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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003439; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00005108-RA_Salv SmilChr03G003439 bHLH XP_057798243.1 MP00195 TTAGCAACTTGCAT

可能结合的靶基因

9832 个结合位点 6878 个候选靶基因 第 23 / 138 下载 TSV

上一页 23 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002111 Chr01 NC_080387.1:37156742-37156755promoter 内 463-476 bp - 3525 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 37160280-37163308(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAACAAGTTGCCGG
SmilChr03G000205 Chr03 NC_080389.1:2361695-2361708promoter 内 3812-3825 bp + 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 2361884-2363159(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCCTCCACTTGCAA
SmilChr01G006029 Chr01 NC_080387.1:75840167-75840180promoter 内 3804-3817 bp + 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 75840364-75843979(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GATTCCACTTGCAT
SmilChr01G003849 Chr01 NC_080387.1:56793199-56793212promoter 内 3798-3811 bp + 190 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 56793402-56795438(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AGCCCCACTTGCAA
SmilChr01G001412 Chr01 NC_080387.1:27717630-27717643promoter 内 3528-3541 bp + 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 27718103-27718804(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AAAGCAACTTGCAA
SmilChr03G001067 Chr03 NC_080389.1:12383451-12383464promoter 内 3333-3346 bp + 655 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 12384119-12390927(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCCTCCACTTGCAA
SmilChr03G000408 Chr03 NC_080389.1:4438270-4438283promoter 内 3028-3041 bp - 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 4436879-4437310(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCCTCCACTTGCAA
SmilChr02G004280 Chr02 NC_080388.1:64992798-64992811promoter 内 2507-2520 bp + 1481 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 64989756-64991317(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTTGCATT
SmilChr01G002110 Chr01 NC_080387.1:37156742-37156755promoter 内 2364-2377 bp - 1624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 37152762-37155118(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CCGGCAACTTGTTC
SmilChr01G004880 Chr01 NC_080387.1:66890042-66890055promoter 内 2334-2347 bp + 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 66884000-66888388(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGAATC
SmilChr03G001693 Chr03 NC_080389.1:22445133-22445146promoter 内 2293-2306 bp + 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 22446841-22447502(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AAGACCACTTGCAC
SmilChr01G006028 Chr01 NC_080387.1:75840167-75840180promoter 内 2286-2299 bp + 1702 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 75837700-75838465(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGAATC
SmilChr02G001359 Chr02 NC_080388.1:25418286-25418299promoter 内 2116-2129 bp + 1872 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 25413893-25416414(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ACGCAAGTTGACAG
SmilChr01G005664 Chr01 NC_080387.1:72960792-72960805promoter 内 2066-2079 bp + 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 72962727-72962800(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CCGGCAACTTGTTC
SmilChr03G003486 Chr03 NC_080389.1:53450576-53450589promoter 内 1918-1931 bp - 2070 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 53431695-53448506(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AAAGCAACTTGCAA
SmilChr01G002554 Chr01 NC_080387.1:43651829-43651842promoter 内 1809-1822 bp + 2179 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 43654021-43655734(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ACGACAACTTGCAT
SmilChr01G005665 Chr01 NC_080387.1:72960792-72960805promoter 内 1443-1456 bp + 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 72963350-72964618(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CCGGCAACTTGTTC
SmilChr02G005033 Chr02 NC_080388.1:72048809-72048822promoter 内 1143-1156 bp + 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 72043132-72045964(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTCCAAGTTGGCCC
SmilChr01G000317 Chr01 NC_080387.1:6168630-6168643promoter 内 1142-1155 bp + 2846 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 6163128-6165784(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTGCAAGTGGATTC
SmilChr01G000892 Chr01 NC_080387.1:18981263-18981276promoter 内 1083-1096 bp - 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 18964249-18978358(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AAGACCACTTGCAC
SmilChr03G003368 Chr03 NC_080389.1:52042561-52042574promoter 内 1046-1059 bp + 2942 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 52034681-52039619(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AGGCAAGTTGAATA
SmilChr03G001050 Chr03 NC_080389.1:12224192-12224205promoter 内 965-978 bp - 3023 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 12227228-12228491(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGTCCT
SmilChr02G005177 Chr02 NC_080388.1:73067638-73067651promoter 内 870-883 bp - 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 73062182-73064520(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ACCGCAACTTGCAA
SmilChr02G000638 Chr02 NC_080388.1:9672497-9672510promoter 内 614-627 bp + 3374 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 9664075-9669123(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TGGCAAGTTGATTC
SmilChr01G002166 Chr01 NC_080387.1:37726655-37726668promoter 内 485-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 37730171-37731070(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTTGGATA
SmilChr01G004290 Chr01 NC_080387.1:61095123-61095136promoter 内 460-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 61098664-61100306(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CTGCAAGTGGCGAG
SmilChr03G001978 Chr03 NC_080389.1:28648114-28648127promoter 内 348-361 bp + 3640 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 28643740-28644474(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TGGCAAGTTGATTC
SmilChr03G001068 Chr03 NC_080389.1:12383451-12383464promoter 内 285-298 bp + 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 12387167-12387756(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCCTCCACTTGCAA
SmilChr01G001561 Chr01 NC_080387.1:29623174-29623187promoter 内 166-179 bp - 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 29627009-29628114(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTTGCATT
SmilChr01G002458 Chr01 NC_080387.1:42198743-42198756promoter 内 110-123 bp + 3878 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 42202634-42205023(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GATCCAACTTGCAT
SmilChr03G000909 Chr03 NC_080389.1:10420671-10420684promoter 内 41-54 bp + 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 10414546-10416724(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTGCAAGTTGATAA
SmilChr03G001463 Chr03 NC_080389.1:17489272-17489285promoter 内 3965-3978 bp + 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 17489308-17493704(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCCTCCACTTGCAA
SmilChr03G000215 Chr03 NC_080389.1:2506116-2506129promoter 内 3928-3941 bp + 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 2506189-2515083(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCCTCCACTTGCAA
SmilChr03G000342 Chr03 NC_080389.1:3880405-3880418promoter 内 3928-3941 bp - 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 3872530-3880345(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCCTCCACTTGCAA
SmilChr01G003955 Chr01 NC_080387.1:57926370-57926383promoter 内 3859-3872 bp - 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 57926512-57928904(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TAGCAAGTTGACAA
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SmilChr01G000478 Chr01 NC_080387.1:9825288-9825301promoter 内 3427-3440 bp - 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 9825862-9830853(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GGGCAAGTTGAATG
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SmilChr02G000087 Chr02 NC_080388.1:1134818-1134831promoter 内 2967-2980 bp + 1021 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 1130713-1133797(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTGCAAGTTGACAG
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SmilChr03G000703 Chr03 NC_080389.1:7847446-7847459promoter 内 2926-2939 bp + 1062 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 7841878-7846384(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GGGCAAGTTGAATG
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SmilChr03G003131 Chr03 NC_080389.1:48483222-48483235promoter 内 2805-2818 bp - 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 48484418-48580668(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GCACAAGTTGCACC
SmilChr01G000603 Chr01 NC_080387.1:13124534-13124547promoter 内 2768-2781 bp + 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 13125767-13129092(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAATCAACTTGCCA
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SmilChr01G002591 Chr01 NC_080387.1:44025005-44025018promoter 内 2294-2307 bp + 1694 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 44026712-44031417(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GCGTCAACTTGTCT
SmilChr01G001413 Chr01 NC_080387.1:27723486-27723499promoter 内 2275-2288 bp - 1713 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 27725212-27727241(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CAGCAAGTTGCTAG