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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 95 / 138 下载 TSV

上一页 95 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004469 Chr01 NC_080387.1:62788415-62788427promoter 内 3204-3216 bp - 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 62786523-62787630(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTAGTTGACTATT
SmilChr02G004733 Chr02 NC_080388.1:69566290-69566302promoter 内 2911-2923 bp + 1078 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 69561938-69565212(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTAAGTCAACAAG
SmilChr01G003077 Chr01 NC_080387.1:49610316-49610328promoter 内 2690-2702 bp - 1299 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 49605095-49609017(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTTTTGACTAGG
SmilChr01G002360 Chr01 NC_080387.1:40771864-40771876promoter 内 2484-2496 bp + 1505 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 40764308-40770359(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACTAA
SmilChr01G000288 Chr01 NC_080387.1:5647782-5647794promoter 内 2243-2255 bp - 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 5649540-5652649(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGAAGTCAACAAT
SmilChr01G002395 Chr01 NC_080387.1:41266724-41266736promoter 内 1937-1949 bp + 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 41268788-41269814(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTTCT
SmilChr01G001120 Chr01 NC_080387.1:22823746-22823758promoter 内 1847-1859 bp + 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 22825900-22826668(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGTGTTGACTTCA
SmilChr03G002934 Chr03 NC_080389.1:46074818-46074830promoter 内 1814-1826 bp - 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 46077005-46079177(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACAAG
SmilChr03G003844 Chr03 NC_080389.1:57563247-57563259promoter 内 1620-1632 bp - 2369 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 57559897-57560878(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTGTTGACTCTA
SmilChr03G001158 Chr03 NC_080389.1:13352933-13352945promoter 内 1236-1248 bp - 2753 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 13355698-13357162(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAATCC
SmilChr01G004599 Chr01 NC_080387.1:63978951-63978963promoter 内 1144-1156 bp - 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 63981808-63989116(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCAGTCAACACA
SmilChr02G003861 Chr02 NC_080388.1:60528374-60528386promoter 内 811-823 bp + 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 60531564-60532579(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAGTTGACTATA
SmilChr01G001205 Chr01 NC_080387.1:24260903-24260915promoter 内 724-736 bp + 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 24264180-24277907(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGTTTGACTAAT
SmilChr02G005031 Chr02 NC_080388.1:72029480-72029492promoter 内 659-671 bp + 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 72032822-72037578(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTGTTGACTCAG
SmilChr02G002887 Chr02 NC_080388.1:49167119-49167131promoter 内 548-560 bp + 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 49170572-49173761(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTTCT
SmilChr03G002553 Chr03 NC_080389.1:40707780-40707792promoter 内 483-495 bp - 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 40711298-40712479(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAACTTG
SmilChr03G001819 Chr03 NC_080389.1:24851706-24851718promoter 内 362-374 bp + 3627 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 24846656-24848079(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAAAGT
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SmilChr02G003418 Chr02 NC_080388.1:55409088-55409100promoter 内 3980-3992 bp - 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55406754-55409079(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCAGTTGACTAGC
SmilChr02G000589 Chr02 NC_080388.1:8446584-8446596promoter 内 3973-3985 bp - 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 8446612-8447289(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGAAGTCAACACA
SmilChr03G004023 Chr03 NC_080389.1:59197647-59197659promoter 内 3920-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 59197728-59199496(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGTTTTGACTAAT
SmilChr01G004154 Chr01 NC_080387.1:60059393-60059405promoter 内 3909-3921 bp - 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 60059485-60062271(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAAAAAC
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SmilChr02G003394 Chr02 NC_080388.1:55052827-55052839promoter 内 3722-3734 bp + 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55047713-55052560(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAACTAA
SmilChr01G000386 Chr01 NC_080387.1:7969632-7969644promoter 内 3680-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7966289-7969323(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTGTTGACTAAG
SmilChr01G003078 Chr01 NC_080387.1:49610316-49610328promoter 内 3672-3684 bp - 317 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 49610645-49613660(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAAAAAC
SmilChr01G000876 Chr01 NC_080387.1:18626666-18626678promoter 内 3653-3665 bp - 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 18627014-18632149(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACTAT
SmilChr01G002545 Chr01 NC_080387.1:43540394-43540406promoter 内 3605-3617 bp - 384 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 43537481-43540010(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGTTGACTTAA
SmilChr01G006090 Chr01 NC_080387.1:76391025-76391037promoter 内 3597-3609 bp + 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 76391429-76392488(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTTCT
SmilChr01G000343 Chr01 NC_080387.1:7004283-7004295promoter 内 3540-3552 bp + 449 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7004744-7008154(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTGCT
SmilChr03G002488 Chr03 NC_080389.1:39557570-39557582promoter 内 3485-3497 bp + 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 39558086-39561065(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAGTTGACTCAT
SmilChr03G003669 Chr03 NC_080389.1:55530599-55530611promoter 内 3442-3454 bp - 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55524822-55530052(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCATTGACTATA
SmilChr01G001333 Chr01 NC_080387.1:26527123-26527135promoter 内 3409-3421 bp + 580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26527715-26528434(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTTCT
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SmilChr03G004244 Chr03 NC_080389.1:60956818-60956830promoter 内 3383-3395 bp + 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 60946300-60956212(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTAAGTCAACAAG
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SmilChr01G000637 Chr01 NC_080387.1:14311977-14311989promoter 内 3236-3248 bp - 753 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 14312742-14314457(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACTAA
SmilChr02G000356 Chr02 NC_080388.1:4593750-4593762promoter 内 3123-3135 bp - 866 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4594628-4601151(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCAGTCAACAAT
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SmilChr01G001216 Chr01 NC_080387.1:24429187-24429199promoter 内 3000-3012 bp + 989 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 24430188-24435397(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTTCT
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SmilChr02G000729 Chr02 NC_080388.1:11838084-11838096promoter 内 2842-2854 bp + 1147 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11835444-11836937(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTAAGTCAACAAG
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SmilChr01G005894 Chr01 NC_080387.1:74873742-74873754promoter 内 2631-2643 bp - 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 74870989-74872384(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGATTTGACTATT
SmilChr01G001334 Chr01 NC_080387.1:26527123-26527135promoter 内 2537-2549 bp + 1452 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26528587-26530877(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTTCT