转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 47 / 143 下载 TSV

上一页 47 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000740 Chr05 NC_080391.1:5636100-5636111promoter 内 681-692 bp + 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 5639420-5641091(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAA
SmilChr05G002851 Chr05 NC_080391.1:34002673-34002684promoter 内 592-603 bp + 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 34006082-34007875(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTCCAGCTGTG
SmilChr07G000396 Chr07 NC_080393.1:2741090-2741101promoter 内 555-566 bp - 3435 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 2736649-2737655(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTA
SmilChr03G001075 Chr03 NC_080389.1:12456299-12456310promoter 内 454-465 bp + 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 12459846-12461298(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCAA
SmilChr02G004999 Chr02 NC_080388.1:71816503-71816514promoter 内 446-457 bp + 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 71810471-71812959(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAGA
SmilChr01G002135 Chr01 NC_080387.1:37338041-37338052promoter 内 3963-3974 bp + 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 37338079-37338807(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTG
SmilChr02G001837 Chr02 NC_080388.1:33473860-33473871promoter 内 3611-3622 bp - 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 33471214-33473481(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTG
SmilChr07G000441 Chr07 NC_080393.1:3086661-3086672promoter 内 3565-3576 bp - 425 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 3083628-3086236(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGAG
SmilChr07G000906 Chr07 NC_080393.1:6477268-6477279promoter 内 3471-3482 bp + 519 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 6477798-6479724(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCAA
SmilChr03G001175 Chr03 NC_080389.1:13507173-13507184promoter 内 3356-3367 bp - 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 13505637-13506539(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCGT
SmilChr03G000624 Chr03 NC_080389.1:6929069-6929080promoter 内 3353-3364 bp + 637 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 6929717-6930621(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCGT
SmilChr03G002147 Chr03 NC_080389.1:33407625-33407636promoter 内 3303-3314 bp - 687 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 33406591-33406938(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTCCAGCTGTG
SmilChr07G003774 Chr07 NC_080393.1:46222625-46222636promoter 内 3266-3277 bp + 724 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 46223360-46224505(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGAT
SmilChr01G002614 Chr01 NC_080387.1:44409974-44409985promoter 内 3143-3154 bp + 847 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 44406689-44409127(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTT
SmilChr01G000418 Chr01 NC_080387.1:8435666-8435677promoter 内 3064-3075 bp - 926 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 8436603-8437870(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCGC
SmilChr08G000506 Chr08 NC_080394.1:3700973-3700984promoter 内 2974-2985 bp - 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 3702000-3704368(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTT
SmilChr08G002170 Chr08 NC_080394.1:19626804-19626815promoter 内 2872-2883 bp + 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 19627933-19630021(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAA
SmilChr05G004133 Chr05 NC_080391.1:55325478-55325489promoter 内 2736-2747 bp - 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 55309027-55324224(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCAA
SmilChr01G000346 Chr01 NC_080387.1:7058487-7058498promoter 内 2724-2735 bp + 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 7059764-7061098(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTATC
SmilChr08G001215 Chr08 NC_080394.1:9808336-9808347promoter 内 2653-2664 bp + 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 9809684-9817763(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTAGC
SmilChr04G001096 Chr04 NC_080390.1:15681404-15681415promoter 内 2624-2635 bp + 1366 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 15677664-15680038(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTT
SmilChr05G000767 Chr05 NC_080391.1:5965203-5965214promoter 内 2531-2542 bp + 1459 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 5962653-5963744(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCGG
SmilChr06G001218 Chr06 NC_080392.1:12566213-12566224promoter 内 2307-2318 bp - 1683 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 12562911-12564530(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTAGC
SmilChr06G002476 Chr06 NC_080392.1:35600635-35600646promoter 内 2243-2254 bp + 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 35593717-35598888(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGA
SmilChr01G000417 Chr01 NC_080387.1:8435666-8435677promoter 内 2153-2164 bp - 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 8432765-8433829(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTATC
SmilChr08G003734 Chr08 NC_080394.1:42207614-42207625promoter 内 2092-2103 bp + 1898 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 42202374-42205716(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAG
SmilChr04G001064 Chr04 NC_080390.1:15215688-15215699promoter 内 1915-1926 bp - 2075 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 15217774-15219364(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGA
SmilChr07G003149 Chr07 NC_080393.1:33401342-33401353promoter 内 1862-1873 bp + 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 33389761-33399214(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAG
SmilChr03G002886 Chr03 NC_080389.1:45521361-45521372promoter 内 1847-1858 bp + 2143 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 45518729-45519218(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTT
SmilChr01G001928 Chr01 NC_080387.1:34453500-34453511promoter 内 1840-1851 bp - 2150 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 34449221-34451350(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAA
SmilChr05G002953 Chr05 NC_080391.1:35684042-35684053promoter 内 1816-1827 bp - 2174 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 35680942-35681868(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTCCAGCTGTG
SmilChr06G000015 Chr06 NC_080392.1:234779-234790promoter 内 1794-1805 bp - 2196 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 236986-242359(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAT
SmilChr07G003130 Chr07 NC_080393.1:33220058-33220069promoter 内 1778-1789 bp + 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 33208466-33217846(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAG
SmilChr04G001973 Chr04 NC_080390.1:31965230-31965241promoter 内 1751-1762 bp + 2239 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 31957767-31962991(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAT
SmilChr07G003730 Chr07 NC_080393.1:45305520-45305531promoter 内 1716-1727 bp - 2274 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 45307805-45310101(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAG
SmilChr05G003885 Chr05 NC_080391.1:52598617-52598628promoter 内 1658-1669 bp - 2332 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 52600960-52603911(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCTC
SmilChr01G001929 Chr01 NC_080387.1:34453500-34453511promoter 内 1604-1615 bp - 2386 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 34455897-34457066(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTT
SmilChr05G003612 Chr05 NC_080391.1:48197059-48197070promoter 内 1488-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 48199572-48200633(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTCCAGCTGTG
SmilChr01G002134 Chr01 NC_080387.1:37338041-37338052promoter 内 1342-1353 bp + 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 37333668-37335393(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGA
SmilChr08G003066 Chr08 NC_080394.1:30847918-30847929promoter 内 1340-1351 bp + 2650 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 30850579-30855040(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTCCAGCTGTG
SmilChr06G000603 Chr06 NC_080392.1:5207727-5207738promoter 内 1241-1252 bp - 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 5210487-5211606(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTT
SmilChr05G003084 Chr05 NC_080391.1:39025668-39025679promoter 内 1238-1249 bp + 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 39028431-39029726(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTATC
SmilChr03G002554 Chr03 NC_080389.1:40723075-40723086promoter 内 1223-1234 bp + 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 40717137-40720308(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTT
SmilChr06G002028 Chr06 NC_080392.1:26384993-26385004promoter 内 1182-1193 bp - 2808 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 26387812-26395588(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGA
SmilChr08G000408 Chr08 NC_080394.1:2857761-2857772promoter 内 1102-1113 bp - 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 2860660-2864651(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGA
SmilChr05G000225 Chr05 NC_080391.1:1765138-1765149promoter 内 638-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 1758643-1761786(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAA
SmilChr06G001496 Chr06 NC_080392.1:16014447-16014458promoter 内 526-537 bp + 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 16010690-16010983(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAG
SmilChr06G002968 Chr06 NC_080392.1:42506254-42506265promoter 内 450-461 bp + 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 42509805-42513346(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCGT
SmilChr06G002692 Chr06 NC_080392.1:38847658-38847669promoter 内 425-436 bp - 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 38833658-38844093(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTG
SmilChr08G003229 Chr08 NC_080394.1:33226016-33226027promoter 内 360-371 bp + 3630 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 33221595-33222386(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCTT