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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003399; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00009551-RA_Salv SmilChr02G003399 ERF XP_057793859.1 MP00240 CCACCTCCACCGCCA

可能结合的靶基因

9978 个结合位点 6368 个候选靶基因 第 124 / 128 下载 TSV

上一页 124 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr02G000610 Chr02 NC_080388.1:8914631-8914645promoter 内 153-167 bp + 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 8918479-8918931(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCTCCTCCACCACCT
SmilChr01G003447 Chr01 NC_080387.1:53031449-53031463promoter 内 94-108 bp - 3893 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 53035356-53664655(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGTGGTGGAGGTCG
SmilChr07G004585 Chr07 NC_080393.1:58670546-58670560promoter 内 68-82 bp + 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 58674479-58674997(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 ACATGGCCACCGCCA
SmilChr04G002490 Chr04 NC_080390.1:39779815-39779829promoter 内 63-77 bp - 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 39783753-39786583(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGAGAGCC
SmilChr05G004156 Chr05 NC_080391.1:55491273-55491287promoter 内 42-56 bp + 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 55484032-55487328(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AAGTGGTGGAGGAGG
SmilChr07G003747 Chr07 NC_080393.1:45695259-45695273promoter 内 22-36 bp + 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45691198-45691294(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCGCGGTGGTGGCTG
SmilChr07G002815 Chr07 NC_080393.1:28174870-28174884promoter 内 3-17 bp - 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 28178868-28181702(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGCTGGCC
SmilChr08G003191 Chr08 NC_080394.1:32691015-32691029promoter 内 3126-3140 bp - 861 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 2 32691890-32693834(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCGCGGTGGAGGTCG
SmilChr08G000944 Chr08 NC_080394.1:7028417-7028431promoter 内 3801-3815 bp - 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 7027430-7028231(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CTGCCACCACCGCGA
SmilChr08G003030 Chr08 NC_080394.1:30445418-30445432promoter 内 3745-3759 bp + 242 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 30444736-30445176(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGAGACTT
SmilChr07G003433 Chr07 NC_080393.1:37735594-37735608promoter 内 3703-3717 bp - 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 37735892-37738915(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GAGCGGTGGCGCCGA
SmilChr06G002446 Chr06 NC_080392.1:35206621-35206635promoter 内 3607-3621 bp - 380 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 35207015-35210927(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CTGCGGCGGAGGTGT
SmilChr03G003132 Chr03 NC_080389.1:48503261-48503275promoter 内 3523-3537 bp + 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 48498819-48502797(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAGCGGTGGAGGGCA
SmilChr07G001293 Chr07 NC_080393.1:9938137-9938151promoter 内 3470-3484 bp - 517 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 9938668-9938741(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGCCCGGA
SmilChr06G003186 Chr06 NC_080392.1:44771141-44771155promoter 内 3469-3483 bp + 518 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 44755592-44770623(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGATGATGG
SmilChr01G000840 Chr01 NC_080387.1:18158095-18158109promoter 内 3464-3478 bp - 523 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 18156130-18157572(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCTCCAGCACCGCCA
SmilChr01G000399 Chr01 NC_080387.1:8201633-8201647promoter 内 3402-3416 bp - 585 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 8202232-8203476(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGCCCGGC
SmilChr04G003358 Chr04 NC_080390.1:50183084-50183098promoter 内 3355-3369 bp - 632 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 50183730-50186953(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCGCGGTGGAAGGGG
SmilChr04G001482 Chr04 NC_080390.1:24255029-24255043promoter 内 3352-3366 bp + 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 24253149-24254394(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGCCTTGA
SmilChr04G001483 Chr04 NC_080390.1:24262472-24262486promoter 内 3330-3344 bp + 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 24260570-24261815(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGCCTTGA
SmilChr05G000541 Chr05 NC_080391.1:4146486-4146500promoter 内 3303-3317 bp + 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 4139977-4145802(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGGGAGAG
SmilChr07G004399 Chr07 NC_080393.1:56640203-56640217promoter 内 3283-3297 bp - 704 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 56640921-56643699(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GGGCGGTGCCGGTGC
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SmilChr07G001294 Chr07 NC_080393.1:9938137-9938151promoter 内 3244-3258 bp - 743 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 9938894-9941357(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGCCCGGA
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SmilChr06G003282 Chr06 NC_080392.1:45366116-45366130promoter 内 3197-3211 bp - 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 45366920-45371244(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGTCGGTGGAGACGT
SmilChr05G002373 Chr05 NC_080391.1:26002182-26002196promoter 内 3195-3209 bp - 792 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 26000980-26001390(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TAATCACCACCGCCG
SmilChr03G003167 Chr03 NC_080389.1:49033854-49033868promoter 内 3176-3190 bp - 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 49027296-49033043(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCTCCACCATCT
SmilChr03G002715 Chr03 NC_080389.1:43110088-43110102promoter 内 3175-3189 bp + 812 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 43110914-43112917(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GATCCTCCACCGTCA
SmilChr07G004186 Chr07 NC_080393.1:53873382-53873396promoter 内 3167-3181 bp - 820 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 53874216-53874340(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTGATTA
SmilChr08G001951 Chr08 NC_080394.1:17169270-17169284promoter 内 3152-3166 bp - 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 17170119-17176994(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGATGTAA
SmilChr03G004494 Chr03 NC_080389.1:63058649-63058663promoter 内 3140-3154 bp + 847 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 63053403-63057802(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGAGACTT
SmilChr03G003129 Chr03 NC_080389.1:48458822-48458836promoter 内 3102-3116 bp + 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 48459721-48465168(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGCCCTCCACCGCTG
SmilChr02G000886 Chr02 NC_080388.1:15265883-15265897promoter 内 3092-3106 bp - 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 15266792-15267130(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGCCGGTGGAGAAGG
SmilChr03G004493 Chr03 NC_080389.1:63049461-63049475promoter 内 3066-3080 bp + 921 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 63045233-63048540(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGAGACTT
SmilChr01G000044 Chr01 NC_080387.1:713334-713348promoter 内 3063-3077 bp - 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 710815-712410(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGCCTGCCACCGCTT
SmilChr02G001203 Chr02 NC_080388.1:22174222-22174236promoter 内 3054-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 22175169-22180780(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GGGCGGTGCCGGTGC
SmilChr03G001435 Chr03 NC_080389.1:17032832-17032846promoter 内 3020-3034 bp + 967 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 17027282-17031865(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAGCGGTGGCCGGCG
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SmilChr03G002286 Chr03 NC_080389.1:36043411-36043425promoter 内 2851-2865 bp - 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 36037236-36042275(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 ACACCTCCGCCGCAG
SmilChr06G003187 Chr06 NC_080392.1:44771141-44771155promoter 内 2834-2848 bp + 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 44772308-44779839(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCATCATCACCGCCT
SmilChr03G002916 Chr03 NC_080389.1:45910651-45910665promoter 内 2814-2828 bp - 1173 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 45911838-45916057(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGACATTG
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SmilChr07G003743 Chr07 NC_080393.1:45622099-45622113promoter 内 2781-2795 bp - 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 45623319-45633964(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GGGCGGTGGAGTTGA
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SmilChr03G003134 Chr03 NC_080389.1:48592976-48592990promoter 内 2728-2742 bp + 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 48580761-48591717(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAGCGGTGGAGGGCA
SmilChr08G002923 Chr08 NC_080394.1:29294674-29294688promoter 内 2655-2669 bp + 1332 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 29296020-29299953(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCCCTCCCACCGCTG