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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 98 / 142 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002794 Chr01 NC_080387.1:46450057-46450071promoter 内 225-239 bp + 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 46443274-46446295(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GATGGAGTAGGTGGT
SmilChr03G001009 Chr03 NC_080389.1:11568562-11568576promoter 内 211-225 bp + 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 11572352-11573228(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACTTTCAG
SmilChr04G002636 Chr04 NC_080390.1:41759280-41759294promoter 内 3954-3968 bp + 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 41759327-41761402(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACTACTTC
SmilChr07G002289 Chr07 NC_080393.1:21174658-21174672promoter 内 3946-3960 bp + 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 21174467-21174617(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAAGTAGTAGGTGTA
SmilChr02G000819 Chr02 NC_080388.1:13794431-13794445promoter 内 3943-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 13793998-13794387(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACTTTCAG
SmilChr05G003255 Chr05 NC_080391.1:42062286-42062300promoter 内 3943-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 42061631-42062242(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACTTTCAG
SmilChr01G004626 Chr01 NC_080387.1:64316302-64316316promoter 内 3921-3935 bp - 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 64304875-64316236(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTAACAACTT
SmilChr08G002984 Chr08 NC_080394.1:29962726-29962740promoter 内 3893-3907 bp - 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 29962834-30016336(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TAACTGGTAGGTGAC
SmilChr06G003084 Chr06 NC_080392.1:43711753-43711767promoter 内 3885-3899 bp - 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 43711869-43720328(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTGCAGTAGGTGAC
SmilChr07G000596 Chr07 NC_080393.1:4068431-4068445promoter 内 3855-3869 bp + 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 4067376-4068299(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr08G004763 Chr08 NC_080394.1:56988137-56988151promoter 内 3842-3856 bp - 145 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 56988296-56990510(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G003857 Chr01 NC_080387.1:56849066-56849080promoter 内 3826-3840 bp - 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 56849241-56853420(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G003566 Chr01 NC_080387.1:54243902-54243916promoter 内 3809-3823 bp + 178 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54242166-54243724(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TAGAAGGTAGGTATG
SmilChr06G002524 Chr06 NC_080392.1:36204848-36204862promoter 内 3807-3821 bp - 180 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 36201530-36204668(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
SmilChr02G002876 Chr02 NC_080388.1:49008645-49008659promoter 内 3805-3819 bp + 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49008841-49014202(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
SmilChr06G000854 Chr06 NC_080392.1:8085241-8085255promoter 内 3804-3818 bp + 183 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 8084091-8085058(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G000688 Chr01 NC_080387.1:15392909-15392923promoter 内 3776-3790 bp - 211 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 15393134-15396782(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr04G003547 Chr04 NC_080390.1:51818486-51818500promoter 内 3771-3785 bp + 216 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 51818716-51820269(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
SmilChr04G001783 Chr04 NC_080390.1:29248404-29248418promoter 内 3761-3775 bp - 226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 29240628-29248178(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
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SmilChr02G002045 Chr02 NC_080388.1:36830868-36830882promoter 内 3741-3755 bp + 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 36829845-36830622(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr02G004788 Chr02 NC_080388.1:70034445-70034459promoter 内 3712-3726 bp + 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 70032069-70034170(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G000057 Chr03 NC_080389.1:536937-536951promoter 内 3710-3724 bp + 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 537228-672388(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
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SmilChr02G004018 Chr02 NC_080388.1:62476168-62476182promoter 内 3671-3685 bp - 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 62476498-62479981(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr05G003460 Chr05 NC_080391.1:46009664-46009678promoter 内 3649-3663 bp - 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 46007901-46009326(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
SmilChr03G001464 Chr03 NC_080389.1:17502092-17502106promoter 内 3638-3652 bp + 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 17499893-17501743(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr08G001889 Chr08 NC_080394.1:16395202-16395216promoter 内 3636-3650 bp - 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 16395567-16396396(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGGTTAGTAGGTGAA
SmilChr03G001395 Chr03 NC_080389.1:16547674-16547688promoter 内 3630-3644 bp + 357 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 16545470-16547317(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr04G000983 Chr04 NC_080390.1:13252024-13252038promoter 内 3628-3642 bp - 359 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 13250427-13251665(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACTTTCAG
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SmilChr04G003871 Chr04 NC_080390.1:54603355-54603369promoter 内 3617-3631 bp - 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54603739-54615388(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CAGTAGGTAGGTGAT
SmilChr07G004207 Chr07 NC_080393.1:54245095-54245109promoter 内 3592-3606 bp + 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54245504-54251144(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
SmilChr06G000113 Chr06 NC_080392.1:802872-802886promoter 内 3586-3600 bp + 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 795578-802471(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr04G001401 Chr04 NC_080390.1:22791234-22791248promoter 内 3531-3545 bp - 456 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 22791704-22792840(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCAATGGTAGGTAGC
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SmilChr04G003530 Chr04 NC_080390.1:51659918-51659932promoter 内 3518-3532 bp - 469 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 51660401-51660480(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
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SmilChr07G001411 Chr07 NC_080393.1:10985051-10985065promoter 内 3506-3520 bp + 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10974393-10984570(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr08G001221 Chr08 NC_080394.1:9843877-9843891promoter 内 3505-3519 bp + 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 9844373-9847637(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
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SmilChr01G003070 Chr01 NC_080387.1:49550870-49550884promoter 内 3493-3507 bp - 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49544645-49550376(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
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SmilChr01G002730 Chr01 NC_080387.1:45657605-45657619promoter 内 3480-3494 bp + 507 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 45658126-45662265(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT