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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003399; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00009551-RA_Salv SmilChr02G003399 ERF XP_057793859.1 MP00240 CCACCTCCACCGCCA

可能结合的靶基因

9978 个结合位点 6368 个候选靶基因 第 123 / 128 下载 TSV

上一页 123 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G001843 Chr08 NC_080394.1:15805305-15805319promoter 内 1782-1796 bp + 2205 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 15807524-15814605(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCACGTCCACCGGCA
SmilChr02G003853 Chr02 NC_080388.1:60301784-60301798promoter 内 1774-1788 bp - 2213 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60298047-60299571(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCGTCGCCACCGCTC
SmilChr04G002392 Chr04 NC_080390.1:38432826-38432840promoter 内 1773-1787 bp + 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 38427790-38430612(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGATGCAA
SmilChr07G001343 Chr07 NC_080393.1:10397580-10397594promoter 内 1703-1717 bp + 2284 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 10384575-10395296(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGAAAAGC
SmilChr06G002944 Chr06 NC_080392.1:42268421-42268435promoter 内 1677-1691 bp + 2310 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 42265081-42266111(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGATGAGGG
SmilChr07G000078 Chr07 NC_080393.1:423766-423780promoter 内 1658-1672 bp + 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 364181-421437(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGATGGTTG
SmilChr08G000657 Chr08 NC_080394.1:4891922-4891936promoter 内 1587-1601 bp - 2400 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 4883834-4889522(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCCGCAGCACCGCCA
SmilChr02G005088 Chr02 NC_080388.1:72480957-72480971promoter 内 1570-1584 bp + 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 72483388-72484959(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCGACCCCACCGCCG
SmilChr07G001970 Chr07 NC_080393.1:17264943-17264957promoter 内 1493-1507 bp + 2494 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 17254652-17262449(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TAGCGGTGGAGAAAG
SmilChr03G001736 Chr03 NC_080389.1:23369944-23369958promoter 内 1492-1506 bp - 2495 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 23363616-23367449(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCAACTCCACCGCCC
SmilChr08G002539 Chr08 NC_080394.1:24672474-24672488promoter 内 1434-1448 bp + 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 24666571-24669921(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TTGCGGTGGTGCTGG
SmilChr06G002515 Chr06 NC_080392.1:36055034-36055048promoter 内 1399-1413 bp + 2588 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 36051862-36052446(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAGCGGTGGTGGTTC
SmilChr07G001972 Chr07 NC_080393.1:17264943-17264957promoter 内 1368-1382 bp + 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 17267576-17275182(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CTTTCTCCACCGCTA
SmilChr07G004590 Chr07 NC_080393.1:58707431-58707445promoter 内 1354-1368 bp + 2633 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 58702698-58704798(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGCCATGT
SmilChr04G000693 Chr04 NC_080390.1:8083157-8083171promoter 内 1350-1364 bp - 2637 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 8077173-8080520(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CTTGTGCCACCGCCT
SmilChr05G000746 Chr05 NC_080391.1:5754972-5754986promoter 内 1336-1350 bp - 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 5750942-5752321(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCCGCCCCACCGCCA
SmilChr07G003590 Chr07 NC_080393.1:41924027-41924041promoter 内 1315-1329 bp - 2672 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 41918258-41921355(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGCCAGCCACCGCCA
SmilChr02G000472 Chr02 NC_080388.1:6455649-6455663promoter 内 1306-1320 bp - 2681 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 6458344-6465931(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GGGCGGTGGAAGGTG
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SmilChr05G000867 Chr05 NC_080391.1:6862621-6862635promoter 内 1136-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 6865486-6866897(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGTTGGTGGAGGGGG
SmilChr06G003113 Chr06 NC_080392.1:43982414-43982428promoter 内 1130-1144 bp - 2857 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 43976360-43979557(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCCCCACCGCTC
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SmilChr07G003340 Chr07 NC_080393.1:35799895-35799909promoter 内 1075-1089 bp + 2912 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 35802821-35804183(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCGTCGCCACCGCTC
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SmilChr04G003225 Chr04 NC_080390.1:49065919-49065933promoter 内 1030-1044 bp - 2957 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49060583-49062962(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CACCCTCCACCACCT
SmilChr04G002992 Chr04 NC_080390.1:46340140-46340154promoter 内 1024-1038 bp + 2963 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 46343117-46345491(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CACCCTCCACCACCT
SmilChr02G003356 Chr02 NC_080388.1:54721259-54721273promoter 内 1001-1015 bp + 2986 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 54724259-54726747(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCTCCTCCACCACCT
SmilChr04G003850 Chr04 NC_080390.1:54492694-54492708promoter 内 964-978 bp + 3023 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 54487394-54489671(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGTGGTGGAGGTCG
SmilChr07G004328 Chr07 NC_080393.1:55859067-55859081promoter 内 846-860 bp - 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 55848640-55855926(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCCTCTCCACCGACC
SmilChr08G002578 Chr08 NC_080394.1:25125011-25125025promoter 内 840-854 bp + 3147 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 25105044-25121864(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGCTGGAGC
SmilChr02G001283 Chr02 NC_080388.1:23669013-23669027promoter 内 822-836 bp - 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 23672192-23676036(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAGCGGTGGGGGAGA
SmilChr08G001045 Chr08 NC_080394.1:7976868-7976882promoter 内 792-806 bp + 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 7980077-7983110(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCTCCTCCACCGCGG
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SmilChr07G004330 Chr07 NC_080393.1:55859067-55859081promoter 内 703-717 bp - 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 55862365-55863222(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GGTCGGTGGAGAGGG
SmilChr01G004004 Chr01 NC_080387.1:58429942-58429956promoter 内 689-703 bp - 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 58433254-58434333(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGTCCGGGG
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SmilChr02G001031 Chr02 NC_080388.1:18242094-18242108promoter 内 674-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 18236777-18238781(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAACGGTGGAGGATG
SmilChr07G002347 Chr07 NC_080393.1:21807760-21807774promoter 内 623-637 bp - 3364 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 21801855-21804396(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCCGCCCCACCGCCA
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SmilChr02G000697 Chr02 NC_080388.1:11089642-11089656promoter 内 475-489 bp + 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 11093168-11094617(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGAAGCCACCGCCG
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SmilChr07G000281 Chr07 NC_080393.1:1813790-1813804promoter 内 389-403 bp - 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1817402-1819788(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GGGCGGTGGTGGTTC
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SmilChr07G001538 Chr07 NC_080393.1:12506193-12506207promoter 内 215-229 bp - 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 12509979-12517865(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGACGGTGGAGCTTG
SmilChr04G002244 Chr04 NC_080390.1:36223508-36223522promoter 内 205-219 bp + 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 36227304-36228976(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTTCTCCACCACCT
SmilChr04G002176 Chr04 NC_080390.1:35150604-35150618promoter 内 199-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 35154406-35159898(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGAGAATA