转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 58 / 130 下载 TSV

上一页 58 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004407 Chr01 NC_080387.1:62160375-62160387promoter 内 291-303 bp + 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 62164085-62166532(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTTGGAATATTCA
SmilChr02G000972 Chr02 NC_080388.1:17012255-17012267promoter 内 278-290 bp + 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 17015978-17017336(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAAGAATATCCA
SmilChr02G000971 Chr02 NC_080388.1:17012255-17012267promoter 内 195-207 bp + 3794 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 17005463-17008461(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGGATATTCTTCT
SmilChr01G004208 Chr01 NC_080387.1:60520514-60520526promoter 内 147-159 bp - 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 60524368-60527197(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAATATTCCCTT
SmilChr03G001279 Chr03 NC_080389.1:14979587-14979599promoter 内 55-67 bp - 3934 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 14973411-14975653(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGAGAATATTAC
SmilChr01G005783 Chr01 NC_080387.1:73940426-73940438promoter 内 40-52 bp + 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 73928699-73936477(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCGTAA
SmilChr02G005309 Chr02 NC_080388.1:73992879-73992891promoter 内 1127-1139 bp - 2862 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 5 73995753-73997638(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCTATT
SmilChr02G001376 Chr02 NC_080388.1:26026977-26026989promoter 内 449-461 bp - 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 4 26030529-26038866(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATATATTCTCTT
SmilChr01G004398 Chr01 NC_080387.1:62118538-62118550promoter 内 3602-3614 bp - 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 62118937-62120651(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CTAATATTCCTTC
SmilChr02G005102 Chr02 NC_080388.1:72563869-72563881promoter 内 3477-3489 bp + 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 72561030-72563357(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTATA
SmilChr02G003201 Chr02 NC_080388.1:53171686-53171698promoter 内 2939-2951 bp + 1050 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 53167782-53170636(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGATATTCTTGC
SmilChr03G000837 Chr03 NC_080389.1:9584146-9584158promoter 内 2881-2893 bp + 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 9585266-9586500(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CACAGAATATGCG
SmilChr03G000529 Chr03 NC_080389.1:5655042-5655054promoter 内 2875-2887 bp - 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 5653067-5653928(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CACAGAATATGCG
SmilChr02G002149 Chr02 NC_080388.1:38669348-38669360promoter 内 1647-1659 bp + 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 38671702-38672587(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAAGAATATACA
SmilChr03G002204 Chr03 NC_080389.1:34686643-34686655promoter 内 1538-1550 bp + 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 34689106-34692549(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAGGAATATTAG
SmilChr02G003492 Chr02 NC_080388.1:56160293-56160305promoter 内 1208-1220 bp - 2781 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 56163086-56165043(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCCTAC
SmilChr02G003490 Chr02 NC_080388.1:56160293-56160305promoter 内 90-102 bp - 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 56152577-56156394(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAGGAATATTTG
SmilChr01G005501 Chr01 NC_080387.1:71891197-71891209promoter 内 3765-3777 bp - 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 71891433-71893414(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTGAG
SmilChr02G002957 Chr02 NC_080388.1:50101266-50101278promoter 内 3686-3698 bp - 303 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 50101581-50105146(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CTAATATTCCTCT
SmilChr02G002902 Chr02 NC_080388.1:49335074-49335086promoter 内 3672-3684 bp + 317 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 49331026-49334757(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CTAATATTCCTCT
SmilChr01G000450 Chr01 NC_080387.1:9172200-9172212promoter 内 3577-3589 bp - 412 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 9172624-9187531(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCTTTG
SmilChr03G000956 Chr03 NC_080389.1:10808663-10808675promoter 内 3477-3489 bp + 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 10809187-10810392(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CACAGAATATGCG
SmilChr03G000387 Chr03 NC_080389.1:4291583-4291595promoter 内 3258-3270 bp + 731 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 4292326-4293199(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CACAGAATATGCG
SmilChr03G001956 Chr03 NC_080389.1:27966439-27966451promoter 内 3114-3126 bp - 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 27967326-27967778(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTCGT
SmilChr01G001935 Chr01 NC_080387.1:34547305-34547317promoter 内 3085-3097 bp + 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 34548221-34549926(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GCAAGAATATACT
SmilChr02G003436 Chr02 NC_080388.1:55597637-55597649promoter 内 2967-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 55589245-55596615(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCATATTCTCTG
SmilChr03G001955 Chr03 NC_080389.1:27966439-27966451promoter 内 2807-2819 bp - 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 27951797-27965257(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ACGAGAATATTCA
SmilChr01G003858 Chr01 NC_080387.1:56855164-56855176promoter 内 2614-2626 bp - 1375 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 56856551-56860208(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCTATT
SmilChr03G000957 Chr03 NC_080389.1:10808663-10808675promoter 内 2557-2569 bp + 1432 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 10810107-10812420(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CACAGAATATGCG
SmilChr02G002184 Chr02 NC_080388.1:39060341-39060353promoter 内 2521-2533 bp - 1468 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 39057442-39058873(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ACCAGAATATGCC
SmilChr01G002797 Chr01 NC_080387.1:46462983-46462995promoter 内 2474-2486 bp + 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 46458193-46461468(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTCGT
SmilChr01G000797 Chr01 NC_080387.1:17238737-17238749promoter 内 2284-2296 bp + 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 17235549-17237032(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCTATT
SmilChr01G006059 Chr01 NC_080387.1:76040385-76040397promoter 内 1723-1735 bp - 2266 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 76042663-76046903(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGTATATTCTTCT
SmilChr02G002719 Chr02 NC_080388.1:47025597-47025609promoter 内 1368-1380 bp - 2621 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 47028230-47030533(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATATATTCTCTT
SmilChr02G002186 Chr02 NC_080388.1:39060341-39060353promoter 内 1267-1279 bp - 2722 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 39063075-39063960(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGCATATTCTGGT
SmilChr01G000527 Chr01 NC_080387.1:10751280-10751292promoter 内 707-719 bp - 3282 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 10744899-10747998(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAGAGAATATGCT
SmilChr01G001822 Chr01 NC_080387.1:33169098-33169110promoter 内 620-632 bp + 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 33172479-33173986(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGTGGAATATTCA
SmilChr03G001441 Chr03 NC_080389.1:17149056-17149068promoter 内 535-547 bp - 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 17144939-17145602(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TCCAGAATATACC
SmilChr01G001698 Chr01 NC_080387.1:31268583-31268595promoter 内 524-536 bp - 3465 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 31262793-31265118(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAAGAATATACA
SmilChr01G005118 Chr01 NC_080387.1:68981945-68981957promoter 内 409-421 bp + 3580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 68977183-68978365(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTATATTCTAGC
SmilChr01G004034 Chr01 NC_080387.1:58766810-58766822promoter 内 314-326 bp - 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 58770497-58773294(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTGCA
SmilChr01G005621 Chr01 NC_080387.1:72699935-72699947promoter 内 172-184 bp + 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 72703764-72706336(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATATC
SmilChr02G003302 Chr02 NC_080388.1:54293118-54293130promoter 内 140-152 bp + 3849 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 54296979-54300177(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATAGAATATTTG
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SmilChr01G003018 Chr01 NC_080387.1:49207546-49207558promoter 内 3566-3578 bp - 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 49203621-49207123(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ACAAGAATATTTC