Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005433; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021978-RA_Salv SmilChr02G005433 WRKY XP_057792682.1 MP00209 CGTTGACTTTTTTTAACAT

可能结合的靶基因

9910 个结合位点 8083 个候选靶基因 第 38 / 162 下载 TSV

上一页 38 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003210 Chr04 NC_080390.1:48943871-48943889promoter 内 1558-1576 bp - 2425 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 48946314-48950345(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TTGTAAGATGCAGTCAACG
SmilChr01G005935 Chr01 NC_080387.1:75106297-75106315promoter 内 1556-1574 bp + 2427 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 75108742-75111390(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTTGAGACTCTTC
SmilChr02G000305 Chr02 NC_080388.1:3845248-3845266promoter 内 1536-1554 bp - 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3847713-3851771(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TAGCATTAAAGAGTCAACG
SmilChr04G003726 Chr04 NC_080390.1:53596907-53596925promoter 内 1507-1525 bp + 2476 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53590583-53594431(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGGCAAACACAAGTCAACA
SmilChr04G003006 Chr04 NC_080390.1:46445756-46445774promoter 内 1477-1495 bp + 2506 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 46439302-46443250(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TTGTAAGATGCAGTCAACG
SmilChr03G004045 Chr03 NC_080389.1:59438750-59438768promoter 内 1464-1482 bp + 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 59432094-59436231(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TCCAACACCAAAGTCAACC
SmilChr08G001650 Chr08 NC_080394.1:13707013-13707031promoter 内 1397-1415 bp + 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 13709617-13710488(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTTAATATTATCT
SmilChr05G001159 Chr05 NC_080391.1:9731545-9731563promoter 内 1396-1414 bp - 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 9734150-9735607(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TCATCATGTAAAGTCAACG
SmilChr04G002424 Chr04 NC_080390.1:38872052-38872070promoter 内 1355-1373 bp - 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 38874698-38876047(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGATTTCCAGTAGTCAACG
SmilChr04G002016 Chr04 NC_080390.1:32682682-32682700promoter 内 1312-1330 bp + 2671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 32677657-32680011(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr02G005119 Chr02 NC_080388.1:72677329-72677347promoter 内 1284-1302 bp + 2699 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 72680046-72684140(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTCATATTTCCAG
SmilChr08G000494 Chr08 NC_080394.1:3560106-3560124promoter 内 1276-1294 bp + 2707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3562831-3569656(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCGCCTCATCGAC
SmilChr02G003562 Chr02 NC_080388.1:56797659-56797677promoter 内 1271-1289 bp - 2712 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 56800389-56800970(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ACCATATTAACAGTCAACG
SmilChr06G000970 Chr06 NC_080392.1:9421380-9421398promoter 内 1128-1146 bp - 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 9415331-9418525(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTCTTTCTCTTGA
SmilChr06G002617 Chr06 NC_080392.1:37643895-37643913promoter 内 1097-1115 bp + 2886 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 37640347-37641009(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GACTGACCAGAGGTCAACG
SmilChr04G000061 Chr04 NC_080390.1:549382-549400promoter 内 1067-1085 bp + 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 552316-553638(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTTGGCCTATTT
SmilChr03G001833 Chr03 NC_080389.1:25137370-25137388promoter 内 1007-1025 bp + 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 25140364-25141017(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTTGCCATGATTT
SmilChr03G004294 Chr03 NC_080389.1:61344090-61344108promoter 内 978-996 bp - 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 61347113-61350884(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AAACTCAGAACAGTCAACG
SmilChr07G003088 Chr07 NC_080393.1:32608665-32608683promoter 内 927-945 bp + 3056 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 32604017-32605609(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGAATGGAAGGGGTCAACG
SmilChr07G000565 Chr07 NC_080393.1:3870318-3870336promoter 内 925-943 bp - 3058 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3867065-3867260(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTTTTTTGTGAA
SmilChr07G001206 Chr07 NC_080393.1:9202866-9202884promoter 内 896-914 bp - 3087 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 9196812-9199779(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTGTATCCAGCCC
SmilChr02G004806 Chr02 NC_080388.1:70233879-70233897promoter 内 797-815 bp - 3186 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 70225492-70230693(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTCCCTGAACTT
SmilChr01G005937 Chr01 NC_080387.1:75121196-75121214promoter 内 768-786 bp + 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 75116386-75117981(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAAGAGTCTCAAGTCAACG
SmilChr04G000698 Chr04 NC_080390.1:8149179-8149197promoter 内 756-774 bp + 3227 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8141791-8145952(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr04G001356 Chr04 NC_080390.1:22047464-22047482promoter 内 701-719 bp + 3282 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22040387-22044182(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGGTACTCCAAAGTCAACA
SmilChr03G002707 Chr03 NC_080389.1:43046705-43046723promoter 内 699-717 bp - 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43042381-43043421(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTTATTTAATAAT
SmilChr02G004777 Chr02 NC_080388.1:69949093-69949111promoter 内 679-697 bp - 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69943037-69945789(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTTAACTTTAAT
SmilChr07G004156 Chr07 NC_080393.1:53407638-53407656promoter 内 611-629 bp + 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53403196-53404266(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCATCTTGCAGAGTCAACG
SmilChr03G000758 Chr03 NC_080389.1:8642843-8642861promoter 内 607-625 bp + 3376 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8646237-8647566(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCGTCCCCACGAG
SmilChr01G001666 Chr01 NC_080387.1:30754420-30754438promoter 内 468-486 bp - 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30748494-30750905(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTTGGAACGATA
SmilChr01G000593 Chr01 NC_080387.1:12925373-12925391promoter 内 453-471 bp + 3530 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 12914528-12921843(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCTACAAATTAGGTCAACG
SmilChr02G005605 Chr02 NC_080388.1:75744750-75744768promoter 内 375-393 bp - 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 75748376-75752116(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GCAAAGCCCTTAGTCAACG
SmilChr02G000878 Chr02 NC_080388.1:15119664-15119682promoter 内 367-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 15104295-15116048(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAAGTATGAAGAGTCAACG
SmilChr04G002715 Chr04 NC_080390.1:42765990-42766008promoter 内 296-314 bp + 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 42760769-42762303(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GCGACGAAGAAAGTCAACA
SmilChr05G001518 Chr05 NC_080391.1:13916412-13916430promoter 内 285-303 bp - 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 13906375-13912714(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTGTGTCGAGTT
SmilChr01G001094 Chr01 NC_080387.1:22390264-22390282promoter 内 255-273 bp - 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22386464-22386536(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTTGTTTGGAGA
SmilChr02G000304 Chr02 NC_080388.1:3845248-3845266promoter 内 129-147 bp - 3854 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3839067-3841394(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTCTTTAATGCTA
SmilChr01G005270 Chr01 NC_080387.1:70128177-70128195promoter 内 115-133 bp + 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 70132063-70133235(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCGTGGGGCCCGA
SmilChr08G002964 Chr08 NC_080394.1:29654594-29654612promoter 内 83-101 bp - 3900 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 29650622-29650694(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTTGTTATTGCA
SmilChr02G002213 Chr02 NC_080388.1:39371429-39371447promoter 内 649-667 bp + 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 4 39374781-39375809(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTTTTCCTCTCC
SmilChr08G003379 Chr08 NC_080394.1:35436436-35436454promoter 内 1752-1770 bp + 2231 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 35438685-35442221(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTGGACTTGGCA
SmilChr02G002187 Chr02 NC_080388.1:39080217-39080235promoter 内 287-305 bp - 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 39074556-39076521(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTGTTGTGGCGTC
SmilChr01G003211 Chr01 NC_080387.1:50885374-50885392promoter 内 3931-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 50882790-50885322(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTTCGCGTATGC
SmilChr07G003653 Chr07 NC_080393.1:43449222-43449240promoter 内 3645-3663 bp + 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 43449578-43450054(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTACGTCGAAATG
SmilChr05G000122 Chr05 NC_080391.1:949866-949884promoter 内 3547-3565 bp + 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 950320-959083(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTTTCATATTTGT
SmilChr03G003777 Chr03 NC_080389.1:56922063-56922081promoter 内 3440-3458 bp + 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 56922624-56925507(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTCCCAAGTCTC
SmilChr04G002462 Chr04 NC_080390.1:39446223-39446241promoter 内 3363-3381 bp + 620 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 39443057-39445603(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATTTAAGGGATGGTCAACG
SmilChr03G000719 Chr03 NC_080389.1:8057256-8057274promoter 内 2677-2695 bp + 1306 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 8058580-8060311(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTGTCTTGTGAGT
SmilChr04G000370 Chr04 NC_080390.1:3713914-3713932promoter 内 2604-2622 bp + 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 3715311-3719135(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTAACGGCGTCAG
SmilChr03G003775 Chr03 NC_080389.1:56922063-56922081promoter 内 2560-2578 bp + 1423 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 56917900-56920640(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGACTTGGGAGGTCAACG