转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 95 / 143 下载 TSV

上一页 95 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000974 Chr03 NC_080389.1:11029128-11029139promoter 内 1397-1408 bp - 2593 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 11031732-11056910(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr06G000740 Chr06 NC_080392.1:6854203-6854214promoter 内 1328-1339 bp - 2662 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 6846669-6851541(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGCG
SmilChr07G001155 Chr07 NC_080393.1:8650937-8650948promoter 内 1185-1196 bp - 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 8653753-8653855(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAT
SmilChr02G002971 Chr02 NC_080388.1:50227344-50227355promoter 内 1171-1182 bp - 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 50230174-50231112(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr02G002426 Chr02 NC_080388.1:42238746-42238757promoter 内 1166-1177 bp - 2824 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 42241581-42241653(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAACTGTCAA
SmilChr07G001679 Chr07 NC_080393.1:14231753-14231764promoter 内 1058-1069 bp + 2932 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 14225656-14228821(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTA
SmilChr01G002899 Chr01 NC_080387.1:47663951-47663962promoter 内 1040-1051 bp + 2950 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 47666912-47668792(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAGT
SmilChr01G005593 Chr01 NC_080387.1:72575942-72575953promoter 内 1038-1049 bp - 2952 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 72572491-72572990(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGCA
SmilChr05G000831 Chr05 NC_080391.1:6531183-6531194promoter 内 1015-1026 bp + 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 6534169-6537241(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAT
SmilChr02G002411 Chr02 NC_080388.1:42088045-42088056promoter 内 1010-1021 bp + 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 42084993-42085065(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCGT
SmilChr05G001313 Chr05 NC_080391.1:11304038-11304049promoter 内 971-982 bp + 3019 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 11307068-11311697(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTAAG
SmilChr02G003262 Chr02 NC_080388.1:53909730-53909741promoter 内 948-959 bp - 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 53912783-53916969(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAT
SmilChr01G004080 Chr01 NC_080387.1:59214722-59214733promoter 内 923-934 bp - 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 59217800-59219762(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr02G001162 Chr02 NC_080388.1:21208386-21208397promoter 内 916-927 bp + 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 21211471-21212307(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAT
SmilChr02G003194 Chr02 NC_080388.1:53089354-53089365promoter 内 883-894 bp + 3107 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 53092472-53093646(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGCA
SmilChr04G003557 Chr04 NC_080390.1:51950022-51950033promoter 内 845-856 bp + 3145 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 51953178-51959851(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAT
SmilChr05G000547 Chr05 NC_080391.1:4168277-4168288promoter 内 739-750 bp - 3251 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4171539-4176278(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAACTGTCAA
SmilChr08G003117 Chr08 NC_080394.1:31422683-31422694promoter 内 708-719 bp - 3282 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 31425976-31429123(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr06G000427 Chr06 NC_080392.1:3502057-3502068promoter 内 695-706 bp + 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 3505363-3508551(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr03G003784 Chr03 NC_080389.1:56959659-56959670promoter 内 690-701 bp - 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56962970-56964876(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr06G003125 Chr06 NC_080392.1:44103296-44103307promoter 内 683-694 bp + 3307 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 44106614-44111196(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATT
SmilChr04G001732 Chr04 NC_080390.1:28564381-28564392promoter 内 583-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 28558171-28560974(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCGT
SmilChr08G002978 Chr08 NC_080394.1:29873797-29873808promoter 内 537-548 bp - 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 29868195-29870344(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCAG
SmilChr02G000669 Chr02 NC_080388.1:10330795-10330806promoter 内 527-538 bp + 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 10334269-10336147(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr08G003106 Chr08 NC_080394.1:31301056-31301067promoter 内 505-516 bp - 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 31304552-31306237(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr08G000558 Chr08 NC_080394.1:4054149-4054160promoter 内 470-481 bp - 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4057680-4062131(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr03G003789 Chr03 NC_080389.1:56994061-56994072promoter 内 403-414 bp - 3587 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56987902-56990474(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGCA
SmilChr05G000030 Chr05 NC_080391.1:144644-144655promoter 内 379-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 148266-151780(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr04G003368 Chr04 NC_080390.1:50260762-50260773promoter 内 336-347 bp - 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 50254139-50257108(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr05G001022 Chr05 NC_080391.1:8384801-8384812promoter 内 330-341 bp - 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 8388472-8393869(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAACTGTCAA
SmilChr03G000977 Chr03 NC_080389.1:11056372-11056383promoter 内 320-331 bp - 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 11050404-11052702(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATT
SmilChr03G000802 Chr03 NC_080389.1:9183880-9183891promoter 内 252-263 bp - 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 9178241-9180142(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATT
SmilChr05G003365 Chr05 NC_080391.1:44485297-44485308promoter 内 165-176 bp + 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 44489133-44490637(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGTT
SmilChr05G002904 Chr05 NC_080391.1:34885958-34885969promoter 内 114-125 bp + 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 34889845-34890957(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTAAT
SmilChr07G004301 Chr07 NC_080393.1:55603326-55603337promoter 内 85-96 bp + 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55597509-55599421(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr01G005545 Chr01 NC_080387.1:72257693-72257704promoter 内 26-37 bp + 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 72261668-72264027(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGCG
SmilChr02G005445 Chr02 NC_080388.1:74817430-74817441promoter 内 22-33 bp - 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74821409-74826421(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAT
SmilChr08G001838 Chr08 NC_080394.1:15767475-15767486promoter 内 15-26 bp + 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 15761785-15763500(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATT
SmilChr07G001440 Chr07 NC_080393.1:11171008-11171019promoter 内 3949-3960 bp + 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 11158050-11170967(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTAC
SmilChr03G002103 Chr03 NC_080389.1:32589390-32589401promoter 内 3829-3840 bp - 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 32589562-32593681(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTACA
SmilChr08G003466 Chr08 NC_080394.1:37285550-37285561promoter 内 3508-3519 bp - 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 37286043-37287059(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCAC
SmilChr03G000658 Chr03 NC_080389.1:7342334-7342345promoter 内 3319-3330 bp + 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 7340706-7341663(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAGG
SmilChr07G001986 Chr07 NC_080393.1:17494632-17494643promoter 内 3206-3217 bp + 784 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 17490742-17493848(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTACT
SmilChr01G002700 Chr01 NC_080387.1:45269391-45269402promoter 内 3181-3192 bp + 809 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 45267047-45268582(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAGT
SmilChr03G001409 Chr03 NC_080389.1:16721080-16721091promoter 内 2932-2943 bp - 1058 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 16722149-16723906(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAGG
SmilChr04G002088 Chr04 NC_080390.1:33649060-33649071promoter 内 2826-2837 bp - 1164 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 33650235-33654137(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAC
SmilChr08G002679 Chr08 NC_080394.1:26322416-26322427promoter 内 2457-2468 bp - 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 26318252-26320883(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGTT
SmilChr06G003128 Chr06 NC_080392.1:44158062-44158073promoter 内 2320-2331 bp - 1670 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 44155512-44156392(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGGT
SmilChr07G003819 Chr07 NC_080393.1:47175093-47175104promoter 内 2097-2108 bp - 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 47171743-47173200(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGGT
SmilChr08G001999 Chr08 NC_080394.1:17728121-17728132promoter 内 1614-1625 bp - 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 17730508-17734003(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTACT