转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 45 / 148 下载 TSV

上一页 45 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001422 Chr05 NC_080391.1:12898424-12898437promoter 内 375-388 bp + 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 12902050-12908325(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTCTGTCACGTGG
SmilChr02G002021 Chr02 NC_080388.1:36434180-36434193promoter 内 351-364 bp + 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 36437830-36440922(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTGGCGCACGTGG
SmilChr04G002096 Chr04 NC_080390.1:33792342-33792355promoter 内 294-307 bp + 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 33783651-33788648(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAGCTC
SmilChr02G004656 Chr02 NC_080388.1:68971637-68971650promoter 内 241-254 bp + 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 68975397-68976452(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTAGGGTCACGTGA
SmilChr08G001056 Chr08 NC_080394.1:8112804-8112817promoter 内 214-227 bp - 3774 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 8105688-8109030(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAAAGTCACGTGA
SmilChr02G002357 Chr02 NC_080388.1:41358108-41358121promoter 内 186-199 bp + 3802 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 41361923-41365429(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAAATTCACGTGG
SmilChr03G004005 Chr03 NC_080389.1:59080499-59080512promoter 内 75-88 bp + 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 59074223-59076586(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAATCT
SmilChr07G003867 Chr07 NC_080393.1:48132401-48132414promoter 内 12-25 bp - 3976 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 48136390-48137041(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGGCTTC
SmilChr07G002323 Chr07 NC_080393.1:21550347-21550360promoter 内 3628-3641 bp + 360 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 4 21550720-21552370(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGGCCTCACGTGA
SmilChr05G000051 Chr05 NC_080391.1:235730-235743promoter 内 2165-2178 bp + 1823 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 4 237566-239845(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr01G005972 Chr01 NC_080387.1:75399526-75399539promoter 内 3278-3291 bp + 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 75397096-75398816(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGGTACG
SmilChr02G004257 Chr02 NC_080388.1:64782038-64782051promoter 内 2892-2905 bp + 1096 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 64783147-64783219(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr04G000074 Chr04 NC_080390.1:690556-690569promoter 内 2685-2698 bp + 1303 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 691872-693812(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGATCGCCACGTGG
SmilChr01G002942 Chr01 NC_080387.1:48203809-48203822promoter 内 2404-2417 bp + 1584 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 48199708-48202225(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr05G002281 Chr05 NC_080391.1:24540202-24540215promoter 内 2097-2110 bp - 1891 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 24536172-24538311(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr03G000681 Chr03 NC_080389.1:7599703-7599716promoter 内 2092-2105 bp + 1896 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 7601612-7614503(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTGCCCCACGTGG
SmilChr07G000711 Chr07 NC_080393.1:4948128-4948141promoter 内 1785-1798 bp - 2203 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 4950344-4956140(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGCTTAT
SmilChr01G002148 Chr01 NC_080387.1:37472142-37472155promoter 内 1657-1670 bp + 2331 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 37474486-37476248(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATGTGACACGTGG
SmilChr05G000114 Chr05 NC_080391.1:800509-800522promoter 内 1248-1261 bp - 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 803262-807079(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr02G003911 Chr02 NC_080388.1:61203368-61203381promoter 内 700-713 bp - 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 61195543-61200080(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr02G000129 Chr02 NC_080388.1:1751046-1751059promoter 内 638-651 bp + 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 1754409-1755279(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGGTACCACGTGG
SmilChr05G002626 Chr05 NC_080391.1:29602903-29602916promoter 内 228-241 bp + 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 29606676-29609330(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr02G002486 Chr02 NC_080388.1:43278682-43278695promoter 内 35-48 bp + 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 43282648-43284698(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr02G001868 Chr02 NC_080388.1:33964299-33964312promoter 内 26-39 bp + 3962 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 33959567-33960337(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCAAGCA
SmilChr01G005280 Chr01 NC_080387.1:70200614-70200627promoter 内 3967-3980 bp + 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 70200648-70203983(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCGTGTCACGTGA
SmilChr03G003823 Chr03 NC_080389.1:57277470-57277483promoter 内 3927-3940 bp - 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 57274381-57277409(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr07G003664 Chr07 NC_080393.1:43831594-43831607promoter 内 3894-3907 bp + 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 43825772-43831500(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGATACC
SmilChr02G003331 Chr02 NC_080388.1:54557965-54557978promoter 内 3884-3897 bp - 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 54556216-54557861(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr05G002963 Chr05 NC_080391.1:35823539-35823552promoter 内 3876-3889 bp + 112 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 35823664-35826068(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr08G000737 Chr08 NC_080394.1:5465106-5465119promoter 内 3794-3807 bp - 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 5458776-5464912(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr06G001116 Chr06 NC_080392.1:11232534-11232547promoter 内 3727-3740 bp + 261 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 11232808-11234860(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr02G001002 Chr02 NC_080388.1:17652803-17652816promoter 内 3723-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 17648870-17652538(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr02G005391 Chr02 NC_080388.1:74529521-74529534promoter 内 3701-3714 bp + 287 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 74529821-74531940(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr04G001732 Chr04 NC_080390.1:28561275-28561288promoter 内 3687-3700 bp + 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 28558171-28560974(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr07G003267 Chr07 NC_080393.1:34435347-34435360promoter 内 3648-3661 bp - 340 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 34430184-34435007(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr01G006035 Chr01 NC_080387.1:75869534-75869547promoter 内 3627-3640 bp + 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 75867731-75869173(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr07G002562 Chr07 NC_080393.1:24352656-24352669promoter 内 3616-3629 bp + 372 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 24353041-24381863(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr06G002433 Chr06 NC_080392.1:35084869-35084882promoter 内 3556-3569 bp + 432 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 35085314-35086734(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr02G004259 Chr02 NC_080388.1:64805693-64805706promoter 内 3522-3535 bp - 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 64803428-64805227(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr02G001960 Chr02 NC_080388.1:35388021-35388034promoter 内 3393-3406 bp + 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 35386959-35387426(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACACCTG
SmilChr01G002214 Chr01 NC_080387.1:38481043-38481056promoter 内 3211-3224 bp + 777 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 38481833-38482558(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr04G000058 Chr04 NC_080390.1:525322-525335promoter 内 3185-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 526138-528555(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr08G001077 Chr08 NC_080394.1:8289876-8289889promoter 内 3163-3176 bp - 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 8287658-8289051(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr05G000267 Chr05 NC_080391.1:2029859-2029872promoter 内 3077-3090 bp - 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 2030783-2033065(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTCTAC
SmilChr02G000090 Chr02 NC_080388.1:1164386-1164399promoter 内 3005-3018 bp - 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 1165382-1170075(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTACCCC
SmilChr07G002561 Chr07 NC_080393.1:24352357-24352370promoter 内 2937-2950 bp - 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 24349118-24351306(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr05G001305 Chr05 NC_080391.1:11268406-11268419promoter 内 2869-2882 bp - 1119 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 11257937-11267287(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr05G000532 Chr05 NC_080391.1:4074683-4074696promoter 内 2834-2847 bp + 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 4072232-4073529(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACATGAA
SmilChr05G001666 Chr05 NC_080391.1:15791882-15791895promoter 内 2632-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 15789540-15790526(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CACGGGTCACGTGA
SmilChr05G001648 Chr05 NC_080391.1:15473914-15473927promoter 内 2621-2634 bp + 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 15475294-15477816(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG