转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 34 / 142 下载 TSV

上一页 34 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000442 Chr01 NC_080387.1:8991483-8991497promoter 内 2019-2033 bp + 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8993465-8995763(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACATT
SmilChr02G002405 Chr02 NC_080388.1:41965995-41966009promoter 内 1952-1966 bp + 2035 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 41968044-41971926(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGTACCTACCGCCTA
SmilChr08G002419 Chr08 NC_080394.1:22993734-22993748promoter 内 1843-1857 bp + 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 22983495-22991590(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTGGGTATG
SmilChr03G004034 Chr03 NC_080389.1:59331916-59331930promoter 内 1824-1838 bp - 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 59334093-59343941(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G001236 Chr08 NC_080394.1:9920147-9920161promoter 内 1778-1792 bp - 2209 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 9907550-9917938(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCAATGC
SmilChr05G001185 Chr05 NC_080391.1:9945565-9945579promoter 内 1669-1683 bp - 2318 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 9947897-9953939(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTGGGGTAGGTGGA
SmilChr08G001249 Chr08 NC_080394.1:9920147-9920161promoter 内 1560-1574 bp - 2427 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 9922588-9922659(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCATTGGTAGGTGGC
SmilChr02G004093 Chr02 NC_080388.1:63222299-63222313promoter 内 1554-1568 bp + 2433 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 63216526-63219866(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGAAGGTAGGTGGC
SmilChr05G000291 Chr05 NC_080391.1:2224535-2224549promoter 内 1359-1373 bp + 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 2227177-2232336(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTACCACTAA
SmilChr01G001946 Chr01 NC_080387.1:34680535-34680549promoter 内 1330-1344 bp - 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34683206-34685403(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATGTGGTAGGTGAA
SmilChr07G001902 Chr07 NC_080393.1:16426089-16426103promoter 内 1324-1338 bp - 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 16428766-16435894(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGGTGGTAGTTGTA
SmilChr05G000774 Chr05 NC_080391.1:6038256-6038270promoter 内 1295-1309 bp + 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 6034367-6035564(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACGGTGGTAGGTGAT
SmilChr04G000542 Chr04 NC_080390.1:6046358-6046372promoter 内 1274-1288 bp + 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 6039265-6043645(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGTTTGGTAGGTAGG
SmilChr07G003310 Chr07 NC_080393.1:35113405-35113419promoter 内 1164-1178 bp + 2823 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 35107084-35110582(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTAGGGGTAGGTAGA
SmilChr05G003633 Chr05 NC_080391.1:48713630-48713644promoter 内 1156-1170 bp + 2831 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 48716475-48719803(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCAACTACCACAAC
SmilChr05G003871 Chr05 NC_080391.1:52317237-52317251promoter 内 1113-1127 bp - 2874 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 52320125-52324870(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G003523 Chr08 NC_080394.1:37839569-37839583promoter 内 1084-1098 bp + 2903 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 37836183-37836666(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTATGGGTAGGTGGA
SmilChr02G004345 Chr02 NC_080388.1:65732200-65732214promoter 内 1028-1042 bp + 2959 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 65735173-65737350(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACATT
SmilChr01G001772 Chr01 NC_080387.1:32638506-32638520promoter 内 1025-1039 bp + 2962 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32630790-32635544(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGTTTGGTAGGTGAG
SmilChr05G000167 Chr05 NC_080391.1:1323413-1323427promoter 内 884-898 bp + 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 1326530-1330586(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCCACCC
SmilChr01G004807 Chr01 NC_080387.1:66263379-66263393promoter 内 783-797 bp - 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 66266597-66270367(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGCAGGTAGGTGTG
SmilChr03G004323 Chr03 NC_080389.1:61595941-61595955promoter 内 747-761 bp - 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 61599195-61606312(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACGTGGGTAGGTGGA
SmilChr07G003950 Chr07 NC_080393.1:50002125-50002139promoter 内 739-753 bp + 3248 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 49991609-49998877(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGGGAGTAGGTGGG
SmilChr02G002572 Chr02 NC_080388.1:44725854-44725868promoter 内 720-734 bp + 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 44729135-44729890(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACCTCTTT
SmilChr04G003581 Chr04 NC_080390.1:52218291-52218305promoter 内 551-565 bp - 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 52221741-52225468(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGTTTGGTAGGTAAG
SmilChr02G004825 Chr02 NC_080388.1:70346686-70346700promoter 内 528-542 bp + 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 70350159-70369004(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACAACTACCACCTC
SmilChr03G002232 Chr03 NC_080389.1:35222542-35222556promoter 内 504-518 bp + 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 35216607-35219059(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTGTGGTAGTTGGT
SmilChr07G001099 Chr07 NC_080393.1:8119527-8119541promoter 内 500-514 bp - 3487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8114418-8116040(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACATT
SmilChr05G003904 Chr05 NC_080391.1:52784251-52784265promoter 内 499-513 bp - 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 52787753-52792497(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G004824 Chr02 NC_080388.1:70346686-70346700promoter 内 311-325 bp + 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 70342030-70343010(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGGTGGTAGTTGTA
SmilChr01G005587 Chr01 NC_080387.1:72550874-72550888promoter 内 273-287 bp - 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 72554602-72554722(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATGTGGTAGGTGAA
SmilChr04G000545 Chr04 NC_080390.1:6056894-6056908promoter 内 270-284 bp + 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 6060625-6065993(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCACATT
SmilChr08G004012 Chr08 NC_080394.1:48500416-48500430promoter 内 238-252 bp - 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 48504179-48504262(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATGTGGTAGGTGAA
SmilChr05G004126 Chr05 NC_080391.1:55181996-55182010promoter 内 226-240 bp - 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 55173329-55178235(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCACCTACCCATCC
SmilChr07G002801 Chr07 NC_080393.1:28004192-28004206promoter 内 5-19 bp - 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 28008188-28009134(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G004961 Chr01 NC_080387.1:67699380-67699394promoter 内 2166-2180 bp + 1821 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 67695315-67697559(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTCCGGTAGGTGAG
SmilChr01G001271 Chr01 NC_080387.1:25409306-25409320promoter 内 2935-2949 bp - 1052 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 25402670-25408254(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTACCTACCGCCGC
SmilChr01G002668 Chr01 NC_080387.1:44898574-44898588promoter 内 2766-2780 bp + 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 44896410-44897353(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTGGTTAGC
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SmilChr08G000932 Chr08 NC_080394.1:6905750-6905764promoter 内 1646-1660 bp + 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 6908105-6916562(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTAACCACCACCAC
SmilChr08G000934 Chr08 NC_080394.1:6925309-6925323promoter 内 1628-1642 bp + 2359 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 6927682-6936138(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTAACCACCACCAC
SmilChr07G002615 Chr07 NC_080393.1:25243491-25243505promoter 内 1114-1128 bp + 2873 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 25246378-25254004(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCAACTACCACCGG
SmilChr02G005049 Chr02 NC_080388.1:72219526-72219540promoter 内 830-844 bp - 3157 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 72222697-72225713(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTGGTTAGC
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SmilChr08G001848 Chr08 NC_080394.1:15840403-15840417promoter 内 3847-3861 bp - 140 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 15840557-15845438(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTCCGGTAGGTGAG
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SmilChr06G002277 Chr06 NC_080392.1:32663211-32663225promoter 内 3774-3788 bp - 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 32660867-32662998(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTCAACCACCACCAC
SmilChr07G002655 Chr07 NC_080393.1:25735218-25735232promoter 内 3705-3719 bp - 282 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 25729871-25734936(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACCAAATC
SmilChr03G004673 Chr03 NC_080389.1:64176481-64176495promoter 内 3666-3680 bp + 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 64175484-64176160(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTGTGGGTAGGTGGA