转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 10 / 149 下载 TSV

上一页 10 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003402 Chr03 NC_080389.1:52388045-52388055promoter 内 3351-3361 bp - 640 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 52388695-52390012(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr06G002855 Chr06 NC_080392.1:41314943-41314953promoter 内 3344-3354 bp + 647 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 41307536-41314296(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr01G002099 Chr01 NC_080387.1:37031487-37031497promoter 内 3289-3299 bp + 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 37029265-37030785(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr06G002552 Chr06 NC_080392.1:36665847-36665857promoter 内 3198-3208 bp - 793 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 36666650-36669164(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr05G000054 Chr05 NC_080391.1:253430-253440promoter 内 3088-3098 bp - 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 254343-255586(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr02G003903 Chr02 NC_080388.1:61113432-61113442promoter 内 2991-3001 bp + 1000 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 61114442-61115851(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr07G000148 Chr07 NC_080393.1:887481-887491promoter 内 2954-2964 bp + 1037 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 883897-886444(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr07G002729 Chr07 NC_080393.1:26751286-26751296promoter 内 2954-2964 bp + 1037 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 26747113-26750249(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr06G000671 Chr06 NC_080392.1:5884642-5884652promoter 内 2898-2908 bp + 1093 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 5881993-5883549(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr07G002616 Chr07 NC_080393.1:25259621-25259631promoter 内 2825-2835 bp - 1166 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 25257019-25258455(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr02G005293 Chr02 NC_080388.1:73917159-73917169promoter 内 2785-2795 bp - 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 73915211-73915953(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr02G001684 Chr02 NC_080388.1:31074501-31074511promoter 内 2564-2574 bp + 1427 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 31070324-31073074(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr01G005592 Chr01 NC_080387.1:72567730-72567740promoter 内 2523-2533 bp - 1468 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 72569208-72572399(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr04G003124 Chr04 NC_080390.1:47855334-47855344promoter 内 2508-2518 bp - 1483 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 47851420-47853851(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr04G001660 Chr04 NC_080390.1:27563744-27563754promoter 内 2469-2479 bp + 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 27565276-27583680(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCGAGCTGTCA
SmilChr03G004170 Chr03 NC_080389.1:60452346-60452356promoter 内 2422-2432 bp - 1569 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 60447240-60450777(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGCT
SmilChr03G002899 Chr03 NC_080389.1:45706503-45706513promoter 内 2378-2388 bp + 1613 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 45703259-45704890(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr04G001961 Chr04 NC_080390.1:31801865-31801875promoter 内 2358-2368 bp - 1633 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 31799343-31800232(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGCT
SmilChr03G004290 Chr03 NC_080389.1:61309132-61309142promoter 内 2327-2337 bp - 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 61310806-61314240(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGG
SmilChr03G003894 Chr03 NC_080389.1:58045210-58045220promoter 内 2324-2334 bp + 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 58046887-58050554(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr03G002898 Chr03 NC_080389.1:45706503-45706513promoter 内 2302-2312 bp + 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 45700987-45704814(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr03G001218 Chr03 NC_080389.1:13992076-13992086promoter 内 2214-2224 bp + 1777 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 13987394-13990299(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr02G001835 Chr02 NC_080388.1:33441354-33441364promoter 内 2184-2194 bp - 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 33436143-33439547(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr06G002078 Chr06 NC_080392.1:27400165-27400175promoter 内 2020-2030 bp - 1971 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 27402146-27404738(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGG
SmilChr02G004947 Chr02 NC_080388.1:71416430-71416440promoter 内 1816-1826 bp - 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 71411893-71414255(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr05G004014 Chr05 NC_080391.1:54086877-54086887promoter 内 1798-1808 bp - 2193 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 54082776-54084684(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr05G004206 Chr05 NC_080391.1:55955212-55955222promoter 内 1779-1789 bp - 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 55957434-55960711(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr03G001753 Chr03 NC_080389.1:23807375-23807385promoter 内 1777-1787 bp - 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 23809599-23813666(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr01G003661 Chr01 NC_080387.1:55034920-55034930promoter 内 1725-1735 bp - 2266 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 55031026-55032654(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr02G002202 Chr02 NC_080388.1:39233439-39233449promoter 内 1663-1673 bp + 2328 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 39235777-39236404(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr01G000193 Chr01 NC_080387.1:3339707-3339717promoter 内 1653-1663 bp + 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 3342055-3344608(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCGAGCTGTCA
SmilChr02G001836 Chr02 NC_080388.1:33441354-33441364promoter 内 1574-1584 bp - 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 33437364-33438937(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr02G005097 Chr02 NC_080388.1:72542152-72542162promoter 内 1545-1555 bp + 2446 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 72534141-72539706(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr04G002885 Chr04 NC_080390.1:45052935-45052945promoter 内 1423-1433 bp + 2568 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 45055513-45056951(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr06G000471 Chr06 NC_080392.1:3841302-3841312promoter 内 1397-1407 bp - 2594 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 3843906-3845716(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr03G001232 Chr03 NC_080389.1:14243169-14243179promoter 内 1383-1393 bp - 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 14245787-14247148(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr02G000006 Chr02 NC_080388.1:54049-54059promoter 内 1364-1374 bp + 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 56686-58534(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
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SmilChr07G002938 Chr07 NC_080393.1:29753213-29753223promoter 内 1337-1347 bp - 2654 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 29755877-29757512(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGG
SmilChr02G002853 Chr02 NC_080388.1:48711784-48711794promoter 内 1306-1316 bp + 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 48714479-48715254(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr06G000670 Chr06 NC_080392.1:5884642-5884652promoter 内 1268-1278 bp + 2723 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 5877930-5881919(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr04G001716 Chr04 NC_080390.1:28379454-28379464promoter 内 1205-1215 bp + 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 28374365-28376668(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr06G002521 Chr06 NC_080392.1:36165187-36165197promoter 内 1126-1136 bp + 2865 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 36159650-36162322(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr07G001466 Chr07 NC_080393.1:11510113-11510123promoter 内 1056-1066 bp + 2935 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 11504561-11507178(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr07G001524 Chr07 NC_080393.1:12227909-12227919promoter 内 1004-1014 bp + 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 12230906-12255744(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr03G001158 Chr03 NC_080389.1:13352620-13352630promoter 内 923-933 bp - 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 13355698-13357162(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCGC
SmilChr04G002883 Chr04 NC_080390.1:45052935-45052945promoter 内 910-920 bp + 3081 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 45048692-45049854(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr02G001116 Chr02 NC_080388.1:20120411-20120421promoter 内 881-891 bp - 3110 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 20114751-20117301(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr02G001416 Chr02 NC_080388.1:26786397-26786407promoter 内 865-875 bp + 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 26779584-26783271(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr01G005591 Chr01 NC_080387.1:72567730-72567740promoter 内 768-778 bp - 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 72563606-72564507(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA