Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003805; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00020790-RA_Salv SmilChr04G003805 MIKC_MADS XP_057805691.1 MP00315 TTTCCAAAAAAGGAAAAAA

可能结合的靶基因

9567 个结合位点 7291 个候选靶基因 第 134 / 146 下载 TSV

上一页 134 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr05G001776 Chr05 NC_080391.1:17471514-17471532promoter 内 3708-3726 bp - 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 17471807-17476271(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTTTTCTTTTTTTGGTTG
SmilChr01G004848 Chr01 NC_080387.1:66628538-66628556promoter 内 3703-3721 bp - 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 66628836-66635960(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTTTTCCTTTTTGGGACG
SmilChr07G000465 Chr07 NC_080393.1:3273097-3273115promoter 内 3692-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 3271460-3272806(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CGTCCCAAAAAGGAAAAAG
SmilChr04G000022 Chr04 NC_080390.1:255313-255331promoter 内 3663-3681 bp - 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 255651-258098(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTACTATTTTTGGTGA
SmilChr05G000397 Chr05 NC_080391.1:2993373-2993391promoter 内 3654-3672 bp - 329 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 2993720-2995559(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 GTTTTACTCTTTTTGGTAG
SmilChr01G000554 Chr01 NC_080387.1:11520296-11520314promoter 内 3575-3593 bp + 408 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 11517300-11519888(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTTCCAATTTTGTATA
SmilChr04G003347 Chr04 NC_080390.1:50108102-50108120promoter 内 3571-3589 bp + 412 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 50108532-50109456(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 GTCCCAAAATAGGAAAAAA
SmilChr07G003911 Chr07 NC_080393.1:49343176-49343194promoter 内 3523-3541 bp + 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 49331621-49342716(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTTCCAATTTTGTATA
SmilChr01G000060 Chr01 NC_080387.1:959769-959787promoter 内 3521-3539 bp - 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 957173-959307(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CGTCCCAAAAAGGAAAAAG
SmilChr08G003538 Chr08 NC_080394.1:38031883-38031901promoter 内 3521-3539 bp + 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 38030295-38031421(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTTCCAATTTTGTATA
SmilChr07G002262 Chr07 NC_080393.1:20819306-20819324promoter 内 3519-3537 bp + 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 20816555-20818842(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTTTTCCTTTTTGGGACG
SmilChr01G004524 Chr01 NC_080387.1:63441488-63441506promoter 内 3423-3441 bp - 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 63439237-63440928(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTGCAGAAGTGGAAAAAA
SmilChr07G000417 Chr07 NC_080393.1:2880929-2880947promoter 内 3389-3407 bp + 594 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 2877742-2880335(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ACCTACCTATTTTTGGTAA
SmilChr01G004575 Chr01 NC_080387.1:63798302-63798320promoter 内 3354-3372 bp + 629 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 63793365-63797673(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCTGTTCCTTTTTAAGAAA
SmilChr01G005512 Chr01 NC_080387.1:71962229-71962247promoter 内 3317-3335 bp - 666 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 71959914-71961563(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CGTCCCAAAAAGGAAAAAG
SmilChr07G003158 Chr07 NC_080393.1:33507281-33507299promoter 内 3311-3329 bp + 672 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 33507971-33508462(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCAAAAAAAGAAGCCC
SmilChr06G001028 Chr06 NC_080392.1:10206441-10206459promoter 内 3299-3317 bp - 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 10202881-10205757(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TATCTCTAAAAGGAATAAA
SmilChr01G001265 Chr01 NC_080387.1:25346439-25346457promoter 内 3250-3268 bp + 733 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 25343733-25345706(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTGAGTCA
SmilChr06G001192 Chr06 NC_080392.1:12185782-12185800promoter 内 3249-3267 bp - 734 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 12182339-12185048(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTCCAAATAAAGTAAAAT
SmilChr01G000675 Chr01 NC_080387.1:14953227-14953245promoter 内 3242-3260 bp - 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 14951533-14952486(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCAAAAAAAGAAGCCC
SmilChr04G002450 Chr04 NC_080390.1:39224696-39224714promoter 内 3239-3257 bp - 744 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 39225458-39228680(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCTTCTTTTTTTGGTTT
SmilChr03G001324 Chr03 NC_080389.1:15491168-15491186promoter 内 3220-3238 bp + 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 15491949-15495918(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CGTCCCAAAAAGGAAAAAG
SmilChr05G002666 Chr05 NC_080391.1:30158606-30158624promoter 内 3199-3217 bp + 784 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 30154774-30157822(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 AAGTTTCCTTTTGGGGTTT
SmilChr01G003029 Chr01 NC_080387.1:49345243-49345261promoter 内 3175-3193 bp + 808 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 49346069-49350693(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATTCCAAATGTAGCAAAAA
SmilChr01G000175 Chr01 NC_080387.1:2851368-2851386promoter 内 3160-3178 bp - 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 2852209-2853163(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTTTTCCTTTTTGGGACG
SmilChr07G000728 Chr07 NC_080393.1:5067903-5067921promoter 内 3035-3053 bp + 948 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 5063637-5066955(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTTTTCCTTTTTGGGACG
SmilChr01G002929 Chr01 NC_080387.1:48065112-48065130promoter 内 3013-3031 bp - 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 48061372-48064142(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAAATGAAAGAG
SmilChr02G000577 Chr02 NC_080388.1:8288749-8288767promoter 内 2960-2978 bp + 1023 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 8284708-8287726(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTTCCAATTTTGTATA
SmilChr06G001032 Chr06 NC_080392.1:10251077-10251095promoter 内 2950-2968 bp - 1033 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 10252128-10252563(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTTCCTATTTTGGGAC
SmilChr03G002289 Chr03 NC_080389.1:36077775-36077793promoter 内 2900-2918 bp - 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 36072782-36076692(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTCCAAAAAAAGGAAATT
SmilChr06G001662 Chr06 NC_080392.1:18918753-18918771promoter 内 2882-2900 bp + 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 18919872-18922456(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATTCCAAATGTAGCAAAAA
SmilChr08G000622 Chr08 NC_080394.1:4651828-4651846promoter 内 2862-2880 bp - 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 4650150-4650707(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAAATGAAAGAG
SmilChr01G005702 Chr01 NC_080387.1:73266620-73266638promoter 内 2845-2863 bp + 1138 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 73262006-73265482(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATTATTCTTATTTTGGATA
SmilChr08G000472 Chr08 NC_080394.1:3365578-3365596promoter 内 2829-2847 bp + 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 3366750-3370467(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CGTCCCAAAAAGGAAAAAG
SmilChr08G001146 Chr08 NC_080394.1:9044469-9044487promoter 内 2810-2828 bp + 1173 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 9039284-9043296(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 GTTTTTCTCTTTTTGGGTA
SmilChr06G000158 Chr06 NC_080392.1:1108133-1108151promoter 内 2779-2797 bp - 1204 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 1099097-1106929(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATTCCAAATGTAGCAAAAA
SmilChr01G002634 Chr01 NC_080387.1:44627711-44627729promoter 内 2766-2784 bp - 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 44621596-44626494(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCAAAAAAAGGAAAAAG
SmilChr07G004259 Chr07 NC_080393.1:55027836-55027854promoter 内 2752-2770 bp + 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 55023925-55026605(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTTTTCCTTTTTGGGACG
SmilChr01G001266 Chr01 NC_080387.1:25346439-25346457promoter 内 2750-2768 bp + 1233 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 25347690-25350063(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TGACTCAAAAAGGAAATGA
SmilChr06G001344 Chr06 NC_080392.1:14010605-14010623promoter 内 2750-2768 bp - 1233 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 14011856-14012600(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTTTTCCTTTTTGGGACG
SmilChr06G001385 Chr06 NC_080392.1:14494370-14494388promoter 内 2749-2767 bp - 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 14495622-14496366(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTTTTCCTTTTTGGGACG
SmilChr05G002115 Chr05 NC_080391.1:22201963-22201981promoter 内 2712-2730 bp + 1271 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 22203252-22205949(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCTGAGAATGGAAAAAA
SmilChr04G000021 Chr04 NC_080390.1:255313-255331promoter 内 2702-2720 bp - 1281 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 253223-254032(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCACCAAAAATAGTAAAAA
SmilChr08G002265 Chr08 NC_080394.1:20909487-20909505promoter 内 2689-2707 bp - 1294 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 20910799-20913071(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTTTTTCCTTTTTGGGACG
SmilChr03G001283 Chr03 NC_080389.1:15013247-15013265promoter 内 2665-2683 bp + 1318 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 15014583-15017645(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATACTTAAAAAGGAAATTG
SmilChr07G002590 Chr07 NC_080393.1:24848778-24848796promoter 内 2661-2679 bp + 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 24843822-24847456(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTCTTTCTATTTTTGGACT
SmilChr02G000946 Chr02 NC_080388.1:16480247-16480265promoter 内 2572-2590 bp + 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 16481676-16483898(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CGTCCCAAAAAGGAAAAAG
SmilChr07G000182 Chr07 NC_080393.1:1166366-1166384promoter 内 2540-2558 bp - 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 1157766-1164923(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 GTGCCTAAACAGGAAAATT
SmilChr07G002869 Chr07 NC_080393.1:28901081-28901099promoter 内 2485-2503 bp - 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 28895037-28899583(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTACAGAATTGGAAAAAT
SmilChr07G000440 Chr07 NC_080393.1:3075116-3075134promoter 内 2483-2501 bp + 1500 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 3070814-3073616(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATCTTACTATTTTTGGTTG