转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G001885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020124-RA_Salv SmilChr01G001885 WRKY XP_057806790.1 MP00171 AAAAGTCAACGAT

可能结合的靶基因

9833 个结合位点 7182 个候选靶基因 第 43 / 144 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004178 Chr02 NC_080388.1:64075903-64075915promoter 内 317-329 bp - 3672 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 64068322-64072231(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GTTAGTCAACGCG
SmilChr01G002753 Chr01 NC_080387.1:45853807-45853819promoter 内 302-314 bp + 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 45847328-45850120(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G005420 Chr02 NC_080388.1:74648333-74648345promoter 内 172-184 bp - 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 74652162-74654206(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCTTTGACTTTT
SmilChr04G002991 Chr04 NC_080390.1:46337402-46337414promoter 内 172-184 bp + 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 46341231-46342816(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CTTGGTCAACGGC
SmilChr02G004132 Chr02 NC_080388.1:63565692-63565704promoter 内 161-173 bp - 3828 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 63569532-63571536(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TATGTTGACTTTT
SmilChr01G002115 Chr01 NC_080387.1:37191408-37191420promoter 内 98-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 37184435-37187517(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGCATTGACTTTG
SmilChr04G003177 Chr04 NC_080390.1:48450869-48450881promoter 内 7-19 bp + 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 48454863-48455896(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GTTAGTCAACGCG
SmilChr04G001714 Chr04 NC_080390.1:28362901-28362913promoter 内 1837-1849 bp + 2152 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 7 28359711-28360749(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGGGTTGACTTGG
SmilChr03G004036 Chr03 NC_080389.1:59374034-59374046promoter 内 3250-3262 bp - 739 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 59374785-59375569(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACCGTTGACCACT
SmilChr01G001269 Chr01 NC_080387.1:25362407-25362419promoter 内 661-673 bp + 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 25365747-25366130(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GTTAGTCAACGCA
SmilChr01G002109 Chr01 NC_080387.1:37155073-37155085promoter 内 350-362 bp - 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 37148586-37151434(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AATAGTCAACCAT
SmilChr04G002101 Chr04 NC_080390.1:33900394-33900406promoter 内 3640-3652 bp - 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 33895820-33900045(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CACAGTCAACCGC
SmilChr01G002139 Chr01 NC_080387.1:37376516-37376528promoter 内 3088-3100 bp + 901 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 37377429-37378289(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AACAGTCAACTGC
SmilChr02G001791 Chr02 NC_080388.1:32666014-32666026promoter 内 3084-3096 bp + 905 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 32662522-32665109(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGGGTTGACTCTT
SmilChr01G004872 Chr01 NC_080387.1:66834211-66834223promoter 内 2768-2780 bp + 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 66831346-66832990(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACCGTTGACTCGG
SmilChr03G003057 Chr03 NC_080389.1:47469929-47469941promoter 内 2678-2690 bp + 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 47466730-47468618(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGTTGACTGTG
SmilChr02G001579 Chr02 NC_080388.1:29474038-29474050promoter 内 2062-2074 bp + 1927 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 29470400-29472111(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGCGTTGACTAAC
SmilChr04G001469 Chr04 NC_080390.1:24119660-24119672promoter 内 1954-1966 bp + 2035 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 24121707-24130736(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAGAGTCAACCCT
SmilChr04G003124 Chr04 NC_080390.1:47855942-47855954promoter 内 1898-1910 bp - 2091 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 47851420-47853851(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CATAGTCAACTCA
SmilChr01G005431 Chr01 NC_080387.1:71467806-71467818promoter 内 1848-1860 bp - 2141 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 71469959-71473519(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGAGTTGACTATG
SmilChr01G004839 Chr01 NC_080387.1:66527107-66527119promoter 内 1553-1565 bp + 2436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 66523337-66524671(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCTTTGACTTTG
SmilChr03G000820 Chr03 NC_080389.1:9403176-9403188promoter 内 1034-1046 bp - 2955 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 9397138-9400221(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAAAGTCAAAGAT
SmilChr04G000785 Chr04 NC_080390.1:9658438-9658450promoter 内 967-979 bp + 3022 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 9652815-9655416(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CCCGTTGACCTAA
SmilChr01G004871 Chr01 NC_080387.1:66834211-66834223promoter 内 804-816 bp + 3185 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 66828607-66831026(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACCGTTGACTCGG
SmilChr04G002582 Chr04 NC_080390.1:41203811-41203823promoter 内 709-721 bp - 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 41207103-41210873(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGTTGACTTCA
SmilChr03G002823 Chr03 NC_080389.1:44717860-44717872promoter 内 683-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 44713523-44714554(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATGGTTGACTTCG
SmilChr01G001685 Chr01 NC_080387.1:31085212-31085224promoter 内 465-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 31080667-31081688(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CTAAGTCAACTCG
SmilChr03G001396 Chr03 NC_080389.1:16578084-16578096promoter 内 243-255 bp - 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 16581842-16589213(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TCCGTTGACTCCT
SmilChr02G005184 Chr02 NC_080388.1:73150574-73150586promoter 内 228-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 73145483-73146813(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CCCGTTGACCTAA
SmilChr01G005798 Chr01 NC_080387.1:74058547-74058559promoter 内 3964-3976 bp - 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 74058584-74062104(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CTAGTTGACTTTA
SmilChr01G005800 Chr01 NC_080387.1:74073971-74073983promoter 内 3933-3945 bp - 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 74074039-74077240(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CTAGTTGACTTTA
SmilChr01G005701 Chr01 NC_080387.1:73260662-73260674promoter 内 3896-3908 bp - 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 73257396-73260569(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GATGGTCAACGTT
SmilChr01G000254 Chr01 NC_080387.1:4819765-4819777promoter 内 3816-3828 bp - 173 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4819950-4827593(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCCTTTGACTTTA
SmilChr04G002253 Chr04 NC_080390.1:36512292-36512304promoter 内 3761-3773 bp + 228 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36492325-36512064(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCCATTGACTTTT
SmilChr01G001861 Chr01 NC_080387.1:33569989-33570001promoter 内 3711-3723 bp - 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 33570279-33572198(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TTCGTTGACCTCC
SmilChr01G001903 Chr01 NC_080387.1:34137846-34137858promoter 内 3708-3720 bp - 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 34138139-34140145(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TTCGTTGACCTCC
SmilChr01G001445 Chr01 NC_080387.1:28144276-28144288promoter 内 3705-3717 bp + 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 28144572-28148054(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAATGGC
SmilChr02G001675 Chr02 NC_080388.1:31002685-31002697promoter 内 3648-3660 bp - 341 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 30999605-31002344(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CATAGTCAACTCA
SmilChr03G003851 Chr03 NC_080389.1:57633350-57633362promoter 内 3631-3643 bp + 358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 57633720-57637407(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGGAGTCAACGCT
SmilChr02G003390 Chr02 NC_080388.1:55023388-55023400promoter 内 3609-3621 bp - 380 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55023780-55031918(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACCTCA
SmilChr01G002878 Chr01 NC_080387.1:47380697-47380709promoter 内 3592-3604 bp - 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47381106-47389482(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GTAGTTGACTTGT
SmilChr04G000413 Chr04 NC_080390.1:4327587-4327599promoter 内 3392-3404 bp - 597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4328196-4338998(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGGGTTGACTTAC
SmilChr04G002489 Chr04 NC_080390.1:39757998-39758010promoter 内 3242-3254 bp - 747 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39758757-39762666(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCCGTTGACTCAC
SmilChr04G002514 Chr04 NC_080390.1:40155130-40155142promoter 内 3219-3231 bp - 770 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40155912-40157755(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCCGTTGACTCAC
SmilChr01G005610 Chr01 NC_080387.1:72647873-72647885promoter 内 3180-3192 bp + 809 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 72648694-72652315(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAAAGTCAACATA
SmilChr01G000332 Chr01 NC_080387.1:6770398-6770410promoter 内 3170-3182 bp + 819 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6771229-6774681(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAAAGTCAAAGAT
SmilChr04G002254 Chr04 NC_080390.1:36512292-36512304promoter 内 2971-2983 bp + 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36513322-36514476(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAATGGC
SmilChr04G002456 Chr04 NC_080390.1:39326379-39326391promoter 内 2474-2486 bp + 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39321217-39324864(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GTCGTTGACCCTC
SmilChr03G002936 Chr03 NC_080389.1:46095043-46095055promoter 内 2295-2307 bp - 1694 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 46090225-46093349(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CTAAGTCAACTAC
SmilChr01G002588 Chr01 NC_080387.1:44010858-44010870promoter 内 2012-2024 bp + 1977 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 44012847-44012918(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AATAGTCAACCAT