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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 131 / 141 下载 TSV

上一页 131 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G002237 Chr07 NC_080393.1:20562433-20562447promoter 内 1302-1316 bp - 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 2 20558742-20559748(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGATGTCGGTTGGAG
SmilChr07G002025 Chr07 NC_080393.1:18234369-18234383promoter 内 1233-1247 bp + 2754 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 2 18237137-18238066(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TATTGTCGGTAAAAG
SmilChr06G001791 Chr06 NC_080392.1:20961646-20961660promoter 内 3940-3954 bp + 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 20961707-20969620(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAATGGCGGTGGAAA
SmilChr02G002302 Chr02 NC_080388.1:40611855-40611869promoter 内 3915-3929 bp + 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 40607092-40611783(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGACTTGA
SmilChr06G000973 Chr06 NC_080392.1:9434564-9434578promoter 内 3867-3881 bp - 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 9434698-9437266(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAAACACCGACGGAG
SmilChr02G001387 Chr02 NC_080388.1:26364773-26364787promoter 内 3732-3746 bp + 255 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 26364027-26364518(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCCCCACCGACCCTA
SmilChr02G004000 Chr02 NC_080388.1:62344323-62344337promoter 内 3696-3710 bp + 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 62339553-62344032(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGACTTGA
SmilChr05G001766 Chr05 NC_080391.1:17384763-17384777promoter 内 3696-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 17385068-17389540(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGACTTGA
SmilChr05G002263 Chr05 NC_080391.1:24340214-24340228promoter 内 3696-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 24340519-24344991(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGACTTGA
SmilChr06G000052 Chr06 NC_080392.1:423240-423254promoter 内 3696-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 423545-428023(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGACTTGA
SmilChr08G002670 Chr08 NC_080394.1:26206877-26206891promoter 内 3696-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 26207182-26211654(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGACTTGA
SmilChr06G001848 Chr06 NC_080392.1:21807078-21807092promoter 内 3683-3697 bp + 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 21805974-21806774(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTTCACCGACTATT
SmilChr02G004493 Chr02 NC_080388.1:67441876-67441890promoter 内 3672-3686 bp - 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 67439425-67441561(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCGAGTCGGTGGTAA
SmilChr07G004441 Chr07 NC_080393.1:57053762-57053776promoter 内 3651-3665 bp - 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 57053343-57053426(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTGTGACGGTGGACT
SmilChr08G000074 Chr08 NC_080394.1:432815-432829promoter 内 3651-3665 bp - 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 433165-435581(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCCTTGCCGACAAAC
SmilChr07G003740 Chr07 NC_080393.1:45561709-45561723promoter 内 3605-3619 bp - 382 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 45562105-45570492(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTTCACCGACTATT
SmilChr03G002302 Chr03 NC_080389.1:36240610-36240624promoter 内 3478-3492 bp - 509 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 36241133-36243860(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTTCACCGACGTTA
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SmilChr03G001857 Chr03 NC_080389.1:25614477-25614491promoter 内 3365-3379 bp - 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 25615113-25623695(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTTCACCGACTATT
SmilChr05G002081 Chr05 NC_080391.1:21743870-21743884promoter 内 3251-3265 bp - 736 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 21744620-21746183(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTCAACCGACAGCA
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SmilChr07G001301 Chr07 NC_080393.1:9992175-9992189promoter 内 3201-3215 bp + 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 9979735-9991389(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCATCACCGACTTCC
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SmilChr03G001256 Chr03 NC_080389.1:14485612-14485626promoter 内 3156-3170 bp + 831 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 14483713-14484781(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGAACACCGACGGAA
SmilChr02G000841 Chr02 NC_080388.1:14258163-14258177promoter 内 3123-3137 bp - 864 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 14259041-14261920(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTTCACCGACGTTA
SmilChr01G000786 Chr01 NC_080387.1:17137144-17137158promoter 内 3118-3132 bp - 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 17138027-17138815(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTTCACCGACTATT
SmilChr08G003949 Chr08 NC_080394.1:47276028-47276042promoter 内 3098-3112 bp + 889 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 47276931-47277746(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCAAGTCGGTGGAGA
SmilChr03G003012 Chr03 NC_080389.1:47020304-47020318promoter 内 3090-3104 bp - 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 47021215-47022940(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACAACACCGACGTTT
SmilChr07G001247 Chr07 NC_080393.1:9588928-9588942promoter 内 3069-3083 bp - 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 9585961-9588010(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGAAGTCGGTGATGG
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SmilChr02G001386 Chr02 NC_080388.1:26364773-26364787promoter 内 3031-3045 bp + 956 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 26358554-26363817(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCCCCACCGACCCTA
SmilChr01G000685 Chr01 NC_080387.1:15312406-15312420promoter 内 3022-3036 bp - 965 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 15310308-15311441(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGCTGTCGGTCGGTT
SmilChr02G001231 Chr02 NC_080388.1:22605485-22605499promoter 内 2971-2985 bp - 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 22603579-22604469(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGTTGTCGGCTATGG
SmilChr05G003695 Chr05 NC_080391.1:50064849-50064863promoter 内 2956-2970 bp + 1031 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 50061296-50063818(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AATCCACCGCCGCCC
SmilChr07G000733 Chr07 NC_080393.1:5110335-5110349promoter 内 2904-2918 bp + 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 5109171-5109252(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTACAACCGACAGCA
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SmilChr01G005540 Chr01 NC_080387.1:72231591-72231605promoter 内 2781-2795 bp + 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 72229168-72230385(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTCCACCGCCGAAT
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SmilChr08G004448 Chr08 NC_080394.1:54209755-54209769promoter 内 2736-2750 bp - 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 54206478-54208504(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGATGTCGGTAGGAC
SmilChr07G001794 Chr07 NC_080393.1:15298115-15298129promoter 内 2728-2742 bp - 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 15294363-15296856(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTCTGGCGGTGGAAA
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SmilChr02G000129 Chr02 NC_080388.1:1753098-1753112promoter 内 2690-2704 bp + 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 1754409-1755279(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCAAGTCGGTGGAGA
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SmilChr06G002383 Chr06 NC_080392.1:34651084-34651098promoter 内 2515-2529 bp - 1472 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 34652570-34655259(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTTCACCGACTATT
SmilChr03G002179 Chr03 NC_080389.1:33868761-33868775promoter 内 2504-2518 bp + 1483 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 33863274-33867278(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCACCACCGACCATC