Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000593; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001545-RA_Salv SmilChr05G000593 MIKC_MADS XP_057764223.1 MP00609 TTTTTTCCATTTTTGGTAA

可能结合的靶基因

9941 个结合位点 7575 个候选靶基因 第 43 / 152 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000395 Chr06 NC_080392.1:3152664-3152682promoter 内 2321-2339 bp + 1662 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 3154344-3160508(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTATTTCCTTTTTTGGTTG
SmilChr03G002930 Chr03 NC_080389.1:46058696-46058714promoter 内 2141-2159 bp + 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 46053309-46056854(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TACCCAAAAAAAGAAAGAG
SmilChr04G002347 Chr04 NC_080390.1:37859784-37859802promoter 内 1951-1969 bp + 2032 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 37861834-37865129(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CTTATTCCTTTTTTGGTAA
SmilChr06G002304 Chr06 NC_080392.1:33283856-33283874promoter 内 1405-1423 bp + 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 33274980-33281278(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTGCCAAAAAGGGAGAAAA
SmilChr06G001174 Chr06 NC_080392.1:11949231-11949249promoter 内 1285-1303 bp - 2698 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 11951947-11952390(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TAACCCAAAATGGAAATGT
SmilChr04G002787 Chr04 NC_080390.1:43733150-43733168promoter 内 1026-1044 bp + 2957 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 43725659-43730193(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCTAAAAATGGCAAAGA
SmilChr06G001171 Chr06 NC_080392.1:11929450-11929468promoter 内 962-980 bp - 3021 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 11923120-11926429(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACATTTCCATTTTGGGTTA
SmilChr01G005496 Chr01 NC_080387.1:71861847-71861865promoter 内 805-823 bp + 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 71865043-71868647(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCTTGTTTTGGTAA
SmilChr02G004400 Chr02 NC_080388.1:66347663-66347681promoter 内 704-722 bp + 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 66341746-66344384(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCAAAAAAAGAAATGA
SmilChr03G003960 Chr03 NC_080389.1:58649762-58649780promoter 内 638-656 bp - 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 58638148-58646417(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTGGGCAC
SmilChr04G000184 Chr04 NC_080390.1:1628446-1628464promoter 内 592-610 bp + 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 1631855-1635735(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCTCTTTTTGGCTT
SmilChr06G000371 Chr06 NC_080392.1:2856013-2856031promoter 内 320-338 bp + 3663 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 2859694-2865881(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTATTTCCTTTTTTGGTTG
SmilChr06G001594 Chr06 NC_080392.1:17643328-17643346promoter 内 299-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 5 17636948-17639644(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AATCCAAAAAGGGCAAAAA
SmilChr03G001746 Chr03 NC_080389.1:23644152-23644170promoter 内 1933-1951 bp - 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 23637761-23642102(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CTTTTTCCTTTTTAGGAAT
SmilChr04G002492 Chr04 NC_080390.1:39816438-39816456promoter 内 445-463 bp + 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 39811475-39812900(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AATCCAAAAAGGGCAAAAA
SmilChr01G001450 Chr01 NC_080387.1:28196153-28196171promoter 内 3408-3426 bp + 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 28196746-28198342(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CATTTACCATTTTTGGACA
SmilChr01G005787 Chr01 NC_080387.1:73952275-73952293promoter 内 3248-3266 bp + 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 73953028-73956878(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CATTTACCATTTTTGGACA
SmilChr02G000571 Chr02 NC_080388.1:8067808-8067826promoter 内 3135-3153 bp - 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 8068674-8071081(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CACCCAAAAATGGAAAAAC
SmilChr05G000023 Chr05 NC_080391.1:103901-103919promoter 内 2906-2924 bp - 1077 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 104996-116536(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AATCCAAAAAGGGCAAAAA
SmilChr02G003923 Chr02 NC_080388.1:61302111-61302129promoter 内 2897-2915 bp - 1086 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 61298190-61301025(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CCATTTCTTTTTTTGGTAA
SmilChr05G003232 Chr05 NC_080391.1:41483069-41483087promoter 内 2895-2913 bp + 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 41484175-41485191(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CCCTTGCCATTTTGGGCTG
SmilChr05G003169 Chr05 NC_080391.1:40500582-40500600promoter 内 2894-2912 bp - 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 40498468-40499493(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CCCTTGCCATTTTGGGCTG
SmilChr01G001917 Chr01 NC_080387.1:34311813-34311831promoter 内 2430-2448 bp + 1553 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 34313384-34317252(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGCTTGCCACTTTTGGTGT
SmilChr01G001873 Chr01 NC_080387.1:33755121-33755139promoter 内 2394-2412 bp + 1589 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 33756728-33760494(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGCTTGCCACTTTTGGTGT
SmilChr01G005962 Chr01 NC_080387.1:75347843-75347861promoter 内 2158-2176 bp + 1825 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 75344639-75346018(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AATCCAAAAAGGGCAAAAA
SmilChr05G004158 Chr05 NC_080391.1:55500983-55501001promoter 内 1328-1346 bp + 2655 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 55494715-55498328(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCTAAAAATGGAAAGGG
SmilChr06G000265 Chr06 NC_080392.1:1800713-1800731promoter 内 780-798 bp - 3203 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 1795068-1797510(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CCCTTGCCATTTTGGGCTG
SmilChr01G005810 Chr01 NC_080387.1:74127380-74127398promoter 内 516-534 bp + 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 74123288-74123913(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGACCAAAAAAAGAAAAAC
SmilChr01G003544 Chr01 NC_080387.1:54029129-54029147promoter 内 405-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 54032725-54035627(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCCTTTTTGGATT
SmilChr02G002454 Chr02 NC_080388.1:42818663-42818681promoter 内 394-412 bp - 3589 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 42822270-42822856(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AGTCCCAAAATGGAAAAAG
SmilChr01G004435 Chr01 NC_080387.1:62444300-62444318promoter 内 296-314 bp + 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 62448005-62450804(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACACTTCCATTTTTGGAAA
SmilChr04G002258 Chr04 NC_080390.1:36533192-36533210promoter 内 244-262 bp + 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 36536949-36540965(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCCTTTTTGGATT
SmilChr04G000503 Chr04 NC_080390.1:5503352-5503370promoter 内 80-98 bp - 3903 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 5495844-5499449(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTTCTACTTTTGGGAT
SmilChr05G001204 Chr05 NC_080391.1:10128485-10128503promoter 内 3817-3835 bp + 166 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 10128669-10130629(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTATTTCTATTTTTGGTTA
SmilChr02G000533 Chr02 NC_080388.1:7364891-7364909promoter 内 3753-3771 bp + 230 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 7365139-7366519(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCCTTTTTGGATT
SmilChr01G004146 Chr01 NC_080387.1:59983628-59983646promoter 内 3748-3766 bp - 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 59983881-59989552(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACACCAAAAATGGCAAAAG
SmilChr03G002871 Chr03 NC_080389.1:45354772-45354790promoter 内 3672-3690 bp + 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 45355101-45356023(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCCTTTTTGGATT
SmilChr05G001373 Chr05 NC_080391.1:12256358-12256376promoter 内 3659-3677 bp + 324 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 12253839-12256034(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AGTCCAAAAATAGAAAGAT
SmilChr05G001544 Chr05 NC_080391.1:14136030-14136048promoter 内 3509-3527 bp + 474 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 14136522-14138957(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTGCCATTTTGGGACG
SmilChr03G003831 Chr03 NC_080389.1:57409866-57409884promoter 内 3449-3467 bp - 534 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 57410418-57417373(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CACCCAAAAATGGCAAAAA
SmilChr02G002569 Chr02 NC_080388.1:44700858-44700876promoter 内 3205-3223 bp - 778 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 44692150-44700080(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCCTTTTTGGATT
SmilChr02G000545 Chr02 NC_080388.1:7520439-7520457promoter 内 3181-3199 bp + 802 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 7515718-7519637(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CACCCAAAAATGGAAAAAC
SmilChr01G005630 Chr01 NC_080387.1:72750984-72751002promoter 内 3170-3188 bp + 813 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 72746687-72750171(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CAACCAAAAATGGAAATAT
SmilChr04G002590 Chr04 NC_080390.1:41325185-41325203promoter 内 3144-3162 bp + 839 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 41321268-41324346(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AATCCAAAAAGGGCAAAAA
SmilChr02G000031 Chr02 NC_080388.1:387119-387137promoter 内 3142-3160 bp + 841 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 387978-389068(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCCTTTTTGGATT
SmilChr06G000492 Chr06 NC_080392.1:4029905-4029923promoter 内 3085-3103 bp + 898 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 4025325-4029007(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGTAAATG
SmilChr02G002513 Chr02 NC_080388.1:43631515-43631533promoter 内 3035-3053 bp + 948 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 43632481-43634332(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCCTTTTTGGATT
SmilChr05G001145 Chr05 NC_080391.1:9585245-9585263promoter 内 2963-2981 bp + 1020 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 9586283-9593541(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCCTTTTTGGATT
SmilChr05G000654 Chr05 NC_080391.1:4931319-4931337promoter 内 2944-2962 bp - 1039 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 4932376-4935286(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CGACCAAAAAAGGAAAATT
SmilChr01G002901 Chr01 NC_080387.1:47698186-47698204promoter 内 2851-2869 bp - 1132 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 47696201-47697054(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AATTTTCCTTTTTTGGTCG