转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G003441; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00014538-RA_Salv SmilChr07G003441 NAC XP_057773618.1 MP00108 TTAAGTAAT

可能结合的靶基因

9810 个结合位点 6458 个候选靶基因 第 6 / 130 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004975 Chr01 NC_080387.1:67824341-67824349promoter 内 2031-2039 bp + 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 67826311-67826811(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G005254 Chr02 NC_080388.1:73664154-73664162promoter 内 2014-2022 bp + 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 73660139-73662175(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr03G000658 Chr03 NC_080389.1:7343648-7343656promoter 内 2008-2016 bp - 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 7340706-7341663(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G003091 Chr01 NC_080387.1:49722676-49722684promoter 内 2005-2013 bp + 1988 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 49724672-49735047(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G000274 Chr01 NC_080387.1:5452251-5452259promoter 内 1986-1994 bp - 2007 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 5449121-5450244(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G000769 Chr02 NC_080388.1:12673224-12673232promoter 内 1967-1975 bp + 2026 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 12669360-12671198(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G000795 Chr01 NC_080387.1:17230022-17230030promoter 内 1958-1966 bp - 2035 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 17225327-17227987(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G003364 Chr01 NC_080387.1:52390002-52390010promoter 内 1943-1951 bp + 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 52385154-52387952(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G005401 Chr02 NC_080388.1:74564736-74564744promoter 内 1933-1941 bp + 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 74566804-74569571(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G005412 Chr02 NC_080388.1:74600928-74600936promoter 内 1933-1941 bp + 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 74602996-74605763(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G001905 Chr02 NC_080388.1:34349576-34349584promoter 内 1913-1921 bp + 2080 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 34345531-34347496(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G001032 Chr01 NC_080387.1:21479322-21479330promoter 内 1879-1887 bp - 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 21476350-21477208(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G004690 Chr02 NC_080388.1:69236664-69236672promoter 内 1858-1866 bp - 2135 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 69212465-69234529(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr03G000335 Chr03 NC_080389.1:3814283-3814291promoter 内 1819-1827 bp + 2174 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 3797148-3812109(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr03G000282 Chr03 NC_080389.1:3239287-3239295promoter 内 1743-1751 bp + 2250 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 3207949-3237037(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G005636 Chr01 NC_080387.1:72800936-72800944promoter 内 1726-1734 bp - 2267 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 72796920-72798669(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr03G000094 Chr03 NC_080389.1:1055266-1055274promoter 内 1684-1692 bp + 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 1041581-1052957(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G001458 Chr02 NC_080388.1:27267508-27267516promoter 内 1652-1660 bp + 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 27269857-27271157(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G005506 Chr02 NC_080388.1:75183237-75183245promoter 内 1611-1619 bp + 2382 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 75185627-75191607(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G000771 Chr02 NC_080388.1:12674492-12674500promoter 内 1583-1591 bp + 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 12676910-12678427(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G000936 Chr01 NC_080387.1:19834142-19834150promoter 内 1580-1588 bp + 2413 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 19836563-19837390(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G001711 Chr02 NC_080388.1:31504468-31504476promoter 内 1573-1581 bp + 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 31506896-31507943(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G001816 Chr02 NC_080388.1:33026732-33026740promoter 内 1503-1511 bp - 2490 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 33020235-33024242(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G005358 Chr01 NC_080387.1:70799269-70799277promoter 内 1462-1470 bp + 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 70801808-70804098(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G004919 Chr01 NC_080387.1:67274447-67274455promoter 内 1453-1461 bp + 2540 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 67276995-67278442(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G000701 Chr01 NC_080387.1:15737765-15737773promoter 内 1441-1449 bp - 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 15740325-15742184(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G006181 Chr01 NC_080387.1:77334055-77334063promoter 内 1413-1421 bp - 2580 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 77336643-77337334(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G001383 Chr02 NC_080388.1:26235900-26235908promoter 内 1408-1416 bp + 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 26190173-26233315(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G005682 Chr01 NC_080387.1:73089706-73089714promoter 内 1390-1398 bp - 2603 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 73086236-73087103(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G003762 Chr01 NC_080387.1:56015832-56015840promoter 内 1377-1385 bp + 2616 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 56009360-56013216(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G004922 Chr01 NC_080387.1:67301235-67301243promoter 内 1334-1342 bp - 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 67303902-67303973(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G001281 Chr01 NC_080387.1:25594109-25594117promoter 内 1329-1337 bp - 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 25596781-25598648(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G002259 Chr02 NC_080388.1:40027958-40027966promoter 内 1329-1337 bp + 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 40022937-40025294(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G000926 Chr02 NC_080388.1:16100608-16100616promoter 内 1313-1321 bp + 2680 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 16103296-16108705(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G002300 Chr02 NC_080388.1:40599293-40599301promoter 内 1308-1316 bp + 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 40589959-40596608(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G005551 Chr01 NC_080387.1:72347163-72347171promoter 内 1195-1203 bp + 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 3 72349969-72353145(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
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