靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00011094-RA_Salv |
SmilChr01G004552 |
bZIP | XP_057786668.1 |
MP00409 |
AATGGACACGTGGCA |
8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 107 / 126 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 结合可能性 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr05G000519 |
Chr05 | NC_080391.1:3997978-3997992promoter 内 1681-1695 bp |
- | 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 3994482-3995672(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TCTGCTTACGTGGCG |
SmilChr01G005991 |
Chr01 | NC_080387.1:75520408-75520422promoter 内 1566-1580 bp |
- | 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 75515833-75517987(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TTTCATGACGTGGCT |
SmilChr01G005995 |
Chr01 | NC_080387.1:75549062-75549076promoter 内 1566-1580 bp |
+ | 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 75543753-75546641(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
AGCCACGTCATGAAA |
SmilChr02G003185 |
Chr02 | NC_080388.1:52996346-52996360promoter 内 1555-1569 bp |
- | 2432 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 52998792-53001288(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TTCCACGTGGCTATG |
SmilChr06G000644 |
Chr06 | NC_080392.1:5698461-5698475promoter 内 1527-1541 bp |
+ | 2460 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 5700935-5704169(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
GTCGGCAACGTGGCA |
SmilChr05G003376 |
Chr05 | NC_080391.1:44667269-44667283promoter 内 1506-1520 bp |
- | 2481 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 44663088-44664788(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATACTACACGTGGCC |
SmilChr08G001396 |
Chr08 | NC_080394.1:11188273-11188287promoter 内 1505-1519 bp |
- | 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 11190769-11194095(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
AGCCACGTGTTTGAC |
SmilChr03G003648 |
Chr03 | NC_080389.1:55238939-55238953promoter 内 1445-1459 bp |
+ | 2542 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 55241495-55244036(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
CATAGCCACGTGGAA |
SmilChr05G003092 |
Chr05 | NC_080391.1:39178438-39178452promoter 内 1426-1440 bp |
+ | 2561 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 39171897-39175877(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TTCCACGTGTGTACT |
SmilChr08G001525 |
Chr08 | NC_080394.1:12396437-12396451promoter 内 1291-1305 bp |
- | 2696 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 12399147-12402375(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
AGCCACGTGTGGAGA |
SmilChr04G000549 |
Chr04 | NC_080390.1:6132650-6132664promoter 内 1207-1221 bp |
- | 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 6135444-6138217(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
CGCCACGTGAAAGAA |
SmilChr05G001855 |
Chr05 | NC_080391.1:18577507-18577521promoter 内 1075-1089 bp |
+ | 2912 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 18580433-18581610(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
AGACAATACGTGGCA |
SmilChr03G003869 |
Chr03 | NC_080389.1:57803767-57803781promoter 内 836-850 bp |
+ | 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 57798026-57800616(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TTCCACGTGTACACA |
SmilChr03G000447 |
Chr03 | NC_080389.1:4796924-4796938promoter 内 807-821 bp |
+ | 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 4792703-4793744(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
AGCCACGTCGTGCCA |
SmilChr08G004007 |
Chr08 | NC_080394.1:48423066-48423080promoter 内 728-742 bp |
- | 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 48426339-48429564(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATCCACGTGACCAGC |
SmilChr05G002924 |
Chr05 | NC_080391.1:35203906-35203920promoter 内 726-740 bp |
- | 3261 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 35207181-35223351(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAAGTCCT |
SmilChr07G000860 |
Chr07 | NC_080393.1:6123623-6123637promoter 内 554-568 bp |
+ | 3433 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 6115449-6120190(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTCGAAGTG |
SmilChr02G003659 |
Chr02 | NC_080388.1:57961379-57961393promoter 内 340-354 bp |
+ | 3647 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 57965040-57967019(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
CATAGCCACGTGGAA |
SmilChr07G004655 |
Chr07 | NC_080393.1:59429277-59429291promoter 内 320-334 bp |
+ | 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 59422563-59425610(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
GGCCACGTAACTCCC |
SmilChr08G000296 |
Chr08 | NC_080394.1:2034734-2034748promoter 内 290-304 bp |
+ | 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 2038445-2042436(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
AATAATTACGTGGCA |
SmilChr08G002619 |
Chr08 | NC_080394.1:25543827-25543841promoter 内 145-159 bp |
- | 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 25547683-25549884(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAAGTCCT |
SmilChr01G000286 |
Chr01 | NC_080387.1:5644007-5644021promoter 内 119-133 bp |
+ | 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 5636395-5640139(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTCGAAGTG |
SmilChr08G000840 |
Chr08 | NC_080394.1:6215251-6215265promoter 内 7-21 bp |
- | 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 91.0/ 100 | 1 | 6219245-6221952(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTCGAAGTG |
SmilChr03G001653 |
Chr03 | NC_080389.1:21471018-21471032promoter 内 2145-2159 bp |
- | 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 5 | 21464796-21469176(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATATCCTACGTGGCA |
SmilChr01G002097 |
Chr01 | NC_080387.1:37009519-37009533promoter 内 1474-1488 bp |
- | 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 4 | 37012046-37013792(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAGGATAT |
SmilChr04G003840 |
Chr04 | NC_080390.1:54424466-54424480promoter 内 3307-3321 bp |
- | 680 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 3 | 54425160-54432024(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAGGATAT |
SmilChr01G002289 |
Chr01 | NC_080387.1:39727857-39727871promoter 内 2790-2804 bp |
+ | 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 3 | 39720915-39726660(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTATTAAGT |
SmilChr04G002044 |
Chr04 | NC_080390.1:33164397-33164411promoter 内 3728-3742 bp |
+ | 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 33163257-33164138(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAGGATAT |
SmilChr01G000870 |
Chr01 | NC_080387.1:18569876-18569890promoter 内 3442-3456 bp |
+ | 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 18567168-18569331(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAGGATAT |
SmilChr03G002452 |
Chr03 | NC_080389.1:38888917-38888931promoter 内 3321-3335 bp |
- | 666 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 38888180-38888251(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATATCCTACGTGGCA |
SmilChr08G002014 |
Chr08 | NC_080394.1:17882560-17882574promoter 内 3069-3083 bp |
+ | 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 17880795-17881642(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAGGATAT |
SmilChr02G002059 |
Chr02 | NC_080388.1:37068227-37068241promoter 内 2899-2913 bp |
- | 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 37069329-37072610(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAGGATAT |
SmilChr03G002451 |
Chr03 | NC_080389.1:38888917-38888931promoter 内 2873-2887 bp |
- | 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 38885932-38887803(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATATCCTACGTGGCA |
SmilChr05G002439 |
Chr05 | NC_080391.1:26893637-26893651promoter 内 2803-2817 bp |
+ | 1184 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 26889656-26892453(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAGGATAT |
SmilChr03G000757 |
Chr03 | NC_080389.1:8642959-8642973promoter 内 2294-2308 bp |
- | 1693 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 8644666-8646235(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TTCCACGTGGGATTC |
SmilChr06G002389 |
Chr06 | NC_080392.1:34688725-34688739promoter 内 2112-2126 bp |
+ | 1875 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 34690614-34693094(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATCTTACACGTGTCA |
SmilChr04G000335 |
Chr04 | NC_080390.1:3089023-3089037promoter 内 1824-1838 bp |
+ | 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 3091200-3091923(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATATCCTACGTGGCA |
SmilChr03G000310 |
Chr03 | NC_080389.1:3545189-3545203promoter 内 1793-1807 bp |
+ | 2194 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 3539980-3542995(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
GGCCACGTTTCCATC |
SmilChr04G000334 |
Chr04 | NC_080390.1:3089023-3089037promoter 内 1788-1802 bp |
+ | 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 3073698-3086824(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAGGATAT |
SmilChr04G000698 |
Chr04 | NC_080390.1:8148207-8148221promoter 内 1732-1746 bp |
+ | 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 8141791-8145952(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAGGATAT |
SmilChr01G003115 |
Chr01 | NC_080387.1:49955248-49955262promoter 内 1603-1617 bp |
+ | 2384 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 49957646-49959019(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATATCCTACGTGGCA |
SmilChr02G001273 |
Chr02 | NC_080388.1:23301103-23301117promoter 内 1507-1521 bp |
- | 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 23295339-23298623(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATATCCTACGTGGCA |
SmilChr01G003114 |
Chr01 | NC_080387.1:49955248-49955262promoter 内 1217-1231 bp |
+ | 2770 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 49951069-49952478(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TGCCACGTAGGATAT |
SmilChr06G000959 |
Chr06 | NC_080392.1:9250284-9250298promoter 内 730-744 bp |
- | 3257 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 9245258-9247027(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATATCCTACGTGGCA |
SmilChr03G000758 |
Chr03 | NC_080389.1:8642959-8642973promoter 内 723-737 bp |
- | 3264 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 8646237-8647566(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TTCCACGTGGGATTC |
SmilChr06G000988 |
Chr06 | NC_080392.1:9681580-9681594promoter 内 455-469 bp |
- | 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 9676576-9678048(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATATCCTACGTGGCA |
SmilChr01G006200 |
Chr01 | NC_080387.1:77701905-77701919promoter 内 226-240 bp |
- | 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 77690583-77698144(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATATCCTACGTGGCA |
SmilChr06G002730 |
Chr06 | NC_080392.1:39395084-39395098promoter 内 171-185 bp |
- | 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 2 | 39390266-39391268(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
ATATCCTACGTGGCA |
SmilChr03G001296 |
Chr03 | NC_080389.1:15157246-15157260promoter 内 3956-3970 bp |
+ | 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 1 | 15157291-15160121(+) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
TAATCTTACGTGGCA |
SmilChr04G002351 |
Chr04 | NC_080390.1:37948060-37948074promoter 内 3946-3960 bp |
- | 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.9/ 100 | 1 | 37946001-37948019(-) |
SMil_00011094-RA_Salv |
MP00409 |
GATATACACGTGTCG |