转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 100 / 139 下载 TSV

上一页 100 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000712 Chr01 NC_080387.1:15891025-15891036promoter 内 2267-2278 bp + 1723 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 15892759-15905581(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGAG
SmilChr01G002622 Chr01 NC_080387.1:44492198-44492209promoter 内 2249-2260 bp - 1741 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 44489247-44490457(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGAG
SmilChr03G000239 Chr03 NC_080389.1:2842948-2842959promoter 内 2211-2222 bp + 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2839891-2841169(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACGTCACCA
SmilChr02G005529 Chr02 NC_080388.1:75357984-75357995promoter 内 2197-2208 bp - 1793 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 75354839-75356191(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTGAT
SmilChr04G003248 Chr04 NC_080390.1:49237534-49237545promoter 内 2138-2149 bp + 1852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 49239397-49240589(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTGAT
SmilChr02G001570 Chr02 NC_080388.1:29121625-29121636promoter 内 2127-2138 bp - 1863 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 29123499-29124937(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCACGTCAGTG
SmilChr04G003904 Chr04 NC_080390.1:54815012-54815023promoter 内 2118-2129 bp + 1872 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54810042-54813140(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCAGGT
SmilChr02G002870 Chr02 NC_080388.1:48891188-48891199promoter 内 2043-2054 bp - 1947 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 48887838-48889241(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTGAA
SmilChr03G000161 Chr03 NC_080389.1:1771574-1771585promoter 内 1818-1829 bp + 2172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 1773757-1777973(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTGAA
SmilChr01G001287 Chr01 NC_080387.1:25653098-25653109promoter 内 1723-1734 bp - 2267 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 25655376-25656574(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCAGAT
SmilChr02G000984 Chr02 NC_080388.1:17324761-17324772promoter 内 1716-1727 bp + 2274 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 17319604-17322487(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCAGTT
SmilChr01G001530 Chr01 NC_080387.1:29294653-29294664promoter 内 1710-1721 bp - 2280 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 29290857-29292373(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGTTGA
SmilChr01G000599 Chr01 NC_080387.1:13042897-13042908promoter 内 1663-1674 bp - 2327 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 13045235-13048296(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCACCA
SmilChr04G001341 Chr04 NC_080390.1:21666238-21666249promoter 内 1430-1441 bp - 2560 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 21668809-21671642(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCACGTCAGTG
SmilChr04G003891 Chr04 NC_080390.1:54715138-54715149promoter 内 1317-1328 bp + 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54708529-54712465(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCTACGTCAGCC
SmilChr04G000939 Chr04 NC_080390.1:12375623-12375634promoter 内 1262-1273 bp + 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12378362-12380127(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGCT
SmilChr02G000784 Chr02 NC_080388.1:12888486-12888497promoter 内 1142-1153 bp - 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12884119-12885638(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGCT
SmilChr02G002187 Chr02 NC_080388.1:39079391-39079402promoter 内 1120-1131 bp + 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 39074556-39076521(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCAACGTCAGCC
SmilChr01G005411 Chr01 NC_080387.1:71345050-71345061promoter 内 1087-1098 bp + 2903 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 71347964-71351252(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTGAT
SmilChr01G005026 Chr01 NC_080387.1:68230051-68230062promoter 内 780-791 bp - 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 68217077-68226841(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTAGG
SmilChr04G001340 Chr04 NC_080390.1:21666238-21666249promoter 内 715-726 bp - 3275 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 21662247-21662963(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTGAA
SmilChr02G004514 Chr02 NC_080388.1:67674322-67674333promoter 内 657-668 bp + 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 67677666-67680939(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGAG
SmilChr04G003217 Chr04 NC_080390.1:49004803-49004814promoter 内 630-641 bp + 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 48993368-49001443(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCAACGTCAGCG
SmilChr01G000492 Chr01 NC_080387.1:9979165-9979176promoter 内 604-615 bp - 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 9972478-9975779(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGCT
SmilChr04G004173 Chr04 NC_080390.1:56361514-56361525promoter 内 502-513 bp - 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56354676-56358026(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGTTGT
SmilChr02G003426 Chr02 NC_080388.1:55469651-55469662promoter 内 306-317 bp - 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 55461968-55465967(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTGAA
SmilChr01G000571 Chr01 NC_080387.1:11844775-11844786promoter 内 198-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 11848578-11851497(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGCC
SmilChr01G002866 Chr01 NC_080387.1:47268453-47268464promoter 内 38-49 bp - 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47272416-47277854(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCAACGTCAGCT
SmilChr01G005897 Chr01 NC_080387.1:74889550-74889561promoter 内 31-42 bp + 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74881056-74885591(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCACGTCATCT
SmilChr02G002189 Chr02 NC_080388.1:39079391-39079402promoter 内 4-15 bp + 3986 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 39083388-39087574(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGTTGA
SmilChr04G000113 Chr04 NC_080390.1:986978-986989promoter 内 757-768 bp + 3233 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 4 980419-983745(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCACG
SmilChr01G001486 Chr01 NC_080387.1:28649401-28649412promoter 内 3411-3422 bp + 579 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 28647329-28648822(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTCAC
SmilChr02G003289 Chr02 NC_080388.1:54167225-54167236promoter 内 3909-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 54165330-54167144(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTCTG
SmilChr01G000837 Chr01 NC_080387.1:18087151-18087162promoter 内 3792-3803 bp - 198 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 18083466-18086953(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATGAGACGTGGG
SmilChr01G003667 Chr01 NC_080387.1:55094626-55094637promoter 内 3387-3398 bp - 603 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 55090903-55094023(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCTGACGTGTA
SmilChr03G001799 Chr03 NC_080389.1:24610692-24610703promoter 内 3004-3015 bp - 986 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 24605563-24609706(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTGGACGTGGG
SmilChr03G004307 Chr03 NC_080389.1:61422440-61422451promoter 内 2781-2792 bp - 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 61418542-61421231(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAAAGACGTGGG
SmilChr02G000261 Chr02 NC_080388.1:3364635-3364646promoter 内 2579-2590 bp + 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 3366057-3369031(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTGACGTTGC
SmilChr02G000349 Chr02 NC_080388.1:4524695-4524706promoter 内 2423-2434 bp + 1567 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 4519587-4523128(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCCCCC
SmilChr01G000681 Chr01 NC_080387.1:15040425-15040436promoter 内 1190-1201 bp - 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 15043236-15043949(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTTAC
SmilChr01G003589 Chr01 NC_080387.1:54430866-54430877promoter 内 524-535 bp - 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 54434343-54437470(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTTGA
SmilChr01G005424 Chr01 NC_080387.1:71427739-71427750promoter 内 443-454 bp - 3547 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 71419189-71424192(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGAGACGTGGA
SmilChr03G001683 Chr03 NC_080389.1:22215549-22215560promoter 内 381-392 bp - 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 22208652-22211940(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTGACGTAGC
SmilChr01G002278 Chr01 NC_080387.1:39544022-39544033promoter 内 99-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 39547924-39548787(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAGAGACGTGGG
SmilChr02G004784 Chr02 NC_080388.1:70016417-70016428promoter 内 3955-3966 bp + 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 70015359-70016382(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTCAC
SmilChr01G003588 Chr01 NC_080387.1:54430866-54430877promoter 内 3953-3964 bp - 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54430914-54433917(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTTGA
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SmilChr01G002712 Chr01 NC_080387.1:45368132-45368143promoter 内 3922-3933 bp - 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 45368211-45371658(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAA
SmilChr04G002426 Chr04 NC_080390.1:38903601-38903612promoter 内 3891-3902 bp - 99 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 38899046-38903502(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGGCACGTGGC
SmilChr01G003185 Chr01 NC_080387.1:50607925-50607936promoter 内 3654-3665 bp - 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 50608272-50610918(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAGACGTCAGGC