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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 23 / 149 下载 TSV

上一页 23 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002776 Chr02 NC_080388.1:47831712-47831726promoter 内 2708-2722 bp - 1279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 47833005-47834022(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAATGGATAATGAT
SmilChr02G002777 Chr02 NC_080388.1:47831712-47831726promoter 内 1327-1341 bp - 2660 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 47834386-47836088(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAATGGATAATGAT
SmilChr03G003161 Chr03 NC_080389.1:48967266-48967280promoter 内 3674-3688 bp + 313 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 48967593-48969350(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCTTATCCACTGA
SmilChr04G000123 Chr04 NC_080390.1:1056061-1056075promoter 内 2828-2842 bp + 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 1057234-1061256(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCTTATCTATATG
SmilChr01G000583 Chr01 NC_080387.1:12595960-12595974promoter 内 2109-2123 bp - 1878 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 12597852-12601439(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTAGTGGATAACGTG
SmilChr02G005062 Chr02 NC_080388.1:72308390-72308404promoter 内 1617-1631 bp + 2370 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 72310774-72312312(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTTATCCATTCT
SmilChr02G004303 Chr02 NC_080388.1:65417153-65417167promoter 内 1457-1471 bp + 2530 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 65419697-65421066(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCATTATCCAAATC
SmilChr02G004862 Chr02 NC_080388.1:70753967-70753981promoter 内 991-1005 bp - 2996 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 70749785-70750971(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCATTATCCACAAA
SmilChr02G004863 Chr02 NC_080388.1:70753967-70753981promoter 内 647-661 bp - 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 70757321-70760043(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTGTGGATAATGAT
SmilChr04G003971 Chr04 NC_080390.1:55171927-55171941promoter 内 464-478 bp + 3523 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 55175464-55179037(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATTTA
SmilChr01G002482 Chr01 NC_080387.1:42555896-42555910promoter 内 3945-3959 bp - 42 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 42554436-42555854(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCAAAAT
SmilChr01G001329 Chr01 NC_080387.1:26464023-26464037promoter 内 3938-3952 bp + 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 26464086-26473494(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCAAATT
SmilChr01G001610 Chr01 NC_080387.1:30253108-30253122promoter 内 3606-3620 bp - 381 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 30253503-30255496(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTGTGGATAAGGGA
SmilChr04G003484 Chr04 NC_080390.1:51294892-51294906promoter 内 3409-3423 bp - 578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 51293370-51294314(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCAAATC
SmilChr02G001226 Chr02 NC_080388.1:22544019-22544033promoter 内 3228-3242 bp + 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 22542391-22543260(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTGCGGATAAGGTG
SmilChr03G003157 Chr03 NC_080389.1:48917845-48917859promoter 内 3017-3031 bp - 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 48915545-48916875(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATTTA
SmilChr04G003566 Chr04 NC_080390.1:52030077-52030091promoter 内 2824-2838 bp + 1163 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 52024493-52028914(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTGTGGATAATGAT
SmilChr04G000502 Chr04 NC_080390.1:5492101-5492115promoter 内 2766-2780 bp + 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 5493336-5495980(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACTTTATCCACTAC
SmilChr02G003684 Chr02 NC_080388.1:58206478-58206492promoter 内 2405-2419 bp - 1582 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 58208074-58213277(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTTTAGATAAGGAT
SmilChr02G003859 Chr02 NC_080388.1:60395721-60395735promoter 内 2331-2345 bp - 1656 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 60390848-60394065(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCAAAAG
SmilChr01G001878 Chr01 NC_080387.1:33805401-33805415promoter 内 1099-1113 bp + 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 33808303-33811676(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTTATCCTAAAC
SmilChr02G005410 Chr02 NC_080388.1:74594336-74594350promoter 内 413-427 bp - 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 74597924-74598825(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACATGGATAAGGCT
SmilChr01G001147 Chr01 NC_080387.1:23456304-23456318promoter 内 355-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 23437008-23452672(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CTTCTTATCCAAATC
SmilChr04G000171 Chr04 NC_080390.1:1529657-1529671promoter 内 252-266 bp + 3735 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 1533406-1536174(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCATTATCCATTTT
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SmilChr01G005886 Chr01 NC_080387.1:74773946-74773960promoter 内 3930-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 74774017-74848538(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATAGATAAGGTA
SmilChr03G002458 Chr03 NC_080389.1:38926614-38926628promoter 内 3896-3910 bp - 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 38923962-38926523(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACATTATCCATTAT
SmilChr02G005458 Chr02 NC_080388.1:74897565-74897579promoter 内 3802-3816 bp + 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 74897764-74901278(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACATTATCCACAAA
SmilChr03G002290 Chr03 NC_080389.1:36098027-36098041promoter 内 3710-3724 bp + 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 36098318-36099253(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATTAA
SmilChr01G001793 Chr01 NC_080387.1:32788420-32788434promoter 内 3632-3646 bp - 355 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 32788789-32792051(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CTTTTGGATAATATT
SmilChr03G001576 Chr03 NC_080389.1:19926785-19926799promoter 内 3520-3534 bp + 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 19925517-19926318(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAATGGATAAGACA
SmilChr02G003331 Chr02 NC_080388.1:54558405-54558419promoter 内 3443-3457 bp - 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 54556216-54557861(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACTTTATCCACTTC
SmilChr01G005357 Chr01 NC_080387.1:70797333-70797347promoter 内 3413-3427 bp + 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 70797921-70800211(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATTAA
SmilChr01G001751 Chr01 NC_080387.1:32245012-32245026promoter 内 2996-3010 bp + 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 32246017-32248666(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATGCTTATCCATAAG
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SmilChr02G003904 Chr02 NC_080388.1:61121564-61121578promoter 内 2962-2976 bp - 1025 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 61115982-61120539(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCATTATCCACAAA
SmilChr02G005395 Chr02 NC_080388.1:74550259-74550273promoter 内 2958-2972 bp - 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 74547680-74549230(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGCCTTATCCATGTC
SmilChr02G004800 Chr02 NC_080388.1:70190342-70190356promoter 内 2861-2875 bp + 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 70191482-70192438(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CACCTTATCTATTTC
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SmilChr03G004678 Chr03 NC_080389.1:64224263-64224277promoter 内 2726-2740 bp - 1261 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 64219089-64223002(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCTACACT
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SmilChr03G001278 Chr03 NC_080389.1:14968223-14968237promoter 内 2565-2579 bp + 1422 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 14969659-14969730(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCCTATCCATTAC
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SmilChr03G004237 Chr03 NC_080389.1:60898087-60898101promoter 内 1803-1817 bp + 2184 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 60900285-60905623(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCTTATCCGTACT