转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 28 / 143 下载 TSV

上一页 28 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G000802 Chr08 NC_080394.1:5881432-5881443promoter 内 2143-2154 bp - 1847 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 5883290-5886873(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr07G004015 Chr07 NC_080393.1:51222971-51222982promoter 内 2086-2097 bp - 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 51224886-51226869(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr04G001681 Chr04 NC_080390.1:27828976-27828987promoter 内 2083-2094 bp - 1907 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 27830894-27831947(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr03G003031 Chr03 NC_080389.1:47231025-47231036promoter 内 1877-1888 bp + 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 47225785-47228912(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr04G003544 Chr04 NC_080390.1:51802491-51802502promoter 内 1828-1839 bp - 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 51798806-51800329(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGAG
SmilChr03G004002 Chr03 NC_080389.1:59043537-59043548promoter 内 1808-1819 bp - 2182 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 59045730-59048398(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr07G004014 Chr07 NC_080393.1:51222819-51222830promoter 内 1665-1676 bp + 2325 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 51219488-51220494(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr08G001853 Chr08 NC_080394.1:15925578-15925589promoter 内 1503-1514 bp - 2487 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 15928076-15931215(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G004519 Chr01 NC_080387.1:63310417-63310428promoter 内 1457-1468 bp - 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 63312961-63315870(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G005476 Chr01 NC_080387.1:71752211-71752222promoter 内 1375-1386 bp + 2615 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 71741721-71749596(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr07G004276 Chr07 NC_080393.1:55256045-55256056promoter 内 1180-1191 bp - 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 55258866-55259702(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAAC
SmilChr08G001275 Chr08 NC_080394.1:10161657-10161668promoter 内 576-587 bp - 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 10155612-10158243(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATC
SmilChr01G004880 Chr01 NC_080387.1:66892323-66892334promoter 内 55-66 bp - 3935 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 66884000-66888388(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTT
SmilChr04G003545 Chr04 NC_080390.1:51802491-51802502promoter 内 20-31 bp - 3970 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 51806472-51810664(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCGA
SmilChr03G003396 Chr03 NC_080389.1:52358332-52358343promoter 内 3875-3886 bp - 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 52358458-52363774(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr04G000439 Chr04 NC_080390.1:4647812-4647823promoter 内 3839-3850 bp - 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 4647974-4659034(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr04G003085 Chr04 NC_080390.1:47462922-47462933promoter 内 3752-3763 bp - 238 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 47460779-47462684(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATC
SmilChr06G000879 Chr06 NC_080392.1:8329382-8329393promoter 内 3743-3754 bp - 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 8329640-8335570(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr03G002182 Chr03 NC_080389.1:33895605-33895616promoter 内 3733-3744 bp + 257 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 33894567-33895348(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr02G003314 Chr02 NC_080388.1:54397199-54397210promoter 内 3723-3734 bp - 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 54397477-54399615(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G004471 Chr01 NC_080387.1:62805054-62805065promoter 内 3712-3723 bp + 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 62801628-62804776(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr02G003968 Chr02 NC_080388.1:61824719-61824730promoter 内 3689-3700 bp + 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 61823186-61824418(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr07G000343 Chr07 NC_080393.1:2321249-2321260promoter 内 3683-3694 bp + 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 2319208-2320942(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G006011 Chr01 NC_080387.1:75669493-75669504promoter 内 3654-3665 bp - 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 75669840-75713567(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr07G002792 Chr07 NC_080393.1:27811708-27811719promoter 内 3597-3608 bp - 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 27809258-27811315(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATC
SmilChr02G003440 Chr02 NC_080388.1:55678787-55678798promoter 内 3596-3607 bp + 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 55674626-55678393(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCAT
SmilChr08G002602 Chr08 NC_080394.1:25385267-25385278promoter 内 3591-3602 bp - 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 25385677-25391716(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr04G002703 Chr04 NC_080390.1:42547372-42547383promoter 内 3574-3585 bp + 416 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 42547799-42549174(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATC
SmilChr08G003085 Chr08 NC_080394.1:31072293-31072304promoter 内 3559-3570 bp + 431 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 31068551-31071862(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr04G002344 Chr04 NC_080390.1:37802401-37802412promoter 内 3552-3563 bp - 438 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 37802850-37807900(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr02G000285 Chr02 NC_080388.1:3647016-3647027promoter 内 3547-3558 bp + 443 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 3641492-3646573(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr03G002958 Chr03 NC_080389.1:46349625-46349636promoter 内 3526-3537 bp - 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 46350100-46352683(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr07G001677 Chr07 NC_080393.1:14217329-14217340promoter 内 3467-3478 bp + 523 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 14216306-14216806(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G001496 Chr01 NC_080387.1:28809426-28809437promoter 内 3453-3464 bp - 537 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 28809974-28814378(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr07G000551 Chr07 NC_080393.1:3798957-3798968promoter 内 3452-3463 bp + 538 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 3796234-3798419(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr04G001728 Chr04 NC_080390.1:28518066-28518077promoter 内 3450-3461 bp - 540 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 28518617-28519920(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCTG
SmilChr07G002543 Chr07 NC_080393.1:24139774-24139785promoter 内 3432-3443 bp + 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 24137542-24139216(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAAC
SmilChr02G003924 Chr02 NC_080388.1:61318031-61318042promoter 内 3421-3432 bp - 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 61318611-61324376(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr03G003018 Chr03 NC_080389.1:47088706-47088717promoter 内 3376-3387 bp - 614 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 47089331-47090095(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G001821 Chr01 NC_080387.1:33150094-33150105promoter 内 3366-3377 bp + 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 33147058-33149470(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr03G003395 Chr03 NC_080389.1:52358130-52358141promoter 内 3325-3336 bp + 665 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 52355585-52357465(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr08G002009 Chr08 NC_080394.1:17853641-17853652promoter 内 3301-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 17854341-17855799(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr02G001827 Chr02 NC_080388.1:33293199-33293210promoter 内 3290-3301 bp + 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 33289039-33292499(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G002029 Chr01 NC_080387.1:35866259-35866270promoter 内 3238-3249 bp + 752 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 35864563-35865507(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr08G002444 Chr08 NC_080394.1:23260891-23260902promoter 内 3237-3248 bp + 753 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 23255588-23260138(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr07G002265 Chr07 NC_080393.1:20855773-20855784promoter 内 3224-3235 bp - 766 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 20856550-20859782(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G000325 Chr01 NC_080387.1:6538802-6538813promoter 内 3147-3158 bp + 843 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 6539656-6559465(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATC
SmilChr01G006013 Chr01 NC_080387.1:75721358-75721369promoter 内 3127-3138 bp + 863 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 75719970-75720495(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G001192 Chr01 NC_080387.1:24057425-24057436promoter 内 3084-3095 bp - 906 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 24058342-24059483(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G003197 Chr01 NC_080387.1:50739940-50739951promoter 内 3067-3078 bp + 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 50734261-50739017(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA