转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G003441; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00014538-RA_Salv SmilChr07G003441 NAC XP_057773618.1 MP00108 TTAAGTAAT

可能结合的靶基因

9810 个结合位点 6458 个候选靶基因 第 107 / 130 下载 TSV

上一页 107 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002043 Chr01 NC_080387.1:36129915-36129923promoter 内 1984-1992 bp + 2009 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 36131932-36134712(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAGT
SmilChr02G001815 Chr02 NC_080388.1:33003199-33003207promoter 内 1982-1990 bp + 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 33005218-33010452(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G002817 Chr02 NC_080388.1:48264264-48264272promoter 内 1981-1989 bp + 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 48266284-48268490(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G002916 Chr02 NC_080388.1:49463604-49463612promoter 内 1981-1989 bp + 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49465624-49468255(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G003803 Chr02 NC_080388.1:59663373-59663381promoter 内 1981-1989 bp - 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 59659322-59661361(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr02G004096 Chr02 NC_080388.1:63270096-63270104promoter 内 1981-1989 bp - 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 63272116-63275906(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr02G000765 Chr02 NC_080388.1:12523803-12523811promoter 内 1979-1987 bp - 2014 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 12517283-12521789(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G005174 Chr02 NC_080388.1:73039700-73039708promoter 内 1976-1984 bp - 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 73041725-73043570(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr01G003377 Chr01 NC_080387.1:52459113-52459121promoter 内 1973-1981 bp + 2020 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 52451698-52457093(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr01G005232 Chr01 NC_080387.1:69901680-69901688promoter 内 1971-1979 bp - 2022 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 69903710-69910234(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr02G004574 Chr02 NC_080388.1:68249263-68249271promoter 内 1968-1976 bp - 2025 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68246240-68247238(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TGAAGTAAT
SmilChr02G004867 Chr02 NC_080388.1:70780659-70780667promoter 内 1966-1974 bp - 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 70782694-70782767(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 AGTACTTAA
SmilChr01G005303 Chr01 NC_080387.1:70303512-70303520promoter 内 1964-1972 bp + 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 70305549-70306130(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G002287 Chr02 NC_080388.1:40406446-40406454promoter 内 1961-1969 bp - 2032 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 40408486-40415281(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr02G005280 Chr02 NC_080388.1:73843778-73843786promoter 内 1960-1968 bp + 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 73845819-73847714(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G002225 Chr02 NC_080388.1:39571707-39571715promoter 内 1958-1966 bp - 2035 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 39567398-39569672(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TGAAGTAAT
SmilChr01G002984 Chr01 NC_080387.1:48769234-48769242promoter 内 1955-1963 bp + 2038 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 48764304-48767196(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA
SmilChr01G004691 Chr01 NC_080387.1:64969361-64969369promoter 内 1953-1961 bp - 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 64965598-64967321(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr01G003844 Chr01 NC_080387.1:56764405-56764413promoter 内 1949-1957 bp - 2044 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 56766457-56768587(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 AGTACTTAA
SmilChr03G000512 Chr03 NC_080389.1:5509744-5509752promoter 内 1947-1955 bp + 2046 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 5511798-5516423(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr01G002182 Chr01 NC_080387.1:37955465-37955473promoter 内 1942-1950 bp + 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 37950605-37953414(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA
SmilChr02G000149 Chr02 NC_080388.1:1986036-1986044promoter 内 1942-1950 bp - 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1982500-1983985(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr02G002857 Chr02 NC_080388.1:48774147-48774155promoter 内 1941-1949 bp - 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 48768678-48772095(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAGT
SmilChr01G000157 Chr01 NC_080387.1:2652236-2652244promoter 内 1933-1941 bp + 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 2649631-2650176(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA
SmilChr01G001368 Chr01 NC_080387.1:27035414-27035422promoter 内 1930-1938 bp - 2063 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 27037485-27040166(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr02G000197 Chr02 NC_080388.1:2493831-2493839promoter 内 1930-1938 bp - 2063 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 2490229-2491768(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr01G000601 Chr01 NC_080387.1:13070577-13070585promoter 内 1929-1937 bp - 2064 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 13065988-13068513(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTACT
SmilChr02G001953 Chr02 NC_080388.1:35245998-35246006promoter 内 1928-1936 bp + 2065 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 35248071-35250239(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr03G000380 Chr03 NC_080389.1:4253618-4253626promoter 内 1927-1935 bp + 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 4255692-4259229(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr01G002562 Chr01 NC_080387.1:43747174-43747182promoter 内 1925-1933 bp - 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 43749250-43751433(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA
SmilChr01G004478 Chr01 NC_080387.1:62886154-62886162promoter 内 1925-1933 bp - 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 62878340-62884086(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr01G001863 Chr01 NC_080387.1:33586339-33586347promoter 内 1924-1932 bp + 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 33583866-33584270(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr01G005199 Chr01 NC_080387.1:69672025-69672033promoter 内 1924-1932 bp - 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 69674102-69681886(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ACTACTTAA
SmilChr01G005378 Chr01 NC_080387.1:71007382-71007390promoter 内 1924-1932 bp - 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 70999770-71005313(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr03G000024 Chr03 NC_080389.1:366517-366525promoter 内 1924-1932 bp - 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 363541-364448(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAA
SmilChr01G000070 Chr01 NC_080387.1:1200687-1200695promoter 内 1923-1931 bp + 2070 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1202765-1205423(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTACT
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