Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G006187; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027306-RA_Salv SmilChr01G006187 GRAS XP_057798078.1 MP00611 AAGAAAAAGACAAAAAAAAA

可能结合的靶基因

9807 个结合位点 6232 个候选靶基因 第 43 / 125 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004494 Chr01 NC_080387.1:63063203-63063222promoter 内 2385-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 5 63064819-63070667(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAGAAAAAGAAAAAAAAA
SmilChr03G000349 Chr03 NC_080389.1:3922989-3923008promoter 内 1783-1802 bp + 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 5 3919408-3920790(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCTTTTTTCCTCTTTTTTTT
SmilChr01G003518 Chr01 NC_080387.1:53817457-53817476promoter 内 1449-1468 bp - 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 5 53807204-53814924(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAAAAAAAGAGCAAAGAAAG
SmilChr01G000797 Chr01 NC_080387.1:17240665-17240684promoter 内 349-368 bp - 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 5 17235549-17237032(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CACAAAAAGATAAAAGGAAG
SmilChr01G005869 Chr01 NC_080387.1:74628446-74628465promoter 内 40-59 bp - 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 5 74623630-74624504(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAGAAAAGAAAAAAAAA
SmilChr03G003542 Chr03 NC_080389.1:54053628-54053647promoter 内 3800-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 4 54052083-54053446(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAACGAAA
SmilChr02G000679 Chr02 NC_080388.1:10631655-10631674promoter 内 1058-1077 bp - 2924 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 4 10634598-10635767(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTACGCTTTGTCTCTCTCGC
SmilChr03G000350 Chr03 NC_080389.1:3922989-3923008promoter 内 261-280 bp + 3721 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 4 3926729-3927735(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAGGAAAAAAGG
SmilChr01G004760 Chr01 NC_080387.1:65790615-65790634promoter 内 3917-3936 bp + 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 65790699-65793386(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAGAAAAGAAAAAAAAA
SmilChr01G000798 Chr01 NC_080387.1:17240665-17240684promoter 内 3023-3042 bp - 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 17237048-17239706(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CACAAAAAGATAAAAGGAAG
SmilChr01G004759 Chr01 NC_080387.1:65790615-65790634promoter 内 2308-2327 bp + 1674 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 65785348-65788941(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTTTTCTTCTT
SmilChr02G003446 Chr02 NC_080388.1:55715617-55715636promoter 内 2074-2093 bp - 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 55717544-55720811(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTACTTTGTCTTTTCGTA
SmilChr01G004761 Chr01 NC_080387.1:65790615-65790634promoter 内 1043-1062 bp + 2939 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 65793573-65796299(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAGAAAAGAAAAAAAAA
SmilChr03G000211 Chr03 NC_080389.1:2451116-2451135promoter 内 585-604 bp + 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 2454532-2455616(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TAAACAGAGACAAAAGAAAG
SmilChr03G001132 Chr03 NC_080389.1:13062760-13062779promoter 内 348-367 bp + 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 13066413-13071497(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGCAAAAAGACAAACACATG
SmilChr02G003947 Chr02 NC_080388.1:61621478-61621497promoter 内 312-331 bp - 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 61625167-61628104(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCATCTTTTCTTTTTTTCTT
SmilChr02G003100 Chr02 NC_080388.1:51924878-51924897promoter 内 3930-3949 bp + 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 51924949-51926836(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAGGAAACTAAA
SmilChr01G005712 Chr01 NC_080387.1:73337070-73337089promoter 内 3571-3590 bp - 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 73337500-73338856(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTGTCCTTTCTTT
SmilChr01G001932 Chr01 NC_080387.1:34481803-34481822promoter 内 3314-3333 bp - 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 34482490-34484538(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCTTTTTTTTTCTTTTTGTT
SmilChr01G002143 Chr01 NC_080387.1:37414826-37414845promoter 内 3278-3297 bp - 704 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 37405867-37414122(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAAAAAGAGAGGAAAAAC
SmilChr03G002949 Chr03 NC_080389.1:46212204-46212223promoter 内 3213-3232 bp - 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 46212992-46223199(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTCTCTCTCTTCT
SmilChr02G005271 Chr02 NC_080388.1:73791393-73791412promoter 内 3008-3027 bp + 974 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 73786059-73790419(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTCTTTTCTTT
SmilChr01G002316 Chr01 NC_080387.1:40149978-40149997promoter 内 2994-3013 bp - 988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 40144918-40148990(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGCAAAAAAACAAAAAAGGG
SmilChr03G003206 Chr03 NC_080389.1:49605700-49605719promoter 内 2989-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 49602347-49604707(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CACAAAATGACAAAAATAAA
SmilChr02G000792 Chr02 NC_080388.1:13060163-13060182promoter 内 2933-2952 bp + 1049 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 13058344-13059114(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTTTTTCTCTT
SmilChr01G005284 Chr01 NC_080387.1:70212305-70212324promoter 内 2694-2713 bp - 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 70213612-70214342(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTCTCTCTCTTCT
SmilChr01G006003 Chr01 NC_080387.1:75605992-75606011promoter 内 2648-2667 bp + 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 75601814-75604658(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ACTTTTTTTGTCTTTTCTCT
SmilChr01G002884 Chr01 NC_080387.1:47460947-47460966promoter 内 2633-2652 bp + 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 47456887-47459598(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ACTTTTTTTTTCTTTTTCTT
SmilChr02G001847 Chr02 NC_080388.1:33699922-33699941promoter 内 2594-2613 bp + 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 33701329-33702519(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAAAGAAAACAAAA
SmilChr03G002950 Chr03 NC_080389.1:46228868-46228887promoter 内 2446-2465 bp + 1536 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 46223676-46227332(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTGTTTTTGTCATTACCTC
SmilChr02G005259 Chr02 NC_080388.1:73681062-73681081promoter 内 2304-2323 bp - 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 73682759-73685301(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTTTTTTCCTC
SmilChr01G002325 Chr01 NC_080387.1:40332663-40332682promoter 内 2194-2213 bp - 1788 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 40326715-40330875(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGCAAAAAAACAAAAAAGGG
SmilChr03G000928 Chr03 NC_080389.1:10610564-10610583promoter 内 2194-2213 bp + 1788 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 10612371-10613598(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAGAAAAAGAAAAAAAAAAT
SmilChr02G003906 Chr02 NC_080388.1:61122461-61122480promoter 内 2160-2179 bp + 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 61124302-61124374(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAAACAAAAAAAGA
SmilChr01G002260 Chr01 NC_080387.1:39398538-39398557promoter 内 1831-1850 bp - 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 39392484-39396387(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGCAAAAGGACAAAAAATAA
SmilChr02G004375 Chr02 NC_080388.1:66112334-66112353promoter 内 1819-1838 bp + 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 66114516-66116923(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGGAAAAGGACAAAAATATA
SmilChr01G004880 Chr01 NC_080387.1:66890581-66890600promoter 内 1789-1808 bp - 2193 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 66884000-66888388(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAAAAAGAAAAACAGAGA
SmilChr03G003169 Chr03 NC_080389.1:49049900-49049919promoter 内 1491-1510 bp + 2491 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 49044591-49047409(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTCTTTTTGTCGCGTCTTC
SmilChr03G000930 Chr03 NC_080389.1:10617820-10617839promoter 内 1300-1319 bp + 2682 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 10620521-10654750(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAGAAAAAGAAAAAAAAAAT
SmilChr03G002002 Chr03 NC_080389.1:29855686-29855705promoter 内 1283-1302 bp - 2699 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 29848727-29852987(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTGAAGGAGACAAACCCGGG
SmilChr01G000175 Chr01 NC_080387.1:2849409-2849428promoter 内 1201-1220 bp - 2781 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 2852209-2853163(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TGCTCTTTTCTCTTTTTTCT
SmilChr01G000016 Chr01 NC_080387.1:342938-342957promoter 内 750-769 bp - 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 346189-354787(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTTATTTTTGTCTTTTAGTG
SmilChr01G004638 Chr01 NC_080387.1:64412564-64412583promoter 内 667-686 bp - 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 64407362-64409249(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CATAAGAAGACAAAAGACAA
SmilChr01G005285 Chr01 NC_080387.1:70212305-70212324promoter 内 407-426 bp - 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 70215899-70216693(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTCTCTCTCTTCT
SmilChr01G005954 Chr01 NC_080387.1:75240370-75240389promoter 内 3967-3986 bp + 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 75238405-75240355(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTGTTTTTGTTTTTCTTTT
SmilChr03G003141 Chr03 NC_080389.1:48628075-48628094promoter 内 3948-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 48627339-48628041(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ACATCTCTTGTCTTTTTCCT
SmilChr02G003367 Chr02 NC_080388.1:54795976-54795995promoter 内 3760-3779 bp - 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 54788150-54795754(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAGAGGAAAG
SmilChr01G004311 Chr01 NC_080387.1:61291949-61291968promoter 内 3579-3598 bp - 403 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 61289693-61291546(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAGAAGCAGACAAAATATAA
SmilChr02G002826 Chr02 NC_080388.1:48365479-48365498promoter 内 3365-3384 bp - 617 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 48358381-48364862(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGAAGAGAGAGAAAAAAAAG
SmilChr01G001341 Chr01 NC_080387.1:26652504-26652523promoter 内 3360-3379 bp + 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 26653145-26656117(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAAAAAGATAGAAGGGAG