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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004246; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021799-RA_Salv SmilChr08G004246 WRKY XP_057780410.1 MP00422 AAAAGTCAACGAT

可能结合的靶基因

9791 个结合位点 6535 个候选靶基因 第 6 / 131 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001498 Chr03 NC_080389.1:18316670-18316682promoter 内 3786-3798 bp + 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 18313625-18316467(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATAGTTGACTTTG
SmilChr03G001398 Chr03 NC_080389.1:16600615-16600627promoter 内 3279-3291 bp + 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 16601337-16604106(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GAAAGTCAACTGC
SmilChr02G001708 Chr02 NC_080388.1:31430607-31430619promoter 内 3224-3236 bp - 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 31428694-31429842(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGAAGTCAACGTC
SmilChr01G003786 Chr01 NC_080387.1:56257185-56257197promoter 内 2858-2870 bp - 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 56258328-56262030(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGCGTTGACTTAT
SmilChr02G001873 Chr02 NC_080388.1:34015164-34015176promoter 内 2854-2866 bp - 1135 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 34016311-34021212(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGCGTTGACTTAT
SmilChr01G000431 Chr01 NC_080387.1:8601321-8601333promoter 内 2757-2769 bp - 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 8602565-8606366(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGCGTTGACTTAT
SmilChr02G001182 Chr02 NC_080388.1:21732331-21732343promoter 内 2731-2743 bp - 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 21733601-21734524(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGCGTTGACTTGT
SmilChr02G003266 Chr02 NC_080388.1:53929498-53929510promoter 内 2721-2733 bp - 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 53930778-53932551(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGCGTTGACTTAT
SmilChr01G003384 Chr01 NC_080387.1:52525963-52525975promoter 内 2676-2688 bp + 1313 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 52521412-52524650(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGCGTTGACTTAT
SmilChr02G000582 Chr02 NC_080388.1:8381009-8381021promoter 内 2309-2321 bp + 1680 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 8382701-8383882(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ACAAGTCAACGCT
SmilChr03G001951 Chr03 NC_080389.1:27829016-27829028promoter 内 2245-2257 bp - 1744 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 27830772-27838316(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGCGTTGACTTGT
SmilChr01G003966 Chr01 NC_080387.1:58098467-58098479promoter 内 1829-1841 bp + 2160 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 58100639-58105464(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAACTGG
SmilChr01G000231 Chr01 NC_080387.1:4289677-4289689promoter 内 1520-1532 bp + 2469 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 4286721-4287208(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATAGTTGACTTTG
SmilChr02G002176 Chr02 NC_080388.1:38987115-38987127promoter 内 1059-1071 bp + 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 38980129-38984185(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGCGTTGACTTAT
SmilChr03G001549 Chr03 NC_080389.1:19542628-19542640promoter 内 506-518 bp - 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 19536479-19539145(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATAAGTCAACGCT
SmilChr02G003577 Chr02 NC_080388.1:56943832-56943844promoter 内 486-498 bp + 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 56939348-56940329(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGCGTTGACTTAT
SmilChr01G001094 Chr01 NC_080387.1:22390272-22390284promoter 内 253-265 bp + 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 22386464-22386536(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATAGTTGACTTTG
SmilChr01G002437 Chr01 NC_080387.1:41965219-41965231promoter 内 2105-2117 bp - 1884 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 41959720-41963335(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAACCAT
SmilChr02G002704 Chr02 NC_080388.1:46888813-46888825promoter 内 2871-2883 bp + 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 46882839-46887695(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CGCGTTGACTTCT
SmilChr02G001608 Chr02 NC_080388.1:29948924-29948936promoter 内 1576-1588 bp + 2413 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 4 29944973-29946511(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GAAGTTGACTTTG
SmilChr01G005738 Chr01 NC_080387.1:73504289-73504301promoter 内 1063-1075 bp - 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 73507227-73507982(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TCCGTTGACTTCT
SmilChr01G005736 Chr01 NC_080387.1:73488821-73488833promoter 内 3597-3609 bp - 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 73489225-73490124(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TCCGTTGACTTCT
SmilChr03G001170 Chr03 NC_080389.1:13457456-13457468promoter 内 2185-2197 bp - 1804 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 13459272-13460810(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ACCGTTGACTATT
SmilChr01G001103 Chr01 NC_080387.1:22579507-22579519promoter 内 950-962 bp + 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 22569983-22576468(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CCCGTTGACCTTT
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SmilChr01G002513 Chr01 NC_080387.1:43053308-43053320promoter 内 2937-2949 bp - 1052 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 43054372-43064125(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGCGTTGACTTCC
SmilChr01G004986 Chr01 NC_080387.1:67908717-67908729promoter 内 2849-2861 bp - 1140 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 67909869-67912819(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GAGGTTGACTTTT
SmilChr02G000234 Chr02 NC_080388.1:3014264-3014276promoter 内 2404-2416 bp + 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 3011464-3012679(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TCCGTTGACCTTT
SmilChr02G003402 Chr02 NC_080388.1:55163602-55163614promoter 内 2031-2043 bp - 1958 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 55165572-55168835(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GTCGTTGACCTTG
SmilChr01G000065 Chr01 NC_080387.1:1093788-1093800promoter 内 1791-1803 bp - 2198 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 1072493-1091590(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAGGTCAACGGG
SmilChr02G004268 Chr02 NC_080388.1:64885102-64885114promoter 内 1260-1272 bp - 2729 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 64887843-64905621(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CCCGTTGACCTTT
SmilChr01G003248 Chr01 NC_080387.1:51210929-51210941promoter 内 1141-1153 bp - 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 51205715-51208081(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CAAAGTCAACTTC
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SmilChr02G000233 Chr02 NC_080388.1:3014264-3014276promoter 内 213-225 bp + 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 3006992-3010488(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TCCGTTGACCTTT
SmilChr01G004434 Chr01 NC_080387.1:62429492-62429504promoter 内 8-20 bp + 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 62433485-62434688(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGAAGTCAACGGA
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SmilChr01G004931 Chr01 NC_080387.1:67364897-67364909promoter 内 2246-2258 bp - 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 67366652-67368209(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAGTTGACTTTG
SmilChr03G001147 Chr03 NC_080389.1:13227493-13227505promoter 内 1062-1074 bp - 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 13222908-13224566(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CAAAGTCAACTTT
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SmilChr01G004788 Chr01 NC_080387.1:66105251-66105263promoter 内 1845-1857 bp - 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 66107407-66110445(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCGTTGACTTCG
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SmilChr02G004754 Chr02 NC_080388.1:69724308-69724320promoter 内 681-693 bp + 3308 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 69727628-69728425(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CAAAGTCAACTTT
SmilChr01G002907 Chr01 NC_080387.1:47788575-47788587promoter 内 338-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 47792238-47793432(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAGTTGACTTTG
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SmilChr01G004542 Chr01 NC_080387.1:63568884-63568896promoter 内 1757-1769 bp + 2232 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 63571128-63574750(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CAAAGTCAACTTT