转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G004179; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00012156-RA_Salv SmilChr03G004179 WRKY XP_057799230.1 MP00464 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9864 个结合位点 7299 个候选靶基因 第 134 / 146 下载 TSV

上一页 134 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004763 Chr01 NC_080387.1:65804596-65804609promoter 内 2899-2912 bp + 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 65799425-65803507(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAAAAGTCAAAAAA
SmilChr03G003087 Chr03 NC_080389.1:47915403-47915416promoter 内 2894-2907 bp + 1094 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 47914238-47914309(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTAAAGTCAAAATC
SmilChr02G000931 Chr02 NC_080388.1:16233814-16233827promoter 内 2844-2857 bp + 1144 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 16234971-16238879(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATTTTTGACTTTGT
SmilChr04G004081 Chr04 NC_080390.1:55866835-55866848promoter 内 2837-2850 bp + 1151 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 55858332-55865684(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGCAAGTCAACAAA
SmilChr03G002493 Chr03 NC_080389.1:39714010-39714023promoter 内 2808-2821 bp + 1180 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 39715203-39718804(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCTGTTGACTAGTT
SmilChr01G002964 Chr01 NC_080387.1:48521036-48521049promoter 内 2799-2812 bp + 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 48522238-48524845(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAATTTGACTTTCA
SmilChr05G000039 Chr05 NC_080391.1:183316-183329promoter 内 2794-2807 bp + 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 178118-182122(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AACAAGTCAAAACC
SmilChr02G000510 Chr02 NC_080388.1:7046020-7046033promoter 内 2776-2789 bp + 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 7047245-7048232(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGGTTTGACTTGTC
SmilChr01G004363 Chr01 NC_080387.1:61818061-61818074promoter 内 2751-2764 bp - 1237 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 61814118-61816824(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATAGTTGACTAATG
SmilChr02G003528 Chr02 NC_080388.1:56427056-56427069promoter 内 2749-2762 bp - 1239 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 56428308-56429727(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGAAAGTCAAATAA
SmilChr03G001997 Chr03 NC_080389.1:29651944-29651957promoter 内 2710-2723 bp + 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 29653235-29657533(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATCGTTGACCACGG
SmilChr03G003086 Chr03 NC_080389.1:47915403-47915416promoter 内 2659-2672 bp + 1329 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 47912099-47914074(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTAAAGTCAAAATC
SmilChr04G001234 Chr04 NC_080390.1:19354291-19354304promoter 内 2650-2663 bp - 1338 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 19355642-19357036(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTTTAGTCAACGAT
SmilChr02G003489 Chr02 NC_080388.1:56146006-56146019promoter 内 2639-2652 bp + 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 56147368-56149864(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTTTTTGACTTTTT
SmilChr02G003864 Chr02 NC_080388.1:60603231-60603244promoter 内 2603-2616 bp - 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 60604629-60606214(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCTTAGTCAACGTA
SmilChr02G001300 Chr02 NC_080388.1:24132390-24132403promoter 内 2592-2605 bp + 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 24130922-24130994(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACATAGTCAACAAG
SmilChr02G001424 Chr02 NC_080388.1:26889960-26889973promoter 内 2580-2593 bp + 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 26884547-26888552(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAGGAGTCAACCAT
SmilChr01G002962 Chr01 NC_080387.1:48521036-48521049promoter 内 2578-2591 bp + 1410 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 48514321-48519626(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGAAAGTCAAATTT
SmilChr02G005268 Chr02 NC_080388.1:73764359-73764372promoter 内 2563-2576 bp - 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 73760188-73762934(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGAGTTGACTAATT
SmilChr03G004404 Chr03 NC_080389.1:62218003-62218016promoter 内 2551-2564 bp + 1437 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 62219453-62223547(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AATTTTGACTTTTA
SmilChr04G003970 Chr04 NC_080390.1:55167878-55167891promoter 内 2551-2564 bp + 1437 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 55169328-55173066(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCCTTTGACTTAAG
SmilChr04G000548 Chr04 NC_080390.1:6121903-6121916promoter 内 2516-2529 bp + 1472 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 6123388-6125587(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTTTTTGACTTTTT
SmilChr03G003059 Chr03 NC_080389.1:47482055-47482068promoter 内 2496-2509 bp - 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 47479371-47480563(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGGATTGACTTTAT
SmilChr03G001142 Chr03 NC_080389.1:13171218-13171231promoter 内 2494-2507 bp + 1494 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 13172725-13173879(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGGATTGACTTTAT
SmilChr02G000691 Chr02 NC_080388.1:11012950-11012963promoter 内 2491-2504 bp - 1497 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 11010617-11011453(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGGATTGACTTTAT
SmilChr02G001071 Chr02 NC_080388.1:19078610-19078623promoter 内 2490-2503 bp - 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 19076594-19077112(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGGATTGACTTTAT
SmilChr03G004637 Chr03 NC_080389.1:63987188-63987201promoter 内 2489-2502 bp - 1499 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 63983064-63985689(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAAGTTGACTCGTT
SmilChr04G002009 Chr04 NC_080390.1:32588096-32588109promoter 内 2488-2501 bp - 1500 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 32585835-32586596(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGGATTGACTTTAT
SmilChr03G001932 Chr03 NC_080389.1:27146182-27146195promoter 内 2481-2494 bp - 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 27141191-27144675(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AATTTTGACTTTTA
SmilChr04G001272 Chr04 NC_080390.1:20237054-20237067promoter 内 2472-2485 bp + 1516 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 20234331-20235538(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTTGAGTCAACGGT
SmilChr03G000171 Chr03 NC_080389.1:1881932-1881945promoter 内 2468-2481 bp - 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 1876652-1880412(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTAGTTGACTAGTA
SmilChr04G003430 Chr04 NC_080390.1:50881178-50881191promoter 内 2436-2449 bp - 1552 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 50877702-50879626(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGGGTTGACTCGTA
SmilChr01G003691 Chr01 NC_080387.1:55281453-55281466promoter 内 2432-2445 bp - 1556 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 55276083-55279897(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAATTTGACTTTCA
SmilChr04G001814 Chr04 NC_080390.1:29637744-29637757promoter 内 2372-2385 bp - 1616 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 29639373-29642256(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AACCAGTCAACTCC
SmilChr01G003043 Chr01 NC_080387.1:49414898-49414911promoter 内 2360-2373 bp - 1628 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 49409196-49413270(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATGGTTGACTACCG
SmilChr03G003336 Chr03 NC_080389.1:51628780-51628793promoter 内 2344-2357 bp - 1644 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 51624445-51627136(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGTGTTGACTTGAA
SmilChr04G001096 Chr04 NC_080390.1:15681684-15681697promoter 内 2342-2355 bp + 1646 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 15677664-15680038(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAAAGTCAGCGCT
SmilChr02G000007 Chr02 NC_080388.1:63681-63694promoter 内 2332-2345 bp - 1656 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 60632-62025(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTAGTTGACTGTGA
SmilChr03G000019 Chr03 NC_080389.1:230057-230070promoter 内 2257-2270 bp - 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 226229-228326(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAGGTTGACTAGCT
SmilChr01G005582 Chr01 NC_080387.1:72525835-72525848promoter 内 2248-2261 bp - 1740 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 72523486-72524095(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGATTTGACTTTAA
SmilChr02G005431 Chr02 NC_080388.1:74741627-74741640promoter 内 2189-2202 bp - 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 74737112-74739828(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTTTTTGACTTTTT
SmilChr01G002973 Chr01 NC_080387.1:48671883-48671896promoter 内 2177-2190 bp + 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 48673707-48675678(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGGGTTGACTCGTA
SmilChr03G000757 Chr03 NC_080389.1:8642841-8642854promoter 内 2176-2189 bp + 1812 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 8644666-8646235(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GACGTTGACCGTCC
SmilChr01G004601 Chr01 NC_080387.1:63993587-63993600promoter 内 2161-2174 bp + 1827 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 63995427-64002877(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCTTTTGACTTTGG
SmilChr01G002113 Chr01 NC_080387.1:37167917-37167930promoter 内 2140-2153 bp - 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 37165997-37166069(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATGGTTGACTACCG
SmilChr01G002112 Chr01 NC_080387.1:37167917-37167930promoter 内 2042-2055 bp - 1946 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 37163586-37165971(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATGGTTGACTACCG
SmilChr03G004371 Chr03 NC_080389.1:61911094-61911107promoter 内 2038-2051 bp + 1950 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 61913057-61915900(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AATTTTGACTTTTA
SmilChr04G001489 Chr04 NC_080390.1:24340075-24340088promoter 内 2030-2043 bp + 1958 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 24336566-24338117(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTAAAGTCAAAATC
SmilChr02G002787 Chr02 NC_080388.1:47938990-47939003promoter 内 2024-2037 bp - 1964 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 47940967-47944805(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTAAAGTCAATGCA
SmilChr02G003401 Chr02 NC_080388.1:55155711-55155724promoter 内 1983-1996 bp - 2005 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 55147313-55153706(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGAGTTGACTCGTA