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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 109 / 142 下载 TSV

上一页 109 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001140 Chr06 NC_080392.1:11443697-11443711promoter 内 944-958 bp + 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11446754-11448502(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGCACCTACCATATG
SmilChr04G001829 Chr04 NC_080390.1:29824022-29824036promoter 内 904-918 bp - 3083 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 29818404-29820939(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTTTTAC
SmilChr01G005069 Chr01 NC_080387.1:68577721-68577735promoter 内 898-912 bp + 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 68580824-68582934(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TATACCTACCTGCAT
SmilChr07G002057 Chr07 NC_080393.1:18710925-18710939promoter 内 854-868 bp + 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 18714072-18716022(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTAACAACCACCAA
SmilChr01G006185 Chr01 NC_080387.1:77364876-77364890promoter 内 815-829 bp + 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 77359226-77361704(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTAAAAGTAGGTGGA
SmilChr02G000226 Chr02 NC_080388.1:2949743-2949757promoter 内 804-818 bp - 3183 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2945403-2946560(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGCACCTACCAGTAG
SmilChr01G005616 Chr01 NC_080387.1:72676252-72676266promoter 内 770-784 bp + 3217 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 72672952-72673035(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAAAGGGTAGGTGCA
SmilChr01G005307 Chr01 NC_080387.1:70324078-70324092promoter 内 759-773 bp - 3228 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 70327320-70334092(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGCCTAGTAGGTGGA
SmilChr05G003676 Chr05 NC_080391.1:49746827-49746841promoter 内 723-737 bp - 3264 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 49750105-49750792(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGCTGGTAAG
SmilChr01G001279 Chr01 NC_080387.1:25579290-25579304promoter 内 649-663 bp - 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 25582642-25586589(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGGATAGTAGGTGGT
SmilChr05G002764 Chr05 NC_080391.1:32026389-32026403promoter 内 635-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 32029755-32033678(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGTGAGTAGGTGAA
SmilChr05G002577 Chr05 NC_080391.1:28973040-28973054promoter 内 627-641 bp - 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 28966207-28969680(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTTTTAC
SmilChr01G003579 Chr01 NC_080387.1:54366181-54366195promoter 内 611-625 bp + 3376 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54369571-54371350(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTAGGCA
SmilChr01G003523 Chr01 NC_080387.1:53853677-53853691promoter 内 585-599 bp - 3402 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53857093-53857698(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGGTGGTAGGGGGA
SmilChr04G003693 Chr04 NC_080390.1:53317967-53317981promoter 内 499-513 bp + 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53321469-53322858(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TATAACTACCACTCT
SmilChr03G004068 Chr03 NC_080389.1:59665551-59665565promoter 内 484-498 bp + 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 59658877-59662048(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGAAGGTAGGTATT
SmilChr02G004531 Chr02 NC_080388.1:67888755-67888769promoter 内 438-452 bp + 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 67880377-67885206(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CAAAAGGTAGGTGTG
SmilChr03G001910 Chr03 NC_080389.1:26731962-26731976promoter 内 399-413 bp + 3588 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26735564-26736589(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCACCTACTATGGC
SmilChr04G002854 Chr04 NC_080390.1:44669675-44669689promoter 内 378-392 bp - 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 44665052-44666066(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGTACCTACCGATGA
SmilChr06G003252 Chr06 NC_080392.1:45196976-45196990promoter 内 361-375 bp - 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 45187905-45193350(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTAACAAGGA
SmilChr08G001958 Chr08 NC_080394.1:17250393-17250407promoter 内 346-360 bp - 3641 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 17245213-17246752(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTACCTACCCCTCA
SmilChr05G004129 Chr05 NC_080391.1:55233826-55233840promoter 内 290-304 bp - 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 55228099-55230129(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTACCTACCGACGG
SmilChr02G002483 Chr02 NC_080388.1:43213121-43213135promoter 内 279-293 bp - 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 43216843-43218769(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACGTGGTAGTTACG
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SmilChr02G003172 Chr02 NC_080388.1:52821274-52821288promoter 内 244-258 bp - 3743 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52825031-52826664(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCGTCGGTAGGTAAC
SmilChr02G004309 Chr02 NC_080388.1:65457795-65457809promoter 内 217-231 bp - 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 65461579-65465385(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACGCGGGTAGGTGTT
SmilChr02G004394 Chr02 NC_080388.1:66300745-66300759promoter 内 194-208 bp - 3793 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 66294410-66296952(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTTTTAC
SmilChr03G001388 Chr03 NC_080389.1:16423824-16423838promoter 内 179-193 bp - 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 16427646-16428575(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTATAGTAGGTGGT
SmilChr07G003133 Chr07 NC_080393.1:33254882-33254896promoter 内 167-181 bp + 3820 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33258716-33258911(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTAACTACCACCAA
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SmilChr02G003544 Chr02 NC_080388.1:56599710-56599724promoter 内 62-76 bp + 3925 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 56603649-56603764(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AACACCTACCCACGT
SmilChr07G002285 Chr07 NC_080393.1:21114707-21114721promoter 内 16-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 21118692-21119777(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTAATGGTAGGTGAT
SmilChr07G003479 Chr07 NC_080393.1:39078238-39078252promoter 内 3857-3871 bp + 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 39078382-39080909(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTAACAACCACCAA
SmilChr07G001530 Chr07 NC_080393.1:12378462-12378476promoter 内 3604-3618 bp + 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 12378859-12380690(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGTACCTACCAATTT
SmilChr07G002329 Chr07 NC_080393.1:21595851-21595865promoter 内 2823-2837 bp + 1164 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 21597029-21597228(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGCACCTACTCCCTC
SmilChr05G003828 Chr05 NC_080391.1:51678936-51678950promoter 内 2452-2466 bp + 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 51680485-51681503(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTAACAACCACCAA
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SmilChr08G002788 Chr08 NC_080394.1:27583090-27583104promoter 内 1398-1412 bp - 2589 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 27585693-27589590(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTCAGTAGGTGGA
SmilChr04G004159 Chr04 NC_080390.1:56274629-56274643promoter 内 3970-3984 bp - 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 56274660-56278615(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGAAGTAGGTGGT
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SmilChr01G004678 Chr01 NC_080387.1:64871919-64871933promoter 内 3937-3951 bp + 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 64867873-64871869(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGCAGTAGGTGTA
SmilChr06G002310 Chr06 NC_080392.1:33379650-33379664promoter 内 3855-3869 bp + 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 33370025-33379518(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATGTAGTAGGTGAA
SmilChr01G000645 Chr01 NC_080387.1:14439753-14439767promoter 内 3815-3829 bp - 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 14439939-14443084(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TATTTGGTAGGTGTT
SmilChr04G000325 Chr04 NC_080390.1:3004711-3004725promoter 内 3800-3814 bp - 187 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 3004912-3005598(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGTCGGGTAGGTGAT
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SmilChr07G004254 Chr07 NC_080393.1:54976518-54976532promoter 内 3599-3613 bp - 388 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 54976920-54981027(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGAAAGTAGGTGGT