转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 24 / 138 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001874 Chr01 NC_080387.1:33769972-33769984promoter 内 577-589 bp - 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 33760644-33766560(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GACGTTGACTCAG
SmilChr01G004705 Chr01 NC_080387.1:65162701-65162713promoter 内 350-362 bp - 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 65156414-65159062(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACCGAA
SmilChr03G004346 Chr03 NC_080389.1:61732827-61732839promoter 内 168-180 bp - 3821 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 61736660-61739767(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGGGTCAACGGC
SmilChr02G002625 Chr02 NC_080388.1:45597676-45597688promoter 内 2277-2289 bp + 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 45591927-45595964(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTGGTCAACGTG
SmilChr03G002258 Chr03 NC_080389.1:35557787-35557799promoter 内 957-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 35560831-35561946(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACCCC
SmilChr01G005184 Chr01 NC_080387.1:69552390-69552402promoter 内 1422-1434 bp - 2567 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 69544994-69549823(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GACTTTGACTATG
SmilChr03G000211 Chr03 NC_080389.1:2451449-2451461promoter 内 918-930 bp - 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 2454532-2455616(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACCCC
SmilChr03G001386 Chr03 NC_080389.1:16371513-16371525promoter 内 622-634 bp - 3367 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 16374892-16384279(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGTGGTCAACGAT
SmilChr01G002441 Chr01 NC_080387.1:41991647-41991659promoter 内 3840-3852 bp - 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 41991808-41992807(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACCCC
SmilChr03G002651 Chr03 NC_080389.1:42173825-42173837promoter 内 3758-3770 bp + 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 42171587-42173594(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGGTCAACGAA
SmilChr03G000652 Chr03 NC_080389.1:7246162-7246174promoter 内 3644-3656 bp + 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 7246519-7247247(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGGGTTGACTTGC
SmilChr02G003993 Chr02 NC_080388.1:62234058-62234070promoter 内 3580-3592 bp - 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 62230799-62233649(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCACC
SmilChr03G000206 Chr03 NC_080389.1:2363795-2363807promoter 内 3439-3451 bp - 550 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 2364357-2367604(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACCCC
SmilChr02G000262 Chr02 NC_080388.1:3412490-3412502promoter 内 3175-3187 bp + 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 3409681-3411676(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATAGTCAACGTG
SmilChr01G004821 Chr01 NC_080387.1:66395029-66395041promoter 内 2848-2860 bp - 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 66396182-66396252(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGGTCAACGCG
SmilChr03G003397 Chr03 NC_080389.1:52370654-52370666promoter 内 2695-2707 bp + 1294 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 52368616-52369360(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAACCTC
SmilChr03G001385 Chr03 NC_080389.1:16371513-16371525promoter 内 2220-2232 bp - 1769 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 16373294-16374594(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGTGGTCAACGAT
SmilChr03G004254 Chr03 NC_080389.1:61011713-61011725promoter 内 2199-2211 bp - 1790 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 61013515-61024170(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAGAGTCAACGCA
SmilChr02G002897 Chr02 NC_080388.1:49249157-49249169promoter 内 1693-1705 bp - 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 49243032-49246861(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCTTTGACTATG
SmilChr03G002652 Chr03 NC_080389.1:42173825-42173837promoter 内 1674-1686 bp + 2315 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 42176152-42177479(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGTTGACCGCG
SmilChr02G002898 Chr02 NC_080388.1:49249157-49249169promoter 内 1479-1491 bp - 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 49251679-49253043(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAGCA
SmilChr03G001692 Chr03 NC_080389.1:22439366-22439378promoter 内 1396-1408 bp - 2593 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 22432963-22436773(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCACC
SmilChr03G001736 Chr03 NC_080389.1:23370475-23370487promoter 内 963-975 bp - 3026 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 23363616-23367449(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCACC
SmilChr03G001679 Chr03 NC_080389.1:22031034-22031046promoter 内 522-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 22034513-22036165(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAAAGGA
SmilChr03G001072 Chr03 NC_080389.1:12423731-12423743promoter 内 408-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 12427324-12430901(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACCCC
SmilChr02G002968 Chr02 NC_080388.1:50201525-50201537promoter 内 3964-3976 bp - 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 50199317-50201500(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACTTAC
SmilChr03G002649 Chr03 NC_080389.1:42141260-42141272promoter 内 3934-3946 bp + 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 42141327-42153624(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCGTTGACTCTA
SmilChr02G000159 Chr02 NC_080388.1:2062360-2062372promoter 内 3645-3657 bp - 344 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 2061494-2062016(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGGGTTGACTTGC
SmilChr03G002106 Chr03 NC_080389.1:32772822-32772834promoter 内 3533-3545 bp - 456 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 32773290-32774958(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAACCTC
SmilChr02G003893 Chr02 NC_080388.1:61018226-61018238promoter 内 3233-3245 bp - 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 61018994-61020289(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAACCTC
SmilChr03G003273 Chr03 NC_080389.1:50694959-50694971promoter 内 2732-2744 bp - 1257 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 50689598-50693702(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GACTTTGACTATG
SmilChr01G003731 Chr01 NC_080387.1:55607804-55607816promoter 内 2649-2661 bp + 1340 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 55603656-55606464(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAGCA
SmilChr01G004839 Chr01 NC_080387.1:66526058-66526070promoter 内 2602-2614 bp - 1387 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 66523337-66524671(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCACC
SmilChr03G001672 Chr03 NC_080389.1:21803944-21803956promoter 内 2536-2548 bp - 1453 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 21794417-21802491(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCACC
SmilChr03G001708 Chr03 NC_080389.1:22725481-22725493promoter 内 2500-2512 bp - 1489 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 22715910-22723992(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCACC
SmilChr03G003275 Chr03 NC_080389.1:50694959-50694971promoter 内 2175-2187 bp - 1814 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 50696785-50699161(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAGTC
SmilChr03G003463 Chr03 NC_080389.1:53041686-53041698promoter 内 1487-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 53044200-53049585(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCACC
SmilChr03G001109 Chr03 NC_080389.1:12787294-12787306promoter 内 1259-1271 bp + 2730 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 12790036-12791228(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCACC
SmilChr03G003385 Chr03 NC_080389.1:52218060-52218072promoter 内 982-994 bp + 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 52205301-52215053(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGGTCAACGCG
SmilChr03G003879 Chr03 NC_080389.1:57896578-57896590promoter 内 947-959 bp + 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 57889053-57893536(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGGGTCAACGCA
SmilChr03G002314 Chr03 NC_080389.1:36417127-36417139promoter 内 920-932 bp + 3069 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 36410888-36414058(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACAGTCAACCGC
SmilChr03G002930 Chr03 NC_080389.1:46060362-46060374promoter 内 481-493 bp - 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 46053309-46056854(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACCAAC
SmilChr01G006040 Chr01 NC_080387.1:75887645-75887657promoter 内 416-428 bp - 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 75891230-75893857(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAAAGCA
SmilChr02G002133 Chr02 NC_080388.1:38390565-38390577promoter 内 361-373 bp + 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 38384804-38386937(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGAGGTCAACGCG
SmilChr01G001476 Chr01 NC_080387.1:28552719-28552731promoter 内 3950-3962 bp - 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 28551799-28552680(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGGTTGACTATT
SmilChr02G004899 Chr02 NC_080388.1:71005553-71005565promoter 内 3893-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 71005661-71008497(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAAGTCAACCCC
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SmilChr02G001468 Chr02 NC_080388.1:27409773-27409785promoter 内 3514-3526 bp - 475 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 27407029-27409298(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGGTTGACTATT
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SmilChr03G002828 Chr03 NC_080389.1:44762947-44762959promoter 内 2563-2575 bp + 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 44759008-44761521(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGAGGTCAACGCG