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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 9 / 141 下载 TSV

上一页 9 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G000349 Chr08 NC_080394.1:2416347-2416361promoter 内 2243-2257 bp + 1744 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 2413039-2414603(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGGCACCGACAAAA
SmilChr08G000350 Chr08 NC_080394.1:2419843-2419857promoter 内 1444-1458 bp + 2543 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 2415680-2417300(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGGCACCGACAAAA
SmilChr02G005539 Chr02 NC_080388.1:75420148-75420162promoter 内 686-700 bp + 3301 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 75413636-75416847(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCGGCACCGACGCCG
SmilChr02G005541 Chr02 NC_080388.1:75420148-75420162promoter 内 223-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 75423926-75428294(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGCCGC
SmilChr02G002212 Chr02 NC_080388.1:39370002-39370016promoter 内 3729-3743 bp + 258 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 39370274-39370975(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGTCGTCGGTGGTGG
SmilChr05G001096 Chr05 NC_080391.1:9125722-9125736promoter 内 3710-3724 bp - 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 9126013-9128618(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTGCACCGACACTG
SmilChr02G002637 Chr02 NC_080388.1:45762867-45762881promoter 内 3285-3299 bp + 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 45763583-45764729(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGTCGTCGGTGGTGG
SmilChr08G000351 Chr08 NC_080394.1:2421460-2421474promoter 内 3238-3252 bp + 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 2419051-2420711(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGGCACCGACAAAA
SmilChr06G003282 Chr06 NC_080392.1:45366113-45366127promoter 内 3194-3208 bp + 793 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 45366920-45371244(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTCTGTCGGTGGAGA
SmilChr07G001056 Chr07 NC_080393.1:7705627-7705641promoter 内 3168-3182 bp - 819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 7703301-7704808(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AATCGTCGGTGGAGG
SmilChr08G000675 Chr08 NC_080394.1:5022858-5022872promoter 内 3019-3033 bp - 968 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 5018900-5021890(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGTTGTCGGCGGCTG
SmilChr06G001166 Chr06 NC_080392.1:11884831-11884845promoter 内 2979-2993 bp + 1008 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 11885853-11890169(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGTCGTCGGTGGTGG
SmilChr01G006130 Chr01 NC_080387.1:76820992-76821006promoter 内 2879-2893 bp + 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 76822114-76825762(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGACGTCGGTGGCGT
SmilChr03G004687 Chr03 NC_080389.1:64262300-64262314promoter 内 2497-2511 bp - 1490 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 64263804-64269899(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATGCCACCGACAGCT
SmilChr04G003420 Chr04 NC_080390.1:50794563-50794577promoter 内 2289-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 50796275-50800491(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGTCGTCGGTGGTGG
SmilChr08G000676 Chr08 NC_080394.1:5022858-5022872promoter 内 2234-2248 bp - 1753 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 5024625-5028925(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAGCCGCCGACAACT
SmilChr01G003764 Chr01 NC_080387.1:56025227-56025241promoter 内 1803-1817 bp - 2184 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 56027425-56028951(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGGCACCGACACGG
SmilChr08G000348 Chr08 NC_080394.1:2413668-2413682promoter 内 1382-1396 bp + 2605 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 2409367-2411063(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGGCACCGACAAAA
SmilChr08G001512 Chr08 NC_080394.1:12273582-12273596promoter 内 1227-1241 bp + 2760 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 12276356-12277775(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGACGA
SmilChr07G000138 Chr07 NC_080393.1:824868-824882promoter 内 1155-1169 bp + 2832 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 820621-822036(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
SmilChr01G004558 Chr01 NC_080387.1:63667040-63667054promoter 内 123-137 bp + 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 63670918-63672419(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCTTGTCGGTGGCGT
SmilChr03G001561 Chr03 NC_080389.1:19678222-19678236promoter 内 3526-3540 bp + 461 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 19678697-19679625(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGCGTCGGTGGAGT
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SmilChr07G002274 Chr07 NC_080393.1:20969904-20969918promoter 内 3103-3117 bp - 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 20967584-20969020(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTTGTCGGCGGCGC
SmilChr01G005136 Chr01 NC_080387.1:69157648-69157662promoter 内 2900-2914 bp - 1087 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 69154295-69156561(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GAGTGTCGGTGAAGG
SmilChr08G000385 Chr08 NC_080394.1:2709949-2709963promoter 内 2888-2902 bp - 1099 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 2702802-2708850(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATTTGTCGGTGGTGA
SmilChr08G000352 Chr08 NC_080394.1:2426022-2426036promoter 内 2691-2705 bp + 1296 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 2423123-2424726(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGGCACCGACAAAA
SmilChr01G005652 Chr01 NC_080387.1:72894247-72894261promoter 内 2577-2591 bp - 1410 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 72892765-72892837(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCATGTCGGTGGCGA
SmilChr06G000253 Chr06 NC_080392.1:1678471-1678485promoter 内 2563-2577 bp + 1424 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 1675512-1677047(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTTCCACCGACAGCG
SmilChr01G001955 Chr01 NC_080387.1:34797417-34797431promoter 内 2545-2559 bp - 1442 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 34795571-34795975(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GAGTGTCGGTGGCTC
SmilChr04G002101 Chr04 NC_080390.1:33901714-33901728promoter 内 2318-2332 bp - 1669 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 33895820-33900045(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTTGTCGGCGCCGG
SmilChr03G000777 Chr03 NC_080389.1:8858973-8858987promoter 内 2297-2311 bp + 1690 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 8856531-8857283(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGTCCACCGACAACA
SmilChr08G001349 Chr08 NC_080394.1:10800625-10800639promoter 内 1982-1996 bp + 2005 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 10793915-10798620(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
SmilChr06G001378 Chr06 NC_080392.1:14445352-14445366promoter 内 1973-1987 bp + 2014 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 14441203-14443338(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
SmilChr05G000532 Chr05 NC_080391.1:4075616-4075630promoter 内 1900-1914 bp - 2087 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 4072232-4073529(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGTGTCGGTGGATT
SmilChr08G001180 Chr08 NC_080394.1:9469929-9469943promoter 内 1601-1615 bp + 2386 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 9465364-9467543(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
SmilChr01G000177 Chr01 NC_080387.1:2911844-2911858promoter 内 1559-1573 bp + 2428 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 2906711-2909416(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATGCCACCGACGCTG
SmilChr04G000287 Chr04 NC_080390.1:2660616-2660630promoter 内 1350-1364 bp - 2637 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 2663267-2664339(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
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SmilChr02G004103 Chr02 NC_080388.1:63345318-63345332promoter 内 959-973 bp - 3028 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 63340346-63342290(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTTGTCGGCGCCGG
SmilChr05G001416 Chr05 NC_080391.1:12795875-12795889promoter 内 945-959 bp + 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 12790333-12792833(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
SmilChr02G002492 Chr02 NC_080388.1:43363448-43363462promoter 内 927-941 bp + 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 43353388-43360388(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
SmilChr02G004924 Chr02 NC_080388.1:71256092-71256106promoter 内 925-939 bp + 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71252206-71253030(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
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SmilChr05G001967 Chr05 NC_080391.1:20236277-20236291promoter 内 767-781 bp + 3220 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 20229411-20233057(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AATCCACCGACACCA
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SmilChr01G004861 Chr01 NC_080387.1:66762316-66762330promoter 内 511-525 bp - 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 66758287-66758840(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTTGTCGGCGCCGG