转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004579; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010264-RA_Salv SmilChr01G004579 MYB XP_057787263.1 MP00132 CTTTTCCAACCACCTTTTC

可能结合的靶基因

9926 个结合位点 7583 个候选靶基因 第 38 / 152 下载 TSV

上一页 38 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003825 Chr03 NC_080389.1:57341840-57341858promoter 内 921-939 bp + 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 57336708-57338778(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTTAGGGTGGTTGAAGGAG
SmilChr05G001093 Chr05 NC_080391.1:9096910-9096928promoter 内 879-897 bp - 3104 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 9100032-9103242(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAGACGGTGGTTGTAGAGA
SmilChr04G001289 Chr04 NC_080390.1:20563308-20563326promoter 内 833-851 bp - 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 20566476-20567639(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TATTTGGTGGTTGGCGACG
SmilChr04G001838 Chr04 NC_080390.1:29920603-29920621promoter 内 680-698 bp + 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 29923924-29926040(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAATTCCAACCACATCGGC
SmilChr01G001819 Chr01 NC_080387.1:33129773-33129791promoter 内 465-483 bp - 3518 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 33123324-33126255(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCTTTCCAACCACCTGGGA
SmilChr05G002612 Chr05 NC_080391.1:29405325-29405343promoter 内 413-431 bp - 3570 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 29398911-29401755(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACTTTCCAACCACCTGGAA
SmilChr05G002613 Chr05 NC_080391.1:29414690-29414708promoter 内 413-431 bp - 3570 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 29408325-29411120(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACTTTCCAACCACCTGGAA
SmilChr02G003764 Chr02 NC_080388.1:59316086-59316104promoter 内 412-430 bp + 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 59319675-59322528(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACTTTCCAACCACCTGGAA
SmilChr01G005236 Chr01 NC_080387.1:69935863-69935881promoter 内 377-395 bp - 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 69931647-69932257(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CATCTTCAACCACCAAACA
SmilChr01G004379 Chr01 NC_080387.1:61989012-61989030promoter 内 272-290 bp - 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 61992741-61996544(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCGACGGTGGTTGCCGCCG
SmilChr03G004254 Chr03 NC_080389.1:61009706-61009724promoter 内 192-210 bp - 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 61013515-61024170(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTGTGGGTGGTTGAAAATC
SmilChr02G000328 Chr02 NC_080388.1:4179789-4179807promoter 内 3825-3843 bp - 158 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4179965-4180783(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TATTTGGTGGTTGGCGACG
SmilChr04G003246 Chr04 NC_080390.1:49233392-49233410promoter 内 3800-3818 bp + 183 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 49233593-49235499(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TACACCCAACTACCTTTTA
SmilChr03G000281 Chr03 NC_080389.1:3208600-3208618promoter 内 3759-3777 bp + 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 3206167-3208376(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TATTTGGTGGTTGGCGACG
SmilChr01G002720 Chr01 NC_080387.1:45486934-45486952promoter 内 3730-3748 bp - 253 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 45484868-45486681(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAATTTCAACCACCATATT
SmilChr05G002056 Chr05 NC_080391.1:21414711-21414729promoter 内 3703-3721 bp - 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 21415009-21418285(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTTGAAGTGGTTGATAAAG
SmilChr05G000821 Chr05 NC_080391.1:6451242-6451260promoter 内 3677-3695 bp + 306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 6449039-6450936(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAAGGGGTGGTTGAAACAT
SmilChr05G002257 Chr05 NC_080391.1:24279274-24279292promoter 内 3634-3652 bp - 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24279641-24283635(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGGAGAGTGGTTGGATGCG
SmilChr03G002600 Chr03 NC_080389.1:41296657-41296675promoter 内 3599-3617 bp - 384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41297059-41300263(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAACGGGTGGTTGGCGGCG
SmilChr02G002587 Chr02 NC_080388.1:44966659-44966677promoter 内 3431-3449 bp - 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 44961907-44966107(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AATTCCCAACCAACATTGC
SmilChr01G005378 Chr01 NC_080387.1:71005930-71005948promoter 内 3366-3384 bp + 617 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 70999770-71005313(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAAAAGGTGGTTGATGATA
SmilChr02G003700 Chr02 NC_080388.1:58463965-58463983promoter 内 3366-3384 bp - 617 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 58464600-58468207(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCTTAGTTGGTTGGGAAAA
SmilChr01G005634 Chr01 NC_080387.1:72779305-72779323promoter 内 3313-3331 bp - 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72779993-72785650(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTAGTAGTAGTTGGAAGCT
SmilChr04G001420 Chr04 NC_080390.1:23072245-23072263promoter 内 3307-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 23072939-23074810(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TATTTGGTGGTTGGCGACG
SmilChr03G003443 Chr03 NC_080389.1:52807596-52807614promoter 内 3282-3300 bp + 701 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52808315-52812795(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TACACCCAACTACCTTTTA
SmilChr03G003445 Chr03 NC_080389.1:52815718-52815736promoter 内 3282-3300 bp + 701 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52816437-52820917(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TACACCCAACTACCTTTTA
SmilChr01G000581 Chr01 NC_080387.1:12298059-12298077promoter 内 3278-3296 bp + 705 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12292868-12297354(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACAAAAGTGGGTGGAAAAT
SmilChr02G002069 Chr02 NC_080388.1:37244554-37244572promoter 内 3227-3245 bp + 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 37243238-37243798(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAAAAGGTAGGTGAGAGAA
SmilChr05G003135 Chr05 NC_080391.1:39962104-39962122promoter 内 3192-3210 bp + 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 39959756-39961313(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGGAGAGTGGTTGGATGCG
SmilChr02G000095 Chr02 NC_080388.1:1240616-1240634promoter 内 3189-3207 bp - 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 1236911-1239822(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTCATTCAACCACCACCTA
SmilChr03G003351 Chr03 NC_080389.1:51844639-51844657promoter 内 3065-3083 bp + 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 51845575-51854471(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TATTTTCAACCACATTCAC
SmilChr01G005667 Chr01 NC_080387.1:72968944-72968962promoter 内 2990-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72969955-72972116(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAAAATGTGGTTGGAAAAA
SmilChr04G000463 Chr04 NC_080390.1:4946040-4946058promoter 内 2926-2944 bp - 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4947115-4949983(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTTGCGGTGGTTGGCATTA
SmilChr02G003297 Chr02 NC_080388.1:54246488-54246506promoter 内 2861-2879 bp - 1122 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54243482-54245366(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CATGCTCAACCACTTTATT
SmilChr02G001998 Chr02 NC_080388.1:36145229-36145247promoter 内 2735-2753 bp - 1248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 36143542-36143981(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCGTTGCAACCACTCCCCC
SmilChr03G003447 Chr03 NC_080389.1:52823932-52823950promoter 内 2715-2733 bp + 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52825218-52828784(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TACACCCAACTACCTTTTA
SmilChr01G000700 Chr01 NC_080387.1:15693439-15693457promoter 内 2714-2732 bp + 1269 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 15690510-15692170(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGGTAGGTGGTGGGGGGTG
SmilChr02G003237 Chr02 NC_080388.1:53646792-53646810promoter 内 2612-2630 bp - 1371 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 53642064-53645421(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCGCTCCAACCATCTCTAT
SmilChr04G000936 Chr04 NC_080390.1:12237501-12237519promoter 内 2567-2585 bp + 1416 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12238935-12240247(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCATTTCAACCACATTCCT
SmilChr02G004633 Chr02 NC_080388.1:68797151-68797169promoter 内 2519-2537 bp + 1464 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 68798633-68798706(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAACATCAACCACTTCGAC
SmilChr02G000792 Chr02 NC_080388.1:13060607-13060625promoter 内 2490-2508 bp + 1493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 13058344-13059114(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAACAGGTGGTTGATGATG
SmilChr01G002045 Chr01 NC_080387.1:36193771-36193789promoter 内 2463-2481 bp + 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 36195309-36197167(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATCTCCCAACCACCAAGCA
SmilChr01G002031 Chr01 NC_080387.1:35892439-35892457promoter 内 2407-2425 bp - 1576 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 35889237-35890863(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATCTCCCAACCACCAAGCA
SmilChr01G000206 Chr01 NC_080387.1:3593491-3593509promoter 内 2233-2251 bp - 1750 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 3595259-3598970(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAATGAGTGGTTGGGATTG
SmilChr04G004028 Chr04 NC_080390.1:55554741-55554759promoter 内 2152-2170 bp + 1831 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55550890-55552910(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GATGCAGTGGTTGGCACTG
SmilChr05G000191 Chr05 NC_080391.1:1526815-1526833promoter 内 2000-2018 bp + 1983 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 1521138-1524832(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TATTTGGTGGTTGGCGACG
SmilChr01G005166 Chr01 NC_080387.1:69429552-69429570promoter 内 1993-2011 bp + 1990 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69431560-69432940(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCACCTCAACCACTTAGTC
SmilChr01G000802 Chr01 NC_080387.1:17300601-17300619promoter 内 1986-2004 bp + 1997 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 17295571-17298604(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTGTAGGTGGTTGGTGTTT
SmilChr01G000752 Chr01 NC_080387.1:16603212-16603230promoter 内 1972-1990 bp - 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16605241-16608282(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTGTAGGTGGTTGGTGTTT
SmilChr02G000675 Chr02 NC_080388.1:10488815-10488833promoter 内 1950-1968 bp + 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 10484734-10486782(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGGGCGGTGGTTGAGTTAC