转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 27 / 139 下载 TSV

上一页 27 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000295 Chr03 NC_080389.1:3395229-3395240promoter 内 527-538 bp + 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 3388576-3391766(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGATCA
SmilChr03G001133 Chr03 NC_080389.1:13077170-13077181promoter 内 502-513 bp + 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 13071779-13073682(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAAGC
SmilChr02G004998 Chr02 NC_080388.1:71801764-71801775promoter 内 74-85 bp + 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 71805691-71809570(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGTGACGTGGA
SmilChr02G003332 Chr02 NC_080388.1:54563798-54563809promoter 内 3946-3957 bp + 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 54563853-54572590(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCCGACGTGGC
SmilChr02G004822 Chr02 NC_080388.1:70333240-70333251promoter 内 3604-3615 bp + 386 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 70328542-70332854(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCACAG
SmilChr01G004659 Chr01 NC_080387.1:64679210-64679221promoter 内 3550-3561 bp + 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 64676701-64678770(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCACTG
SmilChr04G003098 Chr04 NC_080390.1:47578111-47578122promoter 内 3538-3549 bp + 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 47578574-47579306(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCCGACGTGGC
SmilChr05G000405 Chr05 NC_080391.1:3054668-3054679promoter 内 3509-3520 bp + 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 3055160-3058829(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGTGACGTGGA
SmilChr04G001554 Chr04 NC_080390.1:25733359-25733370promoter 内 3495-3506 bp + 495 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 25730226-25732864(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGCT
SmilChr01G000444 Chr01 NC_080387.1:9019620-9019631promoter 内 3105-3116 bp - 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 9018391-9018735(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTCGC
SmilChr01G000562 Chr01 NC_080387.1:11667987-11667998promoter 内 3105-3116 bp - 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 11666755-11667102(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTCGC
SmilChr02G005565 Chr02 NC_080388.1:75576375-75576386promoter 内 3035-3046 bp + 955 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 75572911-75575420(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCACTC
SmilChr01G004324 Chr01 NC_080387.1:61401605-61401616promoter 内 3021-3032 bp + 969 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 61402585-61404376(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCCGACGTGGC
SmilChr03G002839 Chr03 NC_080389.1:44949173-44949184promoter 内 2722-2733 bp - 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 44946068-44947905(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGAGACGTGGG
SmilChr04G001755 Chr04 NC_080390.1:28882561-28882572promoter 内 2697-2708 bp + 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 28876530-28881268(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGGAA
SmilChr01G002336 Chr01 NC_080387.1:40533824-40533835promoter 内 2441-2452 bp - 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 40535384-40537096(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACGC
SmilChr02G000082 Chr02 NC_080388.1:1079269-1079280promoter 内 2330-2341 bp - 1660 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 1080940-1082744(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGGAA
SmilChr04G000060 Chr04 NC_080390.1:553221-553232promoter 内 2322-2333 bp + 1668 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 548468-551553(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCCG
SmilChr03G002385 Chr03 NC_080389.1:37774793-37774804promoter 内 2038-2049 bp + 1952 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 37770658-37772841(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCCG
SmilChr01G002315 Chr01 NC_080387.1:40145477-40145488promoter 内 2035-2046 bp + 1955 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 40137832-40143522(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGACGTCAGCA
SmilChr01G000016 Chr01 NC_080387.1:344167-344178promoter 内 1979-1990 bp - 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 346189-354787(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGATCA
SmilChr01G002324 Chr01 NC_080387.1:40327281-40327292promoter 内 1952-1963 bp + 2038 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 40313988-40325243(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGACGTCAGCA
SmilChr04G003716 Chr04 NC_080390.1:53459953-53459964promoter 内 1722-1733 bp - 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 53449875-53457685(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGAGACGTGGG
SmilChr04G002015 Chr04 NC_080390.1:32679664-32679675promoter 内 1691-1702 bp + 2299 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 32676374-32677365(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACGC
SmilChr01G000111 Chr01 NC_080387.1:1882508-1882519promoter 内 1683-1694 bp + 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 1871608-1880201(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGATCA
SmilChr01G002165 Chr01 NC_080387.1:37736806-37736817promoter 内 1602-1613 bp + 2388 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 37730155-37734418(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCCG
SmilChr02G002395 Chr02 NC_080388.1:41849324-41849335promoter 内 1586-1597 bp - 2404 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 41851739-41855872(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCACTG
SmilChr01G001414 Chr01 NC_080387.1:27733016-27733027promoter 内 1575-1586 bp - 2415 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 27727711-27730601(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGAGACGTGGG
SmilChr01G004524 Chr01 NC_080387.1:63443430-63443441promoter 内 1488-1499 bp - 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 63439237-63440928(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACCGACGTGGC
SmilChr04G002411 Chr04 NC_080390.1:38734980-38734991promoter 内 1471-1482 bp + 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 38730799-38732461(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGCT
SmilChr01G000471 Chr01 NC_080387.1:9611189-9611200promoter 内 1423-1434 bp + 2567 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 9606995-9608622(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCCG
SmilChr01G005849 Chr01 NC_080387.1:74439677-74439688promoter 内 1324-1335 bp + 2666 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 74436940-74437011(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAAGC
SmilChr02G003644 Chr02 NC_080388.1:57796900-57796911promoter 内 913-924 bp + 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 57799988-57802024(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTTGACGTGGG
SmilChr02G000132 Chr02 NC_080388.1:1807598-1807609promoter 内 868-879 bp + 3122 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 1810731-1822372(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCCGACGTGGC
SmilChr03G004573 Chr03 NC_080389.1:63635572-63635583promoter 内 772-783 bp + 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 63626563-63632354(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCATGC
SmilChr04G001453 Chr04 NC_080390.1:23914125-23914136promoter 内 138-149 bp - 3852 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 23917988-23918094(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGCT
SmilChr04G001577 Chr04 NC_080390.1:26200830-26200841promoter 内 129-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 26204702-26205620(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCACTC
SmilChr03G000225 Chr03 NC_080389.1:2646886-2646897promoter 内 3683-3694 bp + 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 2647204-2649873(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGGT
SmilChr04G003804 Chr04 NC_080390.1:54210946-54210957promoter 内 3381-3392 bp + 609 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 54207914-54210337(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCG
SmilChr04G002211 Chr04 NC_080390.1:35784145-35784156promoter 内 2890-2901 bp + 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 35785256-35792216(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGA
SmilChr04G001624 Chr04 NC_080390.1:27003070-27003081promoter 内 2167-2178 bp + 1823 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 27004904-27011019(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGT
SmilChr02G005251 Chr02 NC_080388.1:73655109-73655120promoter 内 2094-2105 bp - 1896 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 73651175-73653213(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGGA
SmilChr03G003141 Chr03 NC_080389.1:48630004-48630015promoter 内 2027-2038 bp - 1963 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 48627339-48628041(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGT
SmilChr02G005253 Chr02 NC_080388.1:73655109-73655120promoter 内 1492-1503 bp - 2498 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 73657618-73658492(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCC
SmilChr01G002042 Chr01 NC_080387.1:36094301-36094312promoter 内 3974-3985 bp - 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 36091412-36094285(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGGC
SmilChr02G004024 Chr02 NC_080388.1:62524092-62524103promoter 内 3936-3947 bp + 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 62519489-62524038(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCC
SmilChr03G000100 Chr03 NC_080389.1:1117109-1117120promoter 内 3656-3667 bp - 334 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 1114004-1116775(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGGT
SmilChr02G004535 Chr02 NC_080388.1:67908681-67908692promoter 内 3063-3074 bp + 927 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 67909619-67911240(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGA
SmilChr04G002550 Chr04 NC_080390.1:40783704-40783715promoter 内 2263-2274 bp + 1727 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 40785442-40786130(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGGA
SmilChr04G004073 Chr04 NC_080390.1:55823163-55823174promoter 内 2191-2202 bp + 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 55824973-55827185(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTTGACGTGGA