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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003924; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010794-RA_Salv SmilChr03G003924 NAC XP_057798851.1 MP00059 TAACACGCCACA

可能结合的靶基因

9940 个结合位点 8333 个候选靶基因 第 17 / 167 下载 TSV

上一页 17 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002926 Chr02 NC_080388.1:49664161-49664172promoter 内 1952-1963 bp + 2038 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 49666210-49667026(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TTACACGCCACC
SmilChr01G005378 Chr01 NC_080387.1:71007567-71007578promoter 内 1736-1747 bp - 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 70999770-71005313(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGGCACGCCACA
SmilChr08G004168 Chr08 NC_080394.1:50995373-50995384promoter 内 1637-1648 bp - 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 50990790-50993020(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCACACGCCACT
SmilChr08G001329 Chr08 NC_080394.1:10625704-10625715promoter 内 1596-1607 bp + 2394 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 10619952-10623310(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGTTT
SmilChr04G002145 Chr04 NC_080390.1:34482942-34482953promoter 内 1511-1522 bp - 2479 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 34485432-34490275(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGTTT
SmilChr04G000763 Chr04 NC_080390.1:9306954-9306965promoter 内 1497-1508 bp + 2493 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 9303211-9304461(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGCGT
SmilChr04G001985 Chr04 NC_080390.1:32147968-32147979promoter 内 1405-1416 bp - 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 32143712-32145383(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AAACACGCCACC
SmilChr08G003795 Chr08 NC_080394.1:43841926-43841937promoter 内 1349-1360 bp - 2641 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 43844578-43845701(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGTTT
SmilChr07G004594 Chr07 NC_080393.1:58729683-58729694promoter 内 1331-1342 bp - 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 58732353-58735726(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGTGGCGTGTTT
SmilChr03G001541 Chr03 NC_080389.1:19315416-19315427promoter 内 1327-1338 bp + 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 19308598-19312753(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGTTT
SmilChr05G002186 Chr05 NC_080391.1:23354724-23354735promoter 内 1211-1222 bp - 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 23357514-23357599(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTC
SmilChr05G002187 Chr05 NC_080391.1:23354724-23354735promoter 内 1189-1200 bp - 2801 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 23357536-23363109(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTC
SmilChr03G001300 Chr03 NC_080389.1:15227636-15227647promoter 内 1169-1180 bp + 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 15222696-15224815(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGTGGCGTGTAA
SmilChr02G002927 Chr02 NC_080388.1:49664161-49664172promoter 内 980-991 bp + 3010 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 49667182-49668027(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TTACACGCCACC
SmilChr03G002883 Chr03 NC_080389.1:45514945-45514956promoter 内 869-880 bp + 3121 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 45511281-45511824(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGCCT
SmilChr04G002724 Chr04 NC_080390.1:42853574-42853585promoter 内 844-855 bp + 3146 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 42850356-42850428(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGCAG
SmilChr05G003477 Chr05 NC_080391.1:46158424-46158435promoter 内 797-808 bp + 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 46154175-46155231(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTGA
SmilChr02G005166 Chr02 NC_080388.1:73000390-73000401promoter 内 727-738 bp + 3263 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 72994608-72997127(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTGA
SmilChr01G000180 Chr01 NC_080387.1:3045859-3045870promoter 内 570-581 bp - 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 3040681-3042439(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AAACACGCCACC
SmilChr06G002812 Chr06 NC_080392.1:40824716-40824727promoter 内 484-495 bp + 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 40819244-40821210(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGT
SmilChr07G000399 Chr07 NC_080393.1:2756626-2756637promoter 内 474-485 bp + 3516 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 2753032-2753110(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGTAA
SmilChr02G003835 Chr02 NC_080388.1:60045034-60045045promoter 内 454-465 bp + 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 60033926-60041498(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGTTT
SmilChr01G002047 Chr01 NC_080387.1:36248380-36248391promoter 内 447-458 bp + 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 36242712-36244837(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTCT
SmilChr01G002977 Chr01 NC_080387.1:48719281-48719292promoter 内 437-448 bp + 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 48714807-48715728(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGTTT
SmilChr01G002028 Chr01 NC_080387.1:35841853-35841864promoter 内 415-426 bp - 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 35845439-35847576(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTCT
SmilChr03G003010 Chr03 NC_080389.1:46966040-46966051promoter 内 285-296 bp + 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 46940075-46962335(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGTTT
SmilChr01G004352 Chr01 NC_080387.1:61723812-61723823promoter 内 210-221 bp - 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 61717133-61720032(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGACACGCCACA
SmilChr07G003936 Chr07 NC_080393.1:49688518-49688529promoter 内 92-103 bp - 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 49692427-49697324(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTAC
SmilChr01G004468 Chr01 NC_080387.1:62770533-62770544promoter 内 82-93 bp - 3908 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 62762008-62766625(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCACACGCCACT
SmilChr03G001922 Chr03 NC_080389.1:26945295-26945306promoter 内 35-46 bp + 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 26939335-26941340(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GTTGGCGTGCTC
SmilChr05G002649 Chr05 NC_080391.1:29977108-29977119promoter 内 3907-3918 bp + 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 29977202-29978950(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGGCACGCCAAC
SmilChr05G004120 Chr05 NC_080391.1:55107730-55107741promoter 内 3683-3694 bp + 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 55108048-55113002(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CAGCACGCCAAC
SmilChr07G003306 Chr07 NC_080393.1:35057126-35057137promoter 内 3615-3626 bp + 375 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 35057512-35059042(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAGCACGCCACA
SmilChr04G003505 Chr04 NC_080390.1:51447379-51447390promoter 内 3321-3332 bp + 669 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 51448059-51449794(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAGCACGCCAAG
SmilChr01G006010 Chr01 NC_080387.1:75656929-75656940promoter 内 2860-2871 bp + 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 75658070-75662073(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAACACGCCACA
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SmilChr01G005911 Chr01 NC_080387.1:74968152-74968163promoter 内 310-321 bp + 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 74963277-74964472(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GTTGGCGTGCCA
SmilChr05G002647 Chr05 NC_080391.1:29904515-29904526promoter 内 3849-3860 bp + 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 29904667-29906354(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGGCACGCCAAC
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SmilChr01G001785 Chr01 NC_080387.1:32731568-32731579promoter 内 3583-3594 bp - 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 32731986-32737720(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTTA
SmilChr02G002540 Chr02 NC_080388.1:44233571-44233582promoter 内 3221-3232 bp + 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 44229787-44232802(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTTA
SmilChr05G002222 Chr05 NC_080391.1:23738430-23738441promoter 内 3157-3168 bp + 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 23739274-23747335(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAACACGCCACA
SmilChr07G002051 Chr07 NC_080393.1:18622321-18622332promoter 内 3127-3138 bp + 863 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 18623195-18627578(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CAGCACGCCAAG