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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022980-RA_Salv SmilChr01G002885 ERF XP_057767601.1 MP00151 ATGGACGGTGGAGG

可能结合的靶基因

9976 个结合位点 6907 个候选靶基因 第 21 / 139 下载 TSV

上一页 21 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001239 Chr01 NC_080387.1:24811587-24811600promoter 内 2587-2600 bp - 1401 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 24797033-24810186(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGAGA
SmilChr03G000501 Chr03 NC_080389.1:5395962-5395975promoter 内 2427-2440 bp + 1561 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 5393394-5394401(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTCGCGCCGTCCAC
SmilChr05G004277 Chr05 NC_080391.1:56562817-56562830promoter 内 2020-2033 bp - 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56564798-56566084(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGTCCCA
SmilChr02G004031 Chr02 NC_080388.1:62602002-62602015promoter 内 2016-2029 bp - 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 62598530-62600030(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGTGAGGT
SmilChr02G000156 Chr02 NC_080388.1:2027064-2027077promoter 内 1982-1995 bp - 2006 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 2021802-2025058(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGCGAG
SmilChr03G003579 Chr03 NC_080389.1:54396448-54396461promoter 内 1943-1956 bp + 2045 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 54398506-54399648(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGGAAT
SmilChr05G001879 Chr05 NC_080391.1:19058084-19058097promoter 内 714-727 bp + 3274 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 19061371-19063913(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGCGAG
SmilChr02G004032 Chr02 NC_080388.1:62602002-62602015promoter 内 672-685 bp - 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 62605331-62622002(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACCTCACCGTCCAC
SmilChr03G000370 Chr03 NC_080389.1:4148567-4148580promoter 内 587-600 bp - 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 4143797-4145166(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGTGGAAC
SmilChr02G004007 Chr02 NC_080388.1:62408665-62408678promoter 内 506-519 bp + 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 62404052-62405183(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTTCCACCGTCCAT
SmilChr03G003902 Chr03 NC_080389.1:58118900-58118913promoter 内 431-444 bp - 3557 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 58122470-58125884(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTCGCGCCGTCCAC
SmilChr03G002568 Chr03 NC_080389.1:40875657-40875670promoter 内 320-333 bp - 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 40871282-40871989(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGGAAT
SmilChr01G001620 Chr01 NC_080387.1:30306919-30306932promoter 内 212-225 bp - 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 30300687-30303143(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGGGACGGTGGCGA
SmilChr03G000372 Chr03 NC_080389.1:4163090-4163103promoter 内 162-175 bp - 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 4158434-4159264(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGTGGAAC
SmilChr06G001772 Chr06 NC_080392.1:20750857-20750870promoter 内 15-28 bp - 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 20743066-20746884(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTGGACGGAGGCGG
SmilChr04G000355 Chr04 NC_080390.1:3413705-3413718promoter 内 3864-3877 bp - 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 8 3410233-3413581(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGTGACGGTGGAGG
SmilChr04G000356 Chr04 NC_080390.1:3414120-3414133promoter 内 3823-3836 bp - 165 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 6 3413581-3413955(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGTGACGGTGGAGG
SmilChr01G004902 Chr01 NC_080387.1:67087996-67088009promoter 内 3654-3667 bp + 334 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 5 67088343-67092059(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGTGGCCA
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SmilChr01G004372 Chr01 NC_080387.1:61922824-61922837promoter 内 1292-1305 bp + 2696 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 4 61925533-61927324(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGCGAAGA
SmilChr06G001811 Chr06 NC_080392.1:21279004-21279017promoter 内 2799-2812 bp + 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 21277090-21277815(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGCCACCGTCGAT
SmilChr05G002045 Chr05 NC_080391.1:21284796-21284809promoter 内 3836-3849 bp + 152 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 21284961-21285030(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGTGCGGC
SmilChr02G003459 Chr02 NC_080388.1:55892445-55892458promoter 内 2808-2821 bp - 1180 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 55893638-55894763(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACACCACCGTCCAG
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SmilChr02G003634 Chr02 NC_080388.1:57687007-57687020promoter 内 2265-2278 bp - 1723 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 57677485-57685284(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATCGACGGTGGCGG
SmilChr03G001019 Chr03 NC_080389.1:11715687-11715700promoter 内 2262-2275 bp - 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 11717426-11718501(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACCGCGCCGTCCAC
SmilChr03G003103 Chr03 NC_080389.1:48132956-48132969promoter 内 1027-1040 bp - 2961 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 48135930-48142430(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACACCACCGTCCAG
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SmilChr03G001606 Chr03 NC_080389.1:20413540-20413553promoter 内 601-614 bp - 3387 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 20407165-20410153(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GATGACGGTGGTGG
SmilChr02G000353 Chr02 NC_080388.1:4576988-4577001promoter 内 444-457 bp - 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 4558223-4573444(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGCGAAGA
SmilChr01G004977 Chr01 NC_080387.1:67832411-67832424promoter 内 276-289 bp - 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 67836136-67837071(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCGCCACCGTCAAA
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SmilChr03G004343 Chr03 NC_080389.1:61727783-61727796promoter 内 3675-3688 bp - 313 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61724727-61727470(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGGATT
SmilChr06G002379 Chr06 NC_080392.1:34631658-34631671promoter 内 3516-3529 bp - 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 34632143-34635268(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGCCACCGTCGAT
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SmilChr03G002715 Chr03 NC_080389.1:43110091-43110104promoter 内 3178-3191 bp - 810 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 43110914-43112917(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCCACCGTCACC
SmilChr01G000743 Chr01 NC_080387.1:16434164-16434177promoter 内 3137-3150 bp + 851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 16435028-16436925(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGTGACGGTGGAGG
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SmilChr01G004088 Chr01 NC_080387.1:59284017-59284030promoter 内 303-316 bp + 3685 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 59287715-59289915(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGAACG
SmilChr05G001882 Chr05 NC_080391.1:19088913-19088926promoter 内 717-730 bp + 3271 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 19092197-19094948(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGAACG
SmilChr03G001731 Chr03 NC_080389.1:23267035-23267048promoter 内 661-674 bp - 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 23261323-23263708(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGAACG