转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 4 / 134 下载 TSV

上一页 4 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002897 Chr01 NC_080387.1:47659792-47659806promoter 内 962-976 bp - 3025 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 47662831-47664594(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTGCTATA
SmilChr01G005422 Chr01 NC_080387.1:71414607-71414621promoter 内 3180-3194 bp + 807 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 71407830-71413800(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTACTATT
SmilChr01G001053 Chr01 NC_080387.1:21872863-21872877promoter 内 2700-2714 bp - 1287 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 21874164-21877195(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTGCCTAT
SmilChr02G003666 Chr02 NC_080388.1:58050238-58050252promoter 内 275-289 bp - 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 58053964-58056539(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACCATCATTACTTTT
SmilChr02G000702 Chr02 NC_080388.1:11218400-11218414promoter 内 3583-3597 bp + 404 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 11208006-11217996(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATCTTC
SmilChr03G001974 Chr03 NC_080389.1:28491732-28491746promoter 内 2081-2095 bp - 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 28487679-28489826(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGATAATGATGAT
SmilChr03G001374 Chr03 NC_080389.1:16203071-16203085promoter 内 145-159 bp + 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 16196523-16199229(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACTCTT
SmilChr01G004196 Chr01 NC_080387.1:60414855-60414869promoter 内 1353-1367 bp + 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 60417503-60433614(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTTGTAATGATTAT
SmilChr03G000020 Chr03 NC_080389.1:238347-238361promoter 内 1205-1219 bp - 2782 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 241143-243722(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACAACC
SmilChr02G003912 Chr02 NC_080388.1:61216758-61216772promoter 内 912-926 bp + 3075 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 61206599-61213683(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACAACC
SmilChr02G000306 Chr02 NC_080388.1:3852058-3852072promoter 内 894-908 bp - 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 3855165-3858519(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAGATTT
SmilChr01G004642 Chr01 NC_080387.1:64454195-64454209promoter 内 732-746 bp + 3255 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 64457464-64462184(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTTGTAATGATTAT
SmilChr02G001662 Chr02 NC_080388.1:30848639-30848653promoter 内 3554-3568 bp + 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 30849086-30851629(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTTGTAATGATTAT
SmilChr01G002935 Chr01 NC_080387.1:48109948-48109962promoter 内 3185-3199 bp + 802 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 48106910-48109146(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACAACC
SmilChr02G001639 Chr02 NC_080388.1:30412642-30412656promoter 内 3181-3195 bp + 806 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 30413462-30415790(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTTGTAATGATTAT
SmilChr03G002105 Chr03 NC_080389.1:32765362-32765376promoter 内 2782-2796 bp - 1205 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 32761755-32764157(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAGTAATGATGAG
SmilChr01G000023 Chr01 NC_080387.1:435300-435314promoter 内 2629-2643 bp - 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 436672-447883(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACAACC
SmilChr02G000807 Chr02 NC_080388.1:13504399-13504413promoter 内 2186-2200 bp - 1801 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 13498082-13502598(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATTCTAATGATGAC
SmilChr02G000808 Chr02 NC_080388.1:13541548-13541562promoter 内 2186-2200 bp - 1801 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 13535231-13539747(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATTCTAATGATGAC
SmilChr01G002936 Chr01 NC_080387.1:48109948-48109962promoter 内 651-665 bp + 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 48113298-48119428(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTTGTAATGATTAT
SmilChr01G003981 Chr01 NC_080387.1:58258435-58258449promoter 内 261-275 bp + 3726 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 58262175-58264660(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTTGTAATGATTAT
SmilChr01G001812 Chr01 NC_080387.1:33044404-33044418promoter 内 3413-3427 bp - 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 33044992-33053763(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTACAATA
SmilChr01G005797 Chr01 NC_080387.1:74048302-74048316promoter 内 2864-2878 bp + 1123 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 74049439-74053234(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTTGTAATGATTAT
SmilChr02G000274 Chr02 NC_080388.1:3525923-3525937promoter 内 2690-2704 bp + 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 3518093-3524626(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACAACC
SmilChr02G000275 Chr02 NC_080388.1:3525923-3525937promoter 内 1970-1984 bp + 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 3519795-3523906(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACAACC
SmilChr02G000388 Chr02 NC_080388.1:4817469-4817483promoter 内 1925-1939 bp + 2062 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 4810835-4815407(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTGCATTC
SmilChr02G000399 Chr02 NC_080388.1:4932621-4932635promoter 内 1904-1918 bp + 2083 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 4934718-4938827(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTGGTAATGATTAC
SmilChr02G003396 Chr02 NC_080388.1:55082707-55082721promoter 内 1535-1549 bp + 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 55085173-55089489(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAAGATAATGATGAC
SmilChr02G001834 Chr02 NC_080388.1:33416338-33416352promoter 内 1406-1420 bp - 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 33408305-33413757(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTTGTAATGATTAT
SmilChr01G001121 Chr01 NC_080387.1:22834919-22834933promoter 内 1392-1406 bp + 2595 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 22831740-22832324(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACATTA
SmilChr02G001248 Chr02 NC_080388.1:22928922-22928936promoter 内 1336-1350 bp + 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 22931587-22932753(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTGGTAATGATTAC
SmilChr01G000153 Chr01 NC_080387.1:2592886-2592900promoter 内 43-57 bp - 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 2596844-2599067(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTACTAAA
SmilChr01G001076 Chr01 NC_080387.1:22170245-22170259promoter 内 3750-3764 bp - 237 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 22168311-22170008(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGATAATGATTAT
SmilChr02G000986 Chr02 NC_080388.1:17343025-17343039promoter 内 2968-2982 bp + 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 17344058-17346016(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAATAATGATGAC
SmilChr02G005161 Chr02 NC_080388.1:72952695-72952709promoter 内 353-367 bp + 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 72956343-72960922(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGATAATGATGAT
SmilChr01G001654 Chr01 NC_080387.1:30606148-30606162promoter 内 2923-2937 bp - 1064 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 30601165-30605084(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGATAATGATGAT
SmilChr01G001655 Chr01 NC_080387.1:30606148-30606162promoter 内 1795-1809 bp - 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 30608354-30613727(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATCATT
SmilChr03G002572 Chr03 NC_080389.1:40902124-40902138promoter 内 1769-1783 bp - 2218 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 40904356-40905561(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATCTTT
SmilChr01G000979 Chr01 NC_080387.1:20741946-20741960promoter 内 1747-1761 bp - 2240 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 20744200-20746027(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATCTTT
SmilChr02G001018 Chr02 NC_080388.1:17955083-17955097promoter 内 1686-1700 bp - 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 17957398-17959035(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATCTTT
SmilChr01G001006 Chr01 NC_080387.1:21186579-21186593promoter 内 1369-1383 bp + 2618 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 21189211-21192925(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGATAATGATGAT
SmilChr01G004783 Chr01 NC_080387.1:66032039-66032053promoter 内 733-747 bp - 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 66028084-66028785(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAATGTAATGATGGT
SmilChr01G000945 Chr01 NC_080387.1:20044996-20045010promoter 内 3854-3868 bp - 133 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 20045143-20050294(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATCATT
SmilChr02G003939 Chr02 NC_080388.1:61529857-61529871promoter 内 3778-3792 bp + 209 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 61529031-61529648(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTACACTT
SmilChr02G000069 Chr02 NC_080388.1:883137-883151promoter 内 3768-3782 bp + 219 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 883370-884867(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACAGTAATGATGAT
SmilChr01G004559 Chr01 NC_080387.1:63677127-63677141promoter 内 3665-3679 bp + 322 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 63672047-63676805(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACACTT
SmilChr02G002452 Chr02 NC_080388.1:42783473-42783487promoter 内 2976-2990 bp - 1011 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 42784498-42789111(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATCATT
SmilChr01G001529 Chr01 NC_080387.1:29285897-29285911promoter 内 2336-2350 bp - 1651 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 29287562-29290363(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATTATC
SmilChr01G002380 Chr01 NC_080387.1:41000439-41000453promoter 内 1981-1995 bp - 2006 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 41002459-41005081(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTACTTAA
SmilChr02G003119 Chr02 NC_080388.1:52214403-52214417promoter 内 1586-1600 bp + 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 52210869-52212002(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATCTTT