转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 10 / 164 下载 TSV

上一页 10 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003131 Chr04 NC_080390.1:47906552-47906566promoter 内 2814-2828 bp + 1173 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 47903741-47905379(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr03G004040 Chr03 NC_080389.1:59405628-59405642promoter 内 2806-2820 bp - 1181 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 59401010-59404447(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr05G003250 Chr05 NC_080391.1:41879703-41879717promoter 内 2804-2818 bp + 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 41880900-41886164(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G003629 Chr02 NC_080388.1:57624540-57624554promoter 内 2796-2810 bp + 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 57622191-57623349(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr06G001036 Chr06 NC_080392.1:10276879-10276893promoter 内 2785-2799 bp + 1202 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 10274597-10275677(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr02G004851 Chr02 NC_080388.1:70672424-70672438promoter 内 2773-2787 bp - 1214 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 70673652-70678006(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr03G000555 Chr03 NC_080389.1:6011233-6011247promoter 内 2770-2784 bp - 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 6006474-6010016(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G003321 Chr02 NC_080388.1:54465403-54465417promoter 内 2766-2780 bp - 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 54466638-54472850(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr01G002978 Chr01 NC_080387.1:48721359-48721373promoter 内 2763-2777 bp + 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 48722597-48727893(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G005385 Chr02 NC_080388.1:74505341-74505355promoter 内 2759-2773 bp + 1228 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 74501887-74504113(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr08G000917 Chr08 NC_080394.1:6786050-6786064promoter 内 2743-2757 bp - 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 6787308-6789453(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr01G004483 Chr01 NC_080387.1:62961719-62961733promoter 内 2730-2744 bp + 1257 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 62962990-62965431(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr06G001696 Chr06 NC_080392.1:19391491-19391505promoter 内 2717-2731 bp + 1270 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 19383692-19390221(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr08G000875 Chr08 NC_080394.1:6491530-6491544promoter 内 2716-2730 bp - 1271 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 6488992-6490259(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr06G001419 Chr06 NC_080392.1:14897654-14897668promoter 内 2676-2690 bp + 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 14898979-14900473(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G001675 Chr08 NC_080394.1:13995454-13995468promoter 内 2655-2669 bp - 1332 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 13992994-13994122(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G002093 Chr02 NC_080388.1:37561064-37561078promoter 内 2644-2658 bp - 1343 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 37562421-37566383(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr07G000669 Chr07 NC_080393.1:4534807-4534821promoter 内 2636-2650 bp - 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 4536172-4538600(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr08G000439 Chr08 NC_080394.1:3152581-3152595promoter 内 2632-2646 bp - 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 3153950-3157537(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr02G003318 Chr02 NC_080388.1:54455772-54455786promoter 内 2629-2643 bp + 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 54453435-54454414(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACCTCGAT
SmilChr07G001913 Chr07 NC_080393.1:16537232-16537246promoter 内 2614-2628 bp - 1373 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 16530812-16535859(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G002327 Chr08 NC_080394.1:21950910-21950924promoter 内 2602-2616 bp + 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 21943961-21949525(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACCAGCCG
SmilChr06G002564 Chr06 NC_080392.1:36828875-36828889promoter 内 2599-2613 bp - 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 36830277-36834030(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr08G001597 Chr08 NC_080394.1:13197494-13197508promoter 内 2599-2613 bp + 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 13196025-13196106(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr06G000418 Chr06 NC_080392.1:3476401-3476415promoter 内 2580-2594 bp + 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 3472685-3474994(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr03G002604 Chr03 NC_080389.1:41428214-41428228promoter 内 2578-2592 bp - 1409 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 41429637-41432804(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr02G004164 Chr02 NC_080388.1:63959320-63959334promoter 内 2577-2591 bp + 1410 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 63960744-63963558(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G003003 Chr01 NC_080387.1:49025689-49025703promoter 内 2570-2584 bp - 1417 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 49021629-49024272(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr05G002977 Chr05 NC_080391.1:36294330-36294344promoter 内 2570-2584 bp - 1417 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 36289048-36292913(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G000903 Chr08 NC_080394.1:6691279-6691293promoter 内 2554-2568 bp + 1433 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 6688781-6689846(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr02G005384 Chr02 NC_080388.1:74497451-74497465promoter 内 2546-2560 bp + 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 74494794-74496010(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCCCCTA
SmilChr01G004240 Chr01 NC_080387.1:60720356-60720370promoter 内 2534-2548 bp + 1453 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 60715424-60718903(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACCAGCAA
SmilChr08G001453 Chr08 NC_080394.1:11694783-11694797promoter 内 2520-2534 bp + 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 11696264-11702898(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G003320 Chr02 NC_080388.1:54465403-54465417promoter 内 2519-2533 bp - 1468 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 54458988-54463935(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G005814 Chr01 NC_080387.1:74137697-74137711promoter 内 2480-2494 bp + 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 74139218-74141307(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CGGCTGGTAGGTGGG
SmilChr07G002507 Chr07 NC_080393.1:23779055-23779069promoter 内 2479-2493 bp + 1508 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 23780577-23781203(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G003557 Chr02 NC_080388.1:56741935-56741949promoter 内 2475-2489 bp - 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 56743461-56746354(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr04G000047 Chr04 NC_080390.1:436066-436080promoter 内 2466-2480 bp - 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 424179-434545(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr06G002645 Chr06 NC_080392.1:38229119-38229133promoter 内 2465-2479 bp + 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 38230655-38234680(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G003886 Chr02 NC_080388.1:60933826-60933840promoter 内 2461-2475 bp + 1526 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 60928608-60932300(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr07G000861 Chr07 NC_080393.1:6131014-6131028promoter 内 2459-2473 bp - 1528 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 6132556-6142055(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr05G004120 Chr05 NC_080391.1:55106496-55106510promoter 内 2449-2463 bp + 1538 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 55108048-55113002(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G003505 Chr02 NC_080388.1:56239030-56239044promoter 内 2441-2455 bp - 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 56240590-56243338(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr06G002497 Chr06 NC_080392.1:35839934-35839948promoter 内 2433-2447 bp - 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 35836765-35838380(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G005116 Chr01 NC_080387.1:68946156-68946170promoter 内 2414-2428 bp - 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 68947743-68949016(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr04G000585 Chr04 NC_080390.1:6496429-6496443promoter 内 2401-2415 bp + 1586 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 6498029-6499664(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G005114 Chr01 NC_080387.1:68912898-68912912promoter 内 2400-2414 bp - 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 68914499-68919240(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr06G002491 Chr06 NC_080392.1:35788752-35788766promoter 内 2395-2409 bp - 1592 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 35785569-35787160(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr07G000722 Chr07 NC_080393.1:5026728-5026742promoter 内 2383-2397 bp - 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 5023494-5025124(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G004862 Chr02 NC_080388.1:70752578-70752592promoter 内 2380-2394 bp - 1607 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 70749785-70750971(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA