转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 26 / 148 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004062 Chr03 NC_080389.1:59587384-59587397promoter 内 2166-2179 bp + 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 59589219-59592862(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGCGGCCACGTGG
SmilChr07G004218 Chr07 NC_080393.1:54388019-54388032promoter 内 1605-1618 bp - 2383 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 54390415-54395386(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTGTT
SmilChr03G002833 Chr03 NC_080389.1:44854153-44854166promoter 内 3758-3771 bp + 230 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 44852793-44853923(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTCTT
SmilChr08G001107 Chr08 NC_080394.1:8589448-8589461promoter 内 3066-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 8590383-8594571(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCGGCCCACGTGG
SmilChr04G001694 Chr04 NC_080390.1:27993369-27993382promoter 内 3022-3035 bp + 966 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 27991460-27992403(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTGTT
SmilChr07G003836 Chr07 NC_080393.1:47467112-47467125promoter 内 2696-2709 bp + 1292 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 47460184-47465820(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCGCCA
SmilChr01G001177 Chr01 NC_080387.1:23823346-23823359promoter 内 2531-2544 bp - 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 23824816-23825470(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGCCCT
SmilChr06G002500 Chr06 NC_080392.1:35877287-35877300promoter 内 2282-2295 bp - 1706 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 35879006-35881427(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGCCTA
SmilChr01G004164 Chr01 NC_080387.1:60131323-60131336promoter 内 2256-2269 bp - 1732 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 60133068-60134915(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGCCCT
SmilChr08G001106 Chr08 NC_080394.1:8589448-8589461promoter 内 2190-2203 bp + 1798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 8584611-8587650(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGCCGAC
SmilChr04G003181 Chr04 NC_080390.1:48524339-48524352promoter 内 2184-2197 bp + 1804 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 48521543-48522535(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGCCCT
SmilChr02G001266 Chr02 NC_080388.1:23223178-23223191promoter 内 2139-2152 bp - 1849 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 23218539-23221329(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCAGCCCACGTGG
SmilChr01G001220 Chr01 NC_080387.1:24475518-24475531promoter 内 1860-1873 bp - 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 24477659-24478409(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGCCCT
SmilChr07G002486 Chr07 NC_080393.1:23520085-23520098promoter 内 1644-1657 bp + 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 23515601-23517741(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGCACC
SmilChr04G001667 Chr04 NC_080390.1:27635892-27635905promoter 内 1578-1591 bp - 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 27638315-27644091(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGCCCT
SmilChr04G001774 Chr04 NC_080390.1:29178167-29178180promoter 内 1372-1385 bp + 2616 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 29180796-29186120(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACAGGGCACGTGG
SmilChr04G001752 Chr04 NC_080390.1:28837300-28837313promoter 内 1322-1335 bp - 2666 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 28829378-28834634(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACAGGGCACGTGG
SmilChr06G001480 Chr06 NC_080392.1:15789239-15789252promoter 内 1012-1025 bp - 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 15784613-15786263(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGGCCTCACGTGC
SmilChr04G001190 Chr04 NC_080390.1:18232136-18232149promoter 内 954-967 bp + 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 18225196-18229102(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTGTT
SmilChr03G000741 Chr03 NC_080389.1:8415145-8415158promoter 内 662-675 bp + 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 8418484-8419344(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTGCCCCACGTGG
SmilChr03G004292 Chr03 NC_080389.1:61328781-61328794promoter 内 655-668 bp + 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 61321866-61325448(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGCCCA
SmilChr04G000481 Chr04 NC_080390.1:5187971-5187984promoter 内 364-377 bp - 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 5191608-5193259(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCGGCA
SmilChr06G002025 Chr06 NC_080392.1:26243690-26243703promoter 内 241-254 bp + 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 26231641-26239943(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTGTT
SmilChr03G003764 Chr03 NC_080389.1:56786610-56786623promoter 内 3948-3961 bp + 40 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 56786663-56789381(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAGCGACACGTGG
SmilChr04G003891 Chr04 NC_080390.1:54712515-54712528promoter 内 3938-3951 bp - 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 54708529-54712465(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGGCCCCACGTGG
SmilChr04G003803 Chr04 NC_080390.1:54194235-54194248promoter 内 3920-3933 bp - 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 54194316-54196224(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCTCACT
SmilChr03G003763 Chr03 NC_080389.1:56786610-56786623promoter 内 3903-3916 bp + 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 56781456-56786525(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCTTT
SmilChr03G003047 Chr03 NC_080389.1:47375590-47375603promoter 内 3637-3650 bp - 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 47374089-47375239(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGGTCTCACGTGC
SmilChr02G005164 Chr02 NC_080388.1:72979129-72979142promoter 内 3437-3450 bp - 551 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 72976107-72978578(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCATGTCACGTGG
SmilChr02G005092 Chr02 NC_080388.1:72509753-72509766promoter 内 3170-3183 bp + 818 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 72507868-72508935(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGCTTCT
SmilChr05G002350 Chr05 NC_080391.1:25476508-25476521promoter 内 3159-3172 bp - 829 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 25477350-25481881(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTCTCC
SmilChr03G004744 Chr03 NC_080389.1:64550689-64550702promoter 内 3019-3032 bp - 969 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 64551671-64552520(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGCCGAC
SmilChr04G002456 Chr04 NC_080390.1:39325881-39325894promoter 内 2971-2984 bp - 1017 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 39321217-39324864(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGGGCACACGTGG
SmilChr02G001024 Chr02 NC_080388.1:18151856-18151869promoter 内 2646-2659 bp + 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 18153211-18157450(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGGCCTCACGTGC
SmilChr07G001103 Chr07 NC_080393.1:8133623-8133636promoter 内 2598-2611 bp + 1390 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 8129002-8132233(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTGTT
SmilChr02G005093 Chr02 NC_080388.1:72509753-72509766promoter 内 2497-2510 bp + 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 72511257-72514739(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAAGCTCACGTGG
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SmilChr02G004637 Chr02 NC_080388.1:68833025-68833038promoter 内 2015-2028 bp + 1973 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 68830047-68831052(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACCTACC
SmilChr02G004791 Chr02 NC_080388.1:70111386-70111399promoter 内 1943-1956 bp + 2045 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 70113444-70114579(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCAAGTCACGTGT
SmilChr02G004478 Chr02 NC_080388.1:67197366-67197379promoter 内 1811-1824 bp + 2177 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 67185667-67195189(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGCCCA
SmilChr03G002265 Chr03 NC_080389.1:35650417-35650430promoter 内 1676-1689 bp + 2312 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 35647641-35648105(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACATGAT
SmilChr04G002184 Chr04 NC_080390.1:35277629-35277642promoter 内 1633-1646 bp - 2355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 35279997-35286523(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGGCTCA
SmilChr04G000945 Chr04 NC_080390.1:12516052-12516065promoter 内 1510-1523 bp + 2478 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 12503272-12513574(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTGTT
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SmilChr03G004355 Chr03 NC_080389.1:61770278-61770291promoter 内 1313-1326 bp - 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 61772966-61776806(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTTGCC
SmilChr03G004356 Chr03 NC_080389.1:61770278-61770291promoter 内 1282-1295 bp - 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 61772997-61773938(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTTGCC
SmilChr04G001695 Chr04 NC_080390.1:27998587-27998600promoter 内 1038-1051 bp + 2950 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 28001550-28003153(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACAGGGCACGTGG
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SmilChr03G002260 Chr03 NC_080389.1:35590448-35590461promoter 内 983-996 bp + 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 35582928-35587443(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTGTT