转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 13 / 135 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002388 Chr02 NC_080388.1:41814534-41814548promoter 内 3027-3041 bp + 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 41812293-41813574(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATAATG
SmilChr01G005034 Chr01 NC_080387.1:68290644-68290658promoter 内 2842-2856 bp + 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 68288708-68289499(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATAATG
SmilChr02G000010 Chr02 NC_080388.1:87017-87031promoter 内 2742-2756 bp + 1245 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 84040-85772(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTGATAAGGTTAGA
SmilChr03G000389 Chr03 NC_080389.1:4299800-4299814promoter 内 2723-2737 bp + 1264 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 4297428-4298536(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGATTTAT
SmilChr02G004296 Chr02 NC_080388.1:65315535-65315549promoter 内 2678-2692 bp + 1309 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 65316858-65319136(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATAAATCTTATCCTA
SmilChr02G000643 Chr02 NC_080388.1:9725594-9725608promoter 内 2675-2689 bp - 1312 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 9721651-9724282(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCCTGCCTTATCCAC
SmilChr02G000483 Chr02 NC_080388.1:6599071-6599085promoter 内 2584-2598 bp - 1403 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 6600488-6602111(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTGATAAGGTTAGA
SmilChr01G004612 Chr01 NC_080387.1:64082471-64082485promoter 内 2525-2539 bp + 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 64076344-64081009(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATAATG
SmilChr03G000165 Chr03 NC_080389.1:1817040-1817054promoter 内 2306-2320 bp + 1681 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 1813038-1815359(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGGGTTTG
SmilChr02G000011 Chr02 NC_080388.1:87017-87031promoter 内 2250-2264 bp + 1737 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 88768-90515(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTAACCTTATCAAC
SmilChr02G000562 Chr02 NC_080388.1:7904256-7904270promoter 内 2155-2169 bp - 1832 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7906102-7906208(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGGACTTC
SmilChr02G001739 Chr02 NC_080388.1:31958040-31958054promoter 内 2010-2024 bp - 1977 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 31954366-31956063(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATAAATCTTATCCTA
SmilChr01G005487 Chr01 NC_080387.1:71814947-71814961promoter 内 1832-1846 bp + 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71817116-71820099(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTCTTCCTTATCTTC
SmilChr01G004653 Chr01 NC_080387.1:64647894-64647908promoter 内 1773-1787 bp - 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 64640369-64645680(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CATGTTCTTATCCTC
SmilChr01G001200 Chr01 NC_080387.1:24171984-24171998promoter 内 1607-1621 bp + 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 24160292-24169604(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGATAGTC
SmilChr01G001241 Chr01 NC_080387.1:24827969-24827983promoter 内 1576-1590 bp + 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 24816330-24825558(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGATAGTC
SmilChr01G002464 Chr01 NC_080387.1:42341264-42341278promoter 内 1463-1477 bp - 2524 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 42337723-42338740(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTAACCTTATCATA
SmilChr01G005888 Chr01 NC_080387.1:74796291-74796305promoter 内 1191-1205 bp + 2796 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 74799101-74807566(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCAGATCTTATCCTC
SmilChr02G000904 Chr02 NC_080388.1:15602334-15602348promoter 内 1156-1170 bp - 2831 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 15591795-15599503(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTATCCTTATCTTT
SmilChr02G002749 Chr02 NC_080388.1:47525046-47525060promoter 内 1122-1136 bp + 2865 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 47527925-47531991(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATAAATCTTATCCTA
SmilChr02G002963 Chr02 NC_080388.1:50146181-50146195promoter 内 773-787 bp + 3214 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 50141901-50142967(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATAATG
SmilChr02G001683 Chr02 NC_080388.1:31070736-31070750promoter 内 749-763 bp + 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 31066005-31067498(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGGAAGAC
SmilChr03G000166 Chr03 NC_080389.1:1817040-1817054promoter 内 562-576 bp + 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 1820479-1822311(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAAACCCTTATCCTC
SmilChr02G000012 Chr02 NC_080388.1:87017-87031promoter 内 442-456 bp + 3545 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 90576-95584(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTAACCTTATCAAC
SmilChr03G000793 Chr03 NC_080389.1:9012646-9012660promoter 内 382-396 bp + 3605 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 9016265-9021580(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTTTCCTTATCTTC
SmilChr01G004381 Chr01 NC_080387.1:61996111-61996125promoter 内 51-65 bp - 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 62000061-62002883(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGGAGAAA
SmilChr02G001288 Chr02 NC_080388.1:23725372-23725386promoter 内 42-56 bp - 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 23720890-23721427(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCTTTCCTTATCTTC
SmilChr01G005485 Chr01 NC_080387.1:71814947-71814961promoter 内 25-39 bp + 3962 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71807701-71810985(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAGATAAGGAAGAA
SmilChr03G000674 Chr03 NC_080389.1:7542903-7542917promoter 内 3351-3365 bp - 636 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 5 7540437-7542267(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATATCCTTATCTTT
SmilChr02G001916 Chr02 NC_080388.1:34493348-34493362promoter 内 2322-2336 bp + 1665 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 5 34487721-34491683(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGGCTACT
SmilChr01G005427 Chr01 NC_080387.1:71450717-71450731promoter 内 2958-2972 bp + 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 71448583-71449688(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGGAGTTG
SmilChr01G000576 Chr01 NC_080387.1:11985780-11985794promoter 内 2483-2497 bp - 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 11987298-11989109(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTAGATAAGGAAAGA
SmilChr01G001464 Chr01 NC_080387.1:28442521-28442535promoter 内 2088-2102 bp + 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 28438186-28440622(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTAGATAAGGAAAGA
SmilChr02G000731 Chr02 NC_080388.1:11859661-11859675promoter 内 3300-3314 bp + 687 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 11860362-11863701(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATATCCTTATCTTT
SmilChr01G001402 Chr01 NC_080387.1:27591941-27591955promoter 内 3020-3034 bp + 967 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 27589426-27590974(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTAGATAAGGAAAGA
SmilChr01G005428 Chr01 NC_080387.1:71450717-71450731promoter 内 2890-2904 bp + 1097 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 71451828-71456927(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAACTCCTTATCCTT
SmilChr01G000511 Chr01 NC_080387.1:10399762-10399776promoter 内 2762-2776 bp - 1225 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 10401001-10401339(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTAGATAAGGAAAGA
SmilChr02G000888 Chr02 NC_080388.1:15295010-15295024promoter 内 2315-2329 bp + 1672 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 15289653-15293338(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTAGATAAGGAAAGA
SmilChr02G000853 Chr02 NC_080388.1:14526769-14526783promoter 内 620-634 bp - 3367 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 14530150-14530911(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTAGATAAGGAAAGA
SmilChr01G001218 Chr01 NC_080387.1:24450242-24450256promoter 内 3889-3903 bp - 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 24450354-24518435(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAAGATAAGGAAAAG
SmilChr02G004280 Chr02 NC_080388.1:64991682-64991696promoter 内 3622-3636 bp + 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 64989756-64991317(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGAATAAT
SmilChr02G003447 Chr02 NC_080388.1:55720217-55720231promoter 内 2660-2674 bp + 1327 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 55721558-55722746(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATCTTTCTTATCCTC
SmilChr02G003404 Chr02 NC_080388.1:55216685-55216699promoter 内 2585-2599 bp + 1402 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 55212150-55215283(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATGATAAGGTTAGG
SmilChr01G003081 Chr01 NC_080387.1:49651738-49651752promoter 内 2251-2265 bp + 1736 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 49647605-49650002(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGAATAGT
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SmilChr03G000463 Chr03 NC_080389.1:4959382-4959396promoter 内 1826-1840 bp - 2161 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 4952720-4957221(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CGGATTCTTATCCTC
SmilChr01G002511 Chr01 NC_080387.1:43003251-43003265promoter 内 1601-1615 bp - 2386 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 43005651-43008379(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAGATAAGGTATGC
SmilChr03G002846 Chr03 NC_080389.1:45013525-45013539promoter 内 1468-1482 bp + 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 45016058-45021155(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTCCACCTTATCCGA
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SmilChr03G000599 Chr03 NC_080389.1:6654026-6654040promoter 内 1045-1059 bp + 2942 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 6647610-6651084(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGTGATG