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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 12 / 126 下载 TSV

上一页 12 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002148 Chr01 NC_080387.1:37472143-37472157promoter 内 1658-1672 bp + 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 37474486-37476248(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATGTGACACGTGGCA
SmilChr01G002145 Chr01 NC_080387.1:37435694-37435708promoter 内 1370-1384 bp + 2617 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 37438325-37445361(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAAGATGACGTGGCA
SmilChr08G001912 Chr08 NC_080394.1:16645190-16645204promoter 内 1268-1282 bp - 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 16634210-16642471(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTGCAGACGTGGCA
SmilChr04G002674 Chr04 NC_080390.1:42158773-42158787promoter 内 1192-1206 bp - 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 42154381-42155978(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATGTGACACGTGGCA
SmilChr07G003758 Chr07 NC_080393.1:45862492-45862506promoter 内 1152-1166 bp - 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 45857706-45859657(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTAGCCCACGTGGCA
SmilChr01G000538 Chr01 NC_080387.1:11060800-11060814promoter 内 861-875 bp + 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 11063940-11065616(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATGTGACACGTGGCA
SmilChr01G002290 Chr01 NC_080387.1:39740899-39740913promoter 内 521-535 bp + 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 39735727-39737433(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCTTCACA
SmilChr01G000537 Chr01 NC_080387.1:11060800-11060814promoter 内 452-466 bp + 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 11056474-11057265(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCACAT
SmilChr04G001913 Chr04 NC_080390.1:31229079-31229093promoter 内 113-127 bp + 3874 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 31223803-31225205(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGTCATC
SmilChr06G002430 Chr06 NC_080392.1:35073390-35073404promoter 内 928-942 bp + 3059 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 4 35068295-35070331(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGCATTT
SmilChr07G003175 Chr07 NC_080393.1:33797563-33797577promoter 内 2375-2389 bp + 1612 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 33799189-33800533(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAGGGACACGTGTCA
SmilChr06G001344 Chr06 NC_080392.1:14009285-14009299promoter 内 1430-1444 bp - 2557 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 14011856-14012600(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGGCATT
SmilChr06G001385 Chr06 NC_080392.1:14493051-14493065promoter 内 1430-1444 bp - 2557 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 14495622-14496366(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGGCATT
SmilChr02G001773 Chr02 NC_080388.1:32491912-32491926promoter 内 397-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 32484108-32488322(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAAGCTGACGTGGCA
SmilChr01G001646 Chr01 NC_080387.1:30523864-30523878promoter 内 3777-3791 bp - 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 30524088-30530209(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGCTTT
SmilChr07G003809 Chr07 NC_080393.1:46945425-46945439promoter 内 3740-3754 bp - 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 46934050-46945178(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAAGGACACGTGTCA
SmilChr04G003481 Chr04 NC_080390.1:51254219-51254233promoter 内 3355-3369 bp + 632 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 51252682-51253587(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCATCACA
SmilChr04G001834 Chr04 NC_080390.1:29892678-29892692promoter 内 3288-3302 bp + 699 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 29890969-29891979(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGCTTT
SmilChr05G004014 Chr05 NC_080391.1:54086141-54086155promoter 内 2530-2544 bp + 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 54082776-54084684(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGGCATT
SmilChr02G000691 Chr02 NC_080388.1:11013166-11013180promoter 内 2274-2288 bp - 1713 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 11010617-11011453(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTTGGACACGTGTCA
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SmilChr02G002948 Chr02 NC_080388.1:50010851-50010865promoter 内 940-954 bp - 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 50013912-50014415(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGCCTAG
SmilChr01G002431 Chr01 NC_080387.1:41850513-41850527promoter 内 792-806 bp - 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 41845480-41847318(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTGGCAGACGTGGCA
SmilChr02G005026 Chr02 NC_080388.1:71999211-71999225promoter 内 652-666 bp + 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 72002560-72007132(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAAGCTGACGTGGCA
SmilChr06G002093 Chr06 NC_080392.1:27832526-27832540promoter 内 3982-3996 bp - 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 27823302-27832521(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGCCGACGTGGCA
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SmilChr04G000951 Chr04 NC_080390.1:12589939-12589953promoter 内 3957-3971 bp - 30 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 12588461-12589909(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTGCTGACGTGGCA
SmilChr01G005238 Chr01 NC_080387.1:69944011-69944025promoter 内 3933-3947 bp - 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 69941803-69943957(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTGCTGACGTGGCA
SmilChr05G001677 Chr05 NC_080391.1:15884734-15884748promoter 内 3895-3909 bp + 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 15884840-15886910(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGCCGACGTGGCA
SmilChr02G004825 Chr02 NC_080388.1:70349859-70349873promoter 内 3701-3715 bp - 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 70350159-70369004(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGCTAC
SmilChr05G001839 Chr05 NC_080391.1:18417933-18417947promoter 内 3639-3653 bp + 348 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 18418295-18419363(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAAGCTGACGTGGCA
SmilChr04G003993 Chr04 NC_080390.1:55322200-55322214promoter 内 3633-3647 bp + 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 55322568-55324194(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAAGCTGACGTGGCA
SmilChr07G002419 Chr07 NC_080393.1:22533643-22533657promoter 内 3293-3307 bp + 694 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22534351-22538300(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAAGCTGACGTGGCA
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SmilChr07G004074 Chr07 NC_080393.1:52157004-52157018promoter 内 3250-3264 bp - 737 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 52153069-52156267(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTGATGACGTGGCA
SmilChr07G002418 Chr07 NC_080393.1:22533643-22533657promoter 内 3198-3212 bp + 789 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22529445-22532854(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGCTTT
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SmilChr08G002133 Chr08 NC_080394.1:19228757-19228771promoter 内 2472-2486 bp - 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 19230286-19232979(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGCTTT
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