转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G001252; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00025976-RA_Salv SmilChr03G001252 bZIP XP_057802461.1 MP00291 AATGGTCACGTGGCA

可能结合的靶基因

9321 个结合位点 6894 个候选靶基因 第 88 / 138 下载 TSV

上一页 88 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002255 Chr05 NC_080391.1:24228567-24228581promoter 内 1100-1114 bp + 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 24231468-24243803(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GAATATTACGTGGCA
SmilChr07G001464 Chr07 NC_080393.1:11491129-11491143promoter 内 1082-1096 bp - 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 11487473-11488224(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GAAATACACGTGGCG
SmilChr03G002189 Chr03 NC_080389.1:34181931-34181945promoter 内 1012-1026 bp + 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 34184920-34187236(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CCGGCTTACGTGGCG
SmilChr06G000911 Chr06 NC_080392.1:8581853-8581867promoter 内 952-966 bp + 3035 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8584902-8585833(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGGATCCACGTGGCG
SmilChr01G004066 Chr01 NC_080387.1:59074980-59074994promoter 内 946-960 bp + 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 59070817-59071939(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAATATTC
SmilChr07G004299 Chr07 NC_080393.1:55585465-55585479promoter 内 871-885 bp + 3116 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 55573542-55582349(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCACGATT
SmilChr01G003324 Chr01 NC_080387.1:51929985-51929999promoter 内 778-792 bp - 3209 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 51933208-51936060(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGACACGTGATAATA
SmilChr07G001146 Chr07 NC_080393.1:8616618-8616632promoter 内 700-714 bp - 3287 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8610833-8613331(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AATCGTGACGTGGCT
SmilChr06G001244 Chr06 NC_080392.1:12842421-12842435promoter 内 697-711 bp - 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 12845725-12847086(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCATTTAA
SmilChr01G001362 Chr01 NC_080387.1:26972562-26972576promoter 内 694-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 26968437-26969269(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTAAATGACGTGGCG
SmilChr06G001174 Chr06 NC_080392.1:11948549-11948563promoter 内 603-617 bp - 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 11951947-11952390(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAGGATAT
SmilChr08G000679 Chr08 NC_080394.1:5057404-5057418promoter 内 471-485 bp + 3516 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 5052606-5053888(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTTTGAA
SmilChr04G000284 Chr04 NC_080390.1:2606842-2606856promoter 内 420-434 bp + 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 2595443-2603275(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAGGATAT
SmilChr05G003471 Chr05 NC_080391.1:46100226-46100240promoter 内 364-378 bp - 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 46095987-46096603(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCAAGACGTGGCA
SmilChr02G005440 Chr02 NC_080388.1:74800528-74800542promoter 内 345-359 bp - 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 74789115-74796886(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATGATCGACGTGGCG
SmilChr07G002042 Chr07 NC_080393.1:18516859-18516873promoter 内 333-347 bp + 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 18520527-18524903(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATATGACACGTGGAA
SmilChr04G002215 Chr04 NC_080390.1:35835551-35835565promoter 内 243-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 35839309-35843360(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TCAGCAGACGTGGCT
SmilChr01G005787 Chr01 NC_080387.1:73949252-73949266promoter 内 225-239 bp - 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 73953028-73956878(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCGATTGG
SmilChr04G002203 Chr04 NC_080390.1:35662403-35662417promoter 内 222-236 bp + 3765 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 35666182-35669610(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TCAGCAGACGTGGCT
SmilChr01G002631 Chr01 NC_080387.1:44614901-44614915promoter 内 218-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 44609104-44611132(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATATCCTACGTGGCG
SmilChr07G000083 Chr07 NC_080393.1:419810-419824promoter 内 207-221 bp + 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 423604-429043(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTAAATGACGTGGCG
SmilChr07G001147 Chr07 NC_080393.1:8616618-8616632promoter 内 150-164 bp - 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8620469-8624299(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCACGATT
SmilChr07G002993 Chr07 NC_080393.1:30594792-30594806promoter 内 21-35 bp - 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 30598772-30602735(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCAATAAG
SmilChr02G002874 Chr02 NC_080388.1:48997083-48997097promoter 内 3850-3864 bp - 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 48993750-48996946(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTACGCTACGTGGCA
SmilChr07G000853 Chr07 NC_080393.1:6076766-6076780promoter 内 3737-3751 bp - 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 6077030-6082154(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAAGTCCC
SmilChr02G004571 Chr02 NC_080388.1:68212134-68212148promoter 内 2955-2969 bp - 1032 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 68213180-68218239(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGTACTTC
SmilChr02G004570 Chr02 NC_080388.1:68211278-68211292promoter 内 2804-2818 bp + 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 68207567-68210095(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGTACTTC
SmilChr06G001279 Chr06 NC_080392.1:13374500-13374514promoter 内 2694-2708 bp - 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 13373090-13373207(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCGGTCACGTGGAC
SmilChr02G001403 Chr02 NC_080388.1:26616227-26616241promoter 内 2548-2562 bp - 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 26617680-26620835(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGTACTTC
SmilChr06G001297 Chr06 NC_080392.1:13523084-13523098promoter 内 2484-2498 bp + 1503 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 13504616-13521581(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGGCTGCC
SmilChr07G002908 Chr07 NC_080393.1:29490101-29490115promoter 内 2069-2083 bp + 1918 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 29492033-29493951(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTTGTCTACGTGGCG
SmilChr02G001399 Chr02 NC_080388.1:26572861-26572875promoter 内 1315-1329 bp - 2672 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 26575547-26585582(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGTACTTC
SmilChr06G001889 Chr06 NC_080392.1:22568746-22568760promoter 内 617-631 bp - 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 22572130-22574536(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGGATGG
SmilChr08G002668 Chr08 NC_080394.1:26180834-26180848promoter 内 482-496 bp + 3505 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 26175276-26177329(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGCTAGC
SmilChr07G001859 Chr07 NC_080393.1:16119305-16119319promoter 内 419-433 bp - 3568 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 16112381-16115737(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TCAATTGACGTGGCA
SmilChr08G001556 Chr08 NC_080394.1:12778159-12778173promoter 内 152-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 12769949-12774324(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGCTAGC
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