转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G000836; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008579-RA_Salv SmilChr07G000836 MYB_related XP_057772437.1 MP00568 TATGGATAAGGTTAT

可能结合的靶基因

9696 个结合位点 6611 个候选靶基因 第 43 / 133 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000153 Chr03 NC_080389.1:1652615-1652629promoter 内 2521-2535 bp - 1466 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 1654095-1654571(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTTACCTTATCCTTC
SmilChr02G002298 Chr02 NC_080388.1:40558318-40558332promoter 内 2510-2524 bp - 1477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 40559809-40561749(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CATTCCTTATCTTGT
SmilChr01G000232 Chr01 NC_080387.1:4388632-4388646promoter 内 2498-2512 bp + 1489 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 4385411-4387143(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATTCCTTATCTTAT
SmilChr01G003323 Chr01 NC_080387.1:51932163-51932177promoter 内 2371-2385 bp - 1616 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 51929249-51930547(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TACAGATAAGGTCAT
SmilChr02G002185 Chr02 NC_080388.1:39064731-39064745promoter 内 2347-2361 bp + 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 39059722-39063091(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATCAGCTTATCCTAA
SmilChr02G005066 Chr02 NC_080388.1:72337577-72337591promoter 内 2346-2360 bp - 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 72332754-72335936(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGGGATAAGAATGC
SmilChr01G005087 Chr01 NC_080387.1:68731861-68731875promoter 内 2201-2215 bp + 1786 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 68733661-68735754(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACTAGATAAGGATCT
SmilChr01G004403 Chr01 NC_080387.1:62145636-62145650promoter 内 2012-2026 bp - 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 62138438-62143661(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAGTATGA
SmilChr01G003092 Chr01 NC_080387.1:49732975-49732989promoter 内 1889-1903 bp - 2098 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 49735087-49740054(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTTACCTTATCCTTC
SmilChr02G004531 Chr02 NC_080388.1:67887338-67887352promoter 内 1855-1869 bp - 2132 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 67880377-67885206(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACGGGATAAGATGGT
SmilChr02G001516 Chr02 NC_080388.1:28277452-28277466promoter 内 1816-1830 bp + 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 28275200-28275281(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CATACCTTATCTGGA
SmilChr03G000253 Chr03 NC_080389.1:2997150-2997164promoter 内 1789-1803 bp - 2198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 2993546-2994952(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAAGAAGAC
SmilChr01G001794 Chr01 NC_080387.1:32810743-32810757promoter 内 1708-1722 bp - 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 32813036-32817226(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAGACCTTATCCTTG
SmilChr01G005571 Chr01 NC_080387.1:72476512-72476526promoter 内 1550-1564 bp + 2437 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 72478963-72481254(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGGGATAAGGCCGA
SmilChr03G000900 Chr03 NC_080389.1:10293972-10293986promoter 内 1520-1534 bp + 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 10290789-10291505(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTTACCTTATCCTTC
SmilChr02G000894 Chr02 NC_080388.1:15386389-15386403promoter 内 1360-1374 bp - 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 15389030-15392007(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAAATCTTATCCTAC
SmilChr02G003609 Chr02 NC_080388.1:57349341-57349355promoter 内 1353-1367 bp + 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 57340981-57346707(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAAATCTTATCCTAC
SmilChr02G003551 Chr02 NC_080388.1:56658777-56658791promoter 内 1288-1302 bp + 2699 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 56650319-56656078(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAAATCTTATCCTAC
SmilChr01G005086 Chr01 NC_080387.1:68731861-68731875promoter 内 1067-1081 bp + 2920 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 68727698-68728941(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGATCCTTATCTAGT
SmilChr01G003486 Chr01 NC_080387.1:53421119-53421133promoter 内 997-1011 bp + 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 53416969-53418129(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CATTCCTTATCCAAG
SmilChr02G000911 Chr02 NC_080388.1:15759575-15759589promoter 内 977-991 bp - 3010 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 15751612-15756565(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATGGATAAGTATGA
SmilChr02G002073 Chr02 NC_080388.1:37322899-37322913promoter 内 944-958 bp - 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 37325956-37330395(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTATGCTTATCCTCT
SmilChr02G005185 Chr02 NC_080388.1:73164782-73164796promoter 内 892-906 bp + 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 73167891-73170879(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTAGGATAAGATTTA
SmilChr02G002438 Chr02 NC_080388.1:42580921-42580935promoter 内 668-682 bp - 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 42584254-42587485(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTTACCTTATCCTTC
SmilChr02G001156 Chr02 NC_080388.1:21113022-21113036promoter 内 459-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 21105216-21109494(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGAAGATAAGGGGTG
SmilChr01G000609 Chr01 NC_080387.1:13466725-13466739promoter 内 361-375 bp - 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 13460631-13463099(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTAGGATAAGATTTA
SmilChr03G000242 Chr03 NC_080389.1:2861632-2861646promoter 内 28-42 bp + 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 2865605-2869423(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAGGATAAGAGATG
SmilChr02G001932 Chr02 NC_080388.1:34735317-34735331promoter 内 5-19 bp - 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 34739313-34740095(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCTCTCTTATCCAAA
SmilChr02G000185 Chr02 NC_080388.1:2337965-2337979promoter 内 3980-3994 bp + 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 2336804-2337958(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TACTTCTTATCCTTT
SmilChr02G004695 Chr02 NC_080388.1:69291192-69291206promoter 内 3887-3901 bp + 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 69290475-69291092(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GAACTCTTATCCAAT
SmilChr01G001473 Chr01 NC_080387.1:28492282-28492296promoter 内 3820-3834 bp - 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 28492463-28493845(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CATTCCTTATCCAAG
SmilChr02G000594 Chr02 NC_080388.1:8524805-8524819promoter 内 3677-3691 bp + 310 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 8523336-8524495(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTTTCCTTATCCTAC
SmilChr01G002087 Chr01 NC_080387.1:36856066-36856080promoter 内 3663-3677 bp - 324 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 36856404-36857548(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTTTCCTTATCCTAC
SmilChr01G002205 Chr01 NC_080387.1:38373998-38374012promoter 内 3645-3659 bp - 342 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 38374354-38376882(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATTCCTTATCTTAT
SmilChr01G000734 Chr01 NC_080387.1:16300266-16300280promoter 内 3410-3424 bp - 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16299172-16299689(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAAGATAAGGCAAA
SmilChr02G000996 Chr02 NC_080388.1:17495751-17495765promoter 内 3218-3232 bp - 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 17491781-17494982(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGAAGATAAGGGGTG
SmilChr01G002720 Chr01 NC_080387.1:45487543-45487557promoter 内 3125-3139 bp - 862 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 45484868-45486681(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAGGGATAAGACTTA
SmilChr02G004290 Chr02 NC_080388.1:65225804-65225818promoter 内 2945-2959 bp - 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 65223581-65224762(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CGAGGATAAGAATAA
SmilChr02G005018 Chr02 NC_080388.1:71958712-71958726promoter 内 2789-2803 bp + 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 71955985-71957514(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTTCCTTATCTCCT
SmilChr02G002659 Chr02 NC_080388.1:46021300-46021314promoter 内 2776-2790 bp - 1211 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 46018745-46020089(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GATGGATAAGAATAG
SmilChr01G000930 Chr01 NC_080387.1:19682394-19682408promoter 内 2750-2764 bp + 1237 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 19677595-19681157(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCACCCTTATCCTTC
SmilChr03G000389 Chr03 NC_080389.1:4299801-4299815promoter 内 2722-2736 bp - 1265 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 4297428-4298536(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTAGGATAAGATTTA
SmilChr02G001021 Chr02 NC_080388.1:18038722-18038736promoter 内 2646-2660 bp - 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 18031757-18037381(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGAAGATAAGGGAAA
SmilChr01G004446 Chr01 NC_080387.1:62567544-62567558promoter 内 2586-2600 bp - 1401 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 62568959-62571900(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAATCCTTATCCAGC
SmilChr01G002476 Chr01 NC_080387.1:42501862-42501876promoter 内 2508-2522 bp - 1479 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42503355-42505763(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CACCCCTTATCTTCT
SmilChr02G004231 Chr02 NC_080388.1:64503957-64503971promoter 内 2482-2496 bp + 1505 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 64501118-64502452(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTCCCTTATCCCTT
SmilChr01G002688 Chr01 NC_080387.1:45108443-45108457promoter 内 2460-2474 bp - 1527 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 45104700-45106916(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAGGATAAGCTGAT
SmilChr02G001221 Chr02 NC_080388.1:22409263-22409277promoter 内 2444-2458 bp + 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 22404995-22407720(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CATTCCTTATCCAAG
SmilChr02G004099 Chr02 NC_080388.1:63310348-63310362promoter 内 2400-2414 bp - 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 63302221-63308761(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGACCAA
SmilChr03G000165 Chr03 NC_080389.1:1817041-1817055promoter 内 2305-2319 bp - 1682 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1813038-1815359(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GGAGGATAAGGGTTT