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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 32 / 126 下载 TSV

上一页 32 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000341 Chr03 NC_080389.1:3873564-3873578promoter 内 3751-3765 bp + 236 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 3871001-3873328(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr08G000713 Chr08 NC_080394.1:5293743-5293757promoter 内 3685-3699 bp - 302 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 5294059-5297042(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGCGGT
SmilChr08G003010 Chr08 NC_080394.1:30211588-30211602promoter 内 3674-3688 bp + 313 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 30209768-30211275(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr02G000754 Chr02 NC_080388.1:12287129-12287143promoter 内 3581-3595 bp - 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 12283657-12286723(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr02G000197 Chr02 NC_080388.1:2492262-2492276promoter 内 3493-3507 bp + 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 2490229-2491768(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr01G001826 Chr01 NC_080387.1:33221080-33221094promoter 内 3474-3488 bp + 513 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 33201879-33220567(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr03G001771 Chr03 NC_080389.1:24174554-24174568promoter 内 3467-3481 bp - 520 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 24175088-24176313(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr03G003670 Chr03 NC_080389.1:55543276-55543290promoter 内 3446-3460 bp + 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 55533617-55542735(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr05G003251 Chr05 NC_080391.1:41907512-41907526promoter 内 3424-3438 bp - 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 41908089-41913254(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr04G003557 Chr04 NC_080390.1:51952541-51952555promoter 内 3364-3378 bp + 623 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 51953178-51959851(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr07G000668 Chr07 NC_080393.1:4533020-4533034promoter 内 3304-3318 bp - 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 4529915-4532337(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr04G000726 Chr04 NC_080390.1:8529387-8529401promoter 内 3302-3316 bp + 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 8530086-8532678(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAACGACACGTGTCA
SmilChr01G005013 Chr01 NC_080387.1:68145463-68145477promoter 内 3299-3313 bp - 688 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 68141937-68144775(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr05G002831 Chr05 NC_080391.1:33616384-33616398promoter 内 3265-3279 bp + 722 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 33617120-33622633(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr03G004394 Chr03 NC_080389.1:62124890-62124904promoter 内 3253-3267 bp + 734 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 62125638-62138340(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr01G001075 Chr01 NC_080387.1:22163189-22163203promoter 内 3246-3260 bp - 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 22163944-22168094(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr05G003413 Chr05 NC_080391.1:45327755-45327769promoter 内 3224-3238 bp - 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 45322544-45326992(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr02G002671 Chr02 NC_080388.1:46288884-46288898promoter 内 3147-3161 bp - 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 46289738-46291631(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr01G003742 Chr01 NC_080387.1:55729925-55729939promoter 内 3065-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 55722434-55729003(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr06G001148 Chr06 NC_080392.1:11632953-11632967promoter 内 3056-3070 bp - 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 11630797-11632022(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr04G000046 Chr04 NC_080390.1:421776-421790promoter 内 3006-3020 bp - 981 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 422771-424229(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCTCATGC
SmilChr05G000389 Chr05 NC_080391.1:2922798-2922812promoter 内 2985-2999 bp + 1002 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 2919259-2921796(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr04G001858 Chr04 NC_080390.1:30266619-30266633promoter 内 2948-2962 bp + 1039 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 30267672-30268295(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr07G002947 Chr07 NC_080393.1:29873060-29873074promoter 内 2795-2809 bp - 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 29874266-29876491(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr01G002194 Chr01 NC_080387.1:38107015-38107029promoter 内 2712-2726 bp + 1275 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 38103707-38105740(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTCTACA
SmilChr03G001374 Chr03 NC_080389.1:16200505-16200519promoter 内 2711-2725 bp + 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 16196523-16199229(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr02G005238 Chr02 NC_080388.1:73563512-73563526promoter 内 2705-2719 bp + 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 73564808-73566603(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr01G004646 Chr01 NC_080387.1:64520574-64520588promoter 内 2602-2616 bp + 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 64517654-64519189(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr04G003402 Chr04 NC_080390.1:50593084-50593098promoter 内 2568-2582 bp - 1419 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 50594517-50595143(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr07G002883 Chr07 NC_080393.1:29055817-29055831promoter 内 2562-2576 bp - 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 29051272-29054392(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCCAGACACGTGGCA
SmilChr05G002602 Chr05 NC_080391.1:29226676-29226690promoter 内 2463-2477 bp + 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 29228214-29234252(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr01G005444 Chr01 NC_080387.1:71537887-71537901promoter 内 2452-2466 bp - 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 71530944-71536352(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr01G004485 Chr01 NC_080387.1:62980423-62980437promoter 内 2420-2434 bp + 1567 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 62982004-62983723(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr07G003282 Chr07 NC_080393.1:34565739-34565753promoter 内 2393-2407 bp + 1594 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 34567347-34569673(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr05G001142 Chr05 NC_080391.1:9815134-9815148promoter 内 2385-2399 bp + 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 9547274-9813532(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr05G001696 Chr05 NC_080391.1:16148830-16148844promoter 内 2383-2397 bp - 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 16145172-16147226(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr02G001891 Chr02 NC_080388.1:34216162-34216176promoter 内 2363-2377 bp - 1624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 34217800-34219981(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
SmilChr03G001559 Chr03 NC_080389.1:19656481-19656495promoter 内 2342-2356 bp + 1645 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 19658140-19659509(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
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SmilChr03G004643 Chr03 NC_080389.1:64010333-64010347promoter 内 2246-2260 bp - 1741 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 64007152-64008592(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTCGCCACGTGGCG
SmilChr03G001772 Chr03 NC_080389.1:24174554-24174568promoter 内 2200-2214 bp - 1787 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 24176355-24177375(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCGAAT
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SmilChr08G002909 Chr08 NC_080394.1:29058804-29058818promoter 内 2081-2095 bp + 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 29060724-29065552(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAGGTTGACGTGGCA