315(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACAAT
SmilChr02G002790 Chr02 NC_080388.1:47955868-47955881promoter 内 2703-2716 bp + 1285 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 47957166-47958823(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTAGTTAGGTAAAT
SmilChr02G002484 Chr02 NC_080388.1:43223718-43223731promoter 内 2637-2650 bp - 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 43225082-43227258(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACACT
SmilChr02G000971 Chr02 NC_080388.1:17010083-17010096promoter 内 2366-2379 bp - 1622 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 17005463-17008461(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATTGTTAGGTCCGG
SmilChr01G001643 Chr01 NC_080387.1:30469471-30469484promoter 内 2350-2363 bp - 1638 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 30465156-30467833(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CATGTTAGGTATAG
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SmilChr02G002789 Chr02 NC_080388.1:47955868-47955881promoter 内 2289-2302 bp + 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 47946256-47954169(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATTTACCTAACTAA