转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 104 / 143 下载 TSV

上一页 104 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000652 Chr01 NC_080387.1:14505237-14505248promoter 内 1204-1215 bp - 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 14501665-14502451(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAGG
SmilChr08G003540 Chr08 NC_080394.1:38046344-38046355promoter 内 1129-1140 bp + 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 38049216-38050679(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAA
SmilChr03G003001 Chr03 NC_080389.1:46819478-46819489promoter 内 1074-1085 bp + 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 46822405-46828848(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTCAT
SmilChr05G004197 Chr05 NC_080391.1:55839933-55839944promoter 内 986-997 bp - 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 55832925-55836929(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAA
SmilChr01G004459 Chr01 NC_080387.1:62706672-62706683promoter 内 981-992 bp + 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 62709692-62712192(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAA
SmilChr05G003051 Chr05 NC_080391.1:38271039-38271050promoter 内 972-983 bp + 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 38274068-38274871(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCAC
SmilChr03G000462 Chr03 NC_080389.1:4941936-4941947promoter 内 946-957 bp + 3044 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 4944991-4950450(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTAAA
SmilChr05G001882 Chr05 NC_080391.1:19089138-19089149promoter 内 942-953 bp + 3048 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 19092197-19094948(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAA
SmilChr02G004569 Chr02 NC_080388.1:68209442-68209453promoter 内 907-918 bp + 3083 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 68201051-68206359(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTATG
SmilChr02G004021 Chr02 NC_080388.1:62502731-62502742promoter 内 891-902 bp - 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 62505841-62511511(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCAG
SmilChr01G004867 Chr01 NC_080387.1:66796803-66796814promoter 内 887-898 bp - 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 66790523-66793700(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTAGA
SmilChr03G001731 Chr03 NC_080389.1:23266812-23266823promoter 内 886-897 bp - 3104 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 23261323-23263708(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAA
SmilChr05G001485 Chr05 NC_080391.1:13623587-13623598promoter 内 851-862 bp - 3139 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 13619180-13620448(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCAAGCTGTA
SmilChr03G003116 Chr03 NC_080389.1:48286250-48286261promoter 内 839-850 bp + 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 48289412-48291694(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAGG
SmilChr06G000165 Chr06 NC_080392.1:1151320-1151331promoter 内 818-829 bp + 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1146771-1148148(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCCG
SmilChr02G003420 Chr02 NC_080388.1:55418519-55418530promoter 内 671-682 bp + 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 55421849-55423989(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTAAA
SmilChr08G002708 Chr08 NC_080394.1:26647520-26647531promoter 内 670-681 bp + 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 26643383-26644200(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCCT
SmilChr01G004088 Chr01 NC_080387.1:59284242-59284253promoter 内 528-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 59287715-59289915(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAA
SmilChr01G004487 Chr01 NC_080387.1:63002957-63002968promoter 内 473-484 bp - 3517 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 63006485-63009676(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCGA
SmilChr08G001364 Chr08 NC_080394.1:10891023-10891034promoter 内 363-374 bp - 3627 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10885175-10887396(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGGG
SmilChr04G002811 Chr04 NC_080390.1:44115113-44115124promoter 内 321-332 bp + 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 44108660-44111444(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGG
SmilChr02G004571 Chr02 NC_080388.1:68209442-68209453promoter 内 263-274 bp + 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 68213180-68218239(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGGG
SmilChr06G003182 Chr06 NC_080392.1:44733621-44733632promoter 内 223-234 bp - 3767 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 44737399-44741846(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCAG
SmilChr03G002646 Chr03 NC_080389.1:42103533-42103544promoter 内 216-227 bp + 3774 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 42095707-42099759(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCAG
SmilChr03G003255 Chr03 NC_080389.1:50450255-50450266promoter 内 184-195 bp - 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 50441858-50446449(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTCAT
SmilChr06G000103 Chr06 NC_080392.1:733329-733340promoter 内 151-162 bp + 3839 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 737179-739091(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAA
SmilChr03G000522 Chr03 NC_080389.1:5607087-5607098promoter 内 98-109 bp + 3892 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5610990-5611799(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGGG
SmilChr01G004794 Chr01 NC_080387.1:66173695-66173706promoter 内 2509-2520 bp + 1481 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 66175187-66177862(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGAA
SmilChr07G000400 Chr07 NC_080393.1:2761779-2761790promoter 内 3026-3037 bp - 964 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 2762754-2766447(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTATG
SmilChr03G003275 Chr03 NC_080389.1:50695746-50695757promoter 内 2962-2973 bp - 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 50696785-50699161(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGTGA
SmilChr05G002611 Chr05 NC_080391.1:29393570-29393581promoter 内 2031-2042 bp + 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 29395540-29396278(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAAA
SmilChr03G003273 Chr03 NC_080389.1:50695746-50695757promoter 内 1946-1957 bp - 2044 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 50689598-50693702(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCACCAGCTGTA
SmilChr05G002326 Chr05 NC_080391.1:25091214-25091225promoter 内 1597-1608 bp - 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 25084366-25088821(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGGT
SmilChr05G002330 Chr05 NC_080391.1:25157410-25157421promoter 内 1523-1534 bp - 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 25150749-25154943(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGGT
SmilChr01G006037 Chr01 NC_080387.1:75872314-75872325promoter 内 1230-1241 bp - 2760 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 75875085-75878965(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTATG
SmilChr01G006035 Chr01 NC_080387.1:75872314-75872325promoter 内 849-860 bp - 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 75867731-75869173(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGGT
SmilChr03G000121 Chr03 NC_080389.1:1305341-1305352promoter 内 696-707 bp - 3294 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 1308646-1313469(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATC
SmilChr07G000555 Chr07 NC_080393.1:3831612-3831623promoter 内 3960-3971 bp + 30 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3823636-3831582(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAACTGTCAA
SmilChr05G004246 Chr05 NC_080391.1:56256647-56256658promoter 内 3919-3930 bp - 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56256729-56257476(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCTC
SmilChr05G003116 Chr05 NC_080391.1:39699972-39699983promoter 内 3699-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 39698658-39699681(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr07G003976 Chr07 NC_080393.1:50670356-50670367promoter 内 3683-3694 bp - 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 50668795-50670049(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr02G003596 Chr02 NC_080388.1:57152739-57152750promoter 内 3632-3643 bp + 358 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 57151576-57152381(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATC
SmilChr05G001303 Chr05 NC_080391.1:11251721-11251732promoter 内 3579-3590 bp - 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11252143-11254400(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAACTGTCAA
SmilChr06G002371 Chr06 NC_080392.1:34564308-34564319promoter 内 3448-3459 bp - 542 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34561126-34563766(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAG
SmilChr08G001272 Chr08 NC_080394.1:10138791-10138802promoter 内 3380-3391 bp + 610 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 10132537-10138181(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCTC
SmilChr05G003272 Chr05 NC_080391.1:42518985-42518996promoter 内 3369-3380 bp + 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 42519617-42521283(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGAC
SmilChr07G004508 Chr07 NC_080393.1:57745731-57745742promoter 内 3344-3355 bp - 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 57743332-57745085(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAG
SmilChr03G001015 Chr03 NC_080389.1:11668402-11668413promoter 内 3301-3312 bp + 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11669102-11672581(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr05G002480 Chr05 NC_080391.1:27338688-27338699promoter 内 3227-3238 bp - 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27339462-27345674(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAACTGTCAA
SmilChr03G002775 Chr03 NC_080389.1:44146712-44146723promoter 内 3145-3156 bp + 845 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44144140-44145867(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAACTGTCAA