转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G005851; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011948-RA_Salv SmilChr01G005851 MYB XP_057789306.1 MP00055 CAGATAAGGT

可能结合的靶基因

9685 个结合位点 6638 个候选靶基因 第 98 / 133 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005218 Chr02 NC_080388.1:73387091-73387100promoter 内 3331-3340 bp + 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73387761-73394913(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr01G000758 Chr01 NC_080387.1:16648785-16648794promoter 内 3286-3295 bp + 706 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 16649500-16652729(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr02G003881 Chr02 NC_080388.1:60879404-60879413promoter 内 3251-3260 bp + 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 60874429-60878663(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr02G000255 Chr02 NC_080388.1:3289632-3289641promoter 内 3188-3197 bp - 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 3285444-3288828(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr02G004323 Chr02 NC_080388.1:65532681-65532690promoter 内 3105-3114 bp + 887 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 65533577-65539802(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr01G005609 Chr01 NC_080387.1:72643032-72643041promoter 内 3030-3039 bp + 962 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 72636647-72642070(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G003363 Chr01 NC_080387.1:52378778-52378787promoter 内 2986-2995 bp + 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 52376428-52377772(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr03G000699 Chr03 NC_080389.1:7817786-7817795promoter 内 2845-2854 bp - 1147 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 7810854-7816639(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr01G005046 Chr01 NC_080387.1:68396499-68396508promoter 内 2707-2716 bp - 1285 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 68397793-68401166(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr02G000979 Chr02 NC_080388.1:17171488-17171497promoter 内 2656-2665 bp + 1336 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 17172833-17173870(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr02G000366 Chr02 NC_080388.1:4671875-4671884promoter 内 2622-2631 bp + 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 4673254-4673950(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr02G002688 Chr02 NC_080388.1:46554565-46554574promoter 内 2402-2411 bp - 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 46556164-46557568(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr02G004624 Chr02 NC_080388.1:68740114-68740123promoter 内 2228-2237 bp - 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 68741887-68742788(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr02G001506 Chr02 NC_080388.1:28087140-28087149promoter 内 2200-2209 bp - 1792 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 28088941-28091326(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr03G001090 Chr03 NC_080389.1:12606097-12606106promoter 内 2121-2130 bp - 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 12607977-12609094(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G000750 Chr01 NC_080387.1:16573948-16573957promoter 内 2086-2095 bp + 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 16575863-16581141(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr01G003808 Chr01 NC_080387.1:56451759-56451768promoter 内 1969-1978 bp - 2023 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 56453791-56457790(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr03G001049 Chr03 NC_080389.1:12221509-12221518promoter 内 1734-1743 bp - 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 12216912-12219251(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr01G005238 Chr01 NC_080387.1:69946251-69946260promoter 内 1698-1707 bp + 2294 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 69941803-69943957(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G002876 Chr01 NC_080387.1:47343994-47344003promoter 内 1691-1700 bp - 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 47346304-47347005(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G002838 Chr01 NC_080387.1:46967786-46967795promoter 内 1654-1663 bp - 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 46970133-46971150(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr02G003890 Chr02 NC_080388.1:60994131-60994140promoter 内 1607-1616 bp + 2385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 60996525-60999185(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr01G005689 Chr01 NC_080387.1:73181189-73181198promoter 内 1546-1555 bp + 2446 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73173717-73178743(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr03G000377 Chr03 NC_080389.1:4209782-4209791promoter 内 1515-1524 bp + 2477 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 4206521-4207305(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G000078 Chr01 NC_080387.1:1354098-1354107promoter 内 1357-1366 bp - 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 1349393-1351463(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr01G006176 Chr01 NC_080387.1:77290139-77290148promoter 内 1350-1359 bp + 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 77283353-77287497(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G002423 Chr01 NC_080387.1:41720735-41720744promoter 内 1332-1341 bp - 2660 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 41723404-41725471(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G000033 Chr01 NC_080387.1:549348-549357promoter 内 1290-1299 bp - 2702 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 552059-556937(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G003756 Chr01 NC_080387.1:55958504-55958513promoter 内 1219-1228 bp - 2773 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 55961286-55993711(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr02G004955 Chr02 NC_080388.1:71505464-71505473promoter 内 1141-1150 bp + 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 71495321-71502613(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr03G000105 Chr03 NC_080389.1:1169089-1169098promoter 内 1032-1041 bp + 2960 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 1172058-1175844(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr03G000883 Chr03 NC_080389.1:10026790-10026799promoter 内 964-973 bp - 3028 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 10022162-10023762(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr03G000724 Chr03 NC_080389.1:8138803-8138812promoter 内 881-890 bp + 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 8135586-8135692(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G001078 Chr01 NC_080387.1:22222811-22222820promoter 内 830-839 bp - 3162 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 22215795-22219649(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr02G003225 Chr02 NC_080388.1:53507148-53507157promoter 内 786-795 bp + 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 53502682-53503942(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr02G004322 Chr02 NC_080388.1:65532681-65532690promoter 内 677-686 bp + 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 65526925-65529366(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr02G001168 Chr02 NC_080388.1:21448552-21448561promoter 内 591-600 bp + 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 21441617-21445151(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G000030 Chr01 NC_080387.1:549348-549357promoter 内 554-563 bp - 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 544795-545910(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr02G000794 Chr02 NC_080388.1:13107647-13107656promoter 内 489-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 13111159-13114865(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr02G004479 Chr02 NC_080388.1:67217328-67217337promoter 内 377-386 bp - 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 67220952-67222163(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G001258 Chr01 NC_080387.1:25282982-25282991promoter 内 335-344 bp + 3657 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 25265830-25279325(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr01G003806 Chr01 NC_080387.1:56451759-56451768promoter 内 307-316 bp - 3685 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 56446152-56448074(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr01G005860 Chr01 NC_080387.1:74530021-74530030promoter 内 254-263 bp - 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 74524119-74526283(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr02G005191 Chr02 NC_080388.1:73195635-73195644promoter 内 220-229 bp + 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73199416-73201412(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr01G000074 Chr01 NC_080387.1:1306603-1306612promoter 内 151-160 bp - 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 1298878-1302762(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCT
SmilChr01G002279 Chr01 NC_080387.1:39578587-39578596promoter 内 85-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 39582503-39591376(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTC
SmilChr02G004249 Chr02 NC_080388.1:64666374-64666383promoter 内 1905-1914 bp - 2087 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 64668470-64669673(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CGCTTATCTC
SmilChr02G004127 Chr02 NC_080388.1:63524801-63524810promoter 内 529-538 bp + 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 63520369-63521338(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CGCTTATCTC
SmilChr01G004825 Chr01 NC_080387.1:66418300-66418309promoter 内 2655-2664 bp - 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 66419646-66425315(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CGCTTATCTC
SmilChr02G004263 Chr02 NC_080388.1:64834983-64834992promoter 内 2578-2587 bp + 1414 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 64828012-64833569(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CGCTTATCTC